More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0026 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0026  malonate decarboxylase subunit beta  100 
 
 
310 aa  611  1e-174  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.840906  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0027  malonate decarboxylase subunit beta  98.39 
 
 
310 aa  598  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0048  malonate decarboxylase subunit beta  93.55 
 
 
310 aa  546  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179733  normal  0.0754943 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6855  malonate decarboxylase subunit beta  87.74 
 
 
306 aa  503  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3153  malonate decarboxylase subunit beta  87.74 
 
 
306 aa  503  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0169  malonate decarboxylase subunit beta  80.81 
 
 
309 aa  455  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.262822  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1243  malonate decarboxylase subunit beta  71.79 
 
 
311 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522948  normal  0.0801604 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4414  malonate decarboxylase subunit beta  71.71 
 
 
334 aa  399  1e-110  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.671916  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1271  malonate decarboxylase subunit beta  73.15 
 
 
309 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00826271  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0790  malonate decarboxylase subunit beta  73.15 
 
 
309 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.052226  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1161  malonate decarboxylase subunit beta  71.38 
 
 
307 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3190  malonate decarboxylase subunit beta  69.8 
 
 
309 aa  381  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.409108 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1149  malonate decarboxylase subunit beta  71.29 
 
 
311 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.571735  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2048  malonate decarboxylase subunit beta  70.42 
 
 
310 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4288  malonate decarboxylase subunit beta  70.33 
 
 
302 aa  353  2e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.49827  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1484  malonate decarboxylase subunit beta  67.11 
 
 
315 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3035  malonate decarboxylase subunit beta  67.11 
 
 
315 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1258  malonate decarboxylase subunit beta  67.11 
 
 
315 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.309742  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1454  malonate decarboxylase subunit beta  67.11 
 
 
315 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0601121  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0541  malonate decarboxylase subunit beta  67.11 
 
 
315 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0612  malonate decarboxylase subunit beta  67.11 
 
 
315 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.241216  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1584  malonate decarboxylase subunit beta  67.11 
 
 
315 aa  332  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554096  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4018  malonate decarboxylase subunit beta  58.54 
 
 
300 aa  330  2e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2801  malonate decarboxylase subunit beta  63.64 
 
 
315 aa  323  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.546817  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1845  malonate decarboxylase subunit beta  56.49 
 
 
295 aa  322  5e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1079  malonate decarboxylase subunit beta  57.19 
 
 
302 aa  313  3e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2894  acetyl-CoA carboxylase beta subunit  54.58 
 
 
297 aa  307  1e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.25289  normal  0.033715 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0792  beta subunit of malonate decarboxylase  54.42 
 
 
311 aa  295  5e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0446247  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5372  malonate decarboxylase subunit beta  54.84 
 
 
292 aa  272  4e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00542603  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0077  malonate decarboxylase subunit beta  53.33 
 
 
300 aa  258  9e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.405933 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2893  malonate decarboxylase subunit beta  53.85 
 
 
291 aa  256  3e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.605124  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1766  malonate decarboxylase subunit beta  51.57 
 
 
305 aa  254  2e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38997  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1144  malonate decarboxylase subunit beta  43.53 
 
 
295 aa  239  4e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.431032  normal  0.55922 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3296  malonate decarboxylase subunit beta  41.5 
 
 
318 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.966194 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1059  malonate decarboxylase subunit beta  42.62 
 
 
318 aa  208  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.246574  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1324  malonate decarboxylase subunit beta  43.38 
 
 
318 aa  206  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2494  malonate decarboxylase subunit beta  41.35 
 
 
398 aa  203  4e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0949  malonate decarboxylase subunit beta  46.98 
 
 
292 aa  191  9e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336349  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5084  malonate decarboxylase, beta subunit  47.77 
 
 
283 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5084  malonate decarboxylase subunit beta  45.27 
 
 
296 aa  186  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297024  normal  0.137892 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0445  malonate decarboxylase subunit beta  48.66 
 
 
283 aa  183  4e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3657  Acetyl-CoA carboxylase beta subunit-like protein  41.13 
 
 
380 aa  179  7e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1847  malonate decarboxylase subunit beta  42.7 
 
 
300 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.5038  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4818  malonate decarboxylase subunit beta  46.98 
 
 
294 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.049139  normal  0.0262322 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2441  malonate decarboxylase subunit beta  43.28 
 
 
282 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139783  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4942  malonate decarboxylase subunit beta  44.74 
 
 
281 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0873068 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3866  malonate decarboxylase subunit beta  44.74 
 
 
281 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10310  malonate decarboxylase subunit beta  45.37 
 
 
283 aa  174  1e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00325574  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2880  malonate decarboxylase subunit beta  43.63 
 
 
282 aa  174  2e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4590  malonate decarboxylase subunit beta  42.54 
 
 
290 aa  167  3e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4928  malonate decarboxylase subunit beta  43.95 
 
 
286 aa  165  1e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3776  malonate decarboxylase subunit beta  44.21 
 
 
277 aa  159  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0115571 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02580  malonate decarboxylase subunit beta  42.05 
 
 
287 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0046071  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0295  malonate decarboxylase subunit beta  43.53 
 
 
287 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.354415  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5299  malonate decarboxylase subunit beta  44.02 
 
 
283 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2609  malonate decarboxylase subunit beta  44.3 
 
 
277 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.17179  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1244  malonate decarboxylase subunit beta  41.25 
 
 
277 aa  153  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2471  malonate decarboxylase gamma subunit  39.13 
 
 
499 aa  142  9e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.719653  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  36.07 
 
 
542 aa  83.2  5e-15  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0850  carboxyl transferase  35.58 
 
 
526 aa  82  1e-14  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000103034  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1152  carboxyl transferase  35.52 
 
 
529 aa  80.1  4e-14  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579492  normal  0.513821 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  35.16 
 
 
536 aa  79.7  6e-14  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2437  propionyl-CoA carboxylase  35.29 
 
 
477 aa  79.3  8e-14  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  5.06601e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  31.37 
 
 
530 aa  79.3  8e-14  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25440  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  31.08 
 
 
532 aa  79  9e-14  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199435  normal  0.360386 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  30.2 
 
 
546 aa  78.6  1e-13  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.35884 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  31.78 
 
 
541 aa  78.6  1e-13  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1021  carboxyl transferase  32.09 
 
 
531 aa  79  1e-13  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  33.89 
 
 
534 aa  77  3e-13  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  34.97 
 
 
524 aa  75.9  7e-13  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  33.65 
 
 
529 aa  75.9  7e-13  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  32.56 
 
 
527 aa  75.5  1e-12  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  6.59561e-05 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  32.56 
 
 
527 aa  75.1  1e-12  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  30.29 
 
 
530 aa  75.1  2e-12  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  31.05 
 
 
537 aa  74.3  2e-12  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6390  carboxyl transferase  34.43 
 
 
543 aa  74.7  2e-12  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0531526  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  33.18 
 
 
515 aa  74.7  2e-12  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1840  carboxyl transferase  30.04 
 
 
542 aa  73.9  3e-12  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0053  carboxyl transferase  33.33 
 
 
510 aa  73.6  4e-12  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21120  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  29.53 
 
 
529 aa  73.6  4e-12  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0918457  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  34.07 
 
 
517 aa  73.6  4e-12  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  33.52 
 
 
536 aa  73.6  4e-12  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  30.67 
 
 
516 aa  72.8  7e-12  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4230  carboxyl transferase  29.36 
 
 
552 aa  72.8  7e-12  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551859  normal  0.395293 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  31.09 
 
 
516 aa  72.4  8e-12  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1677  carboxyl transferase  30.67 
 
 
542 aa  72.4  9e-12  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13309  propionyl-CoA carboxylase beta subunit 5 accD5  29.2 
 
 
548 aa  72.4  9e-12  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1281  carboxyl transferase  34.12 
 
 
527 aa  72.4  9e-12  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0808  carboxyl transferase  34.09 
 
 
508 aa  72  1e-11  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3618  carboxyl transferase  33.9 
 
 
510 aa  72  1e-11  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207692  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0553  carboxyl transferase  32.56 
 
 
518 aa  72  1e-11  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.965666  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  30.99 
 
 
527 aa  72  1e-11  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1593  carboxyl transferase  31.35 
 
 
514 aa  72  1e-11  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0139637  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1248  carboxyl transferase  31.28 
 
 
522 aa  72  1e-11  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4774  carboxyl transferase  30.22 
 
 
538 aa  72  1e-11  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3397  carboxyl transferase  32.77 
 
 
510 aa  71.6  2e-11  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  32.6 
 
 
512 aa  71.6  2e-11  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  30.22 
 
 
551 aa  70.5  3e-11  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  30.52 
 
 
512 aa  70.5  4e-11  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2342  carboxyl transferase  33.33 
 
 
510 aa  70.5  4e-11  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.150986  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>