20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0017 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0017  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  542  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0018  hypothetical protein  96.4 
 
 
278 aa  460  1e-128  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0016  hypothetical protein  72.5 
 
 
273 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.571689  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2933  hypothetical protein  37.41 
 
 
297 aa  161  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0015  hypothetical protein  40.78 
 
 
290 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0010  hypothetical protein  35.37 
 
 
293 aa  116  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0777049 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3949  hypothetical protein  34.02 
 
 
325 aa  80.9  2e-14  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.315669  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1765  hypothetical protein  34.95 
 
 
323 aa  74.3  2e-12  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0663  hypothetical protein  31.74 
 
 
305 aa  73.2  4e-12  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0940  hypothetical protein  33.17 
 
 
350 aa  68.2  2e-10  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3351  hypothetical protein  33.6 
 
 
349 aa  68.2  2e-10  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3710  hypothetical protein  49.33 
 
 
323 aa  66.2  6e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.483452 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1336  hypothetical protein  29.8 
 
 
362 aa  64.3  2e-09  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251495  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0653  hypothetical protein  41.76 
 
 
188 aa  63.2  5e-09  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.344221 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6682  hypothetical protein  48.44 
 
 
567 aa  60.8  2e-08  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3399  hypothetical protein  50 
 
 
347 aa  59.7  5e-08  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.274598  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0690  hypothetical protein  39.56 
 
 
189 aa  58.2  1e-07  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154988  normal  0.145005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0679  hypothetical protein  38.46 
 
 
189 aa  55.5  9e-07  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1125  hypothetical protein  38.1 
 
 
283 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.730205  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6501  hypothetical protein  36.78 
 
 
208 aa  43.9  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>