251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0015 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0015  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  100 
 
 
294 aa  596  1e-169  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0016  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  97.28 
 
 
294 aa  580  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.726882 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0014  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  86.6 
 
 
294 aa  515  1e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3700  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  37.13 
 
 
289 aa  177  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0453  gluconolactonase  40.22 
 
 
289 aa  168  9e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1323  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  38.46 
 
 
287 aa  168  9e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198758  normal  0.707681 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1727  gluconolactonase  34.34 
 
 
296 aa  152  7e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4190  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  35.05 
 
 
301 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4078  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  35.05 
 
 
301 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0125  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.63 
 
 
286 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2314  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.32 
 
 
295 aa  137  3e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122885  normal  0.0745328 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3696  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.79 
 
 
296 aa  135  7e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0419  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.17 
 
 
296 aa  134  1e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.740885  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1040  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  35.14 
 
 
312 aa  135  1e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.367735  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2611  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32 
 
 
309 aa  133  4e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.170386 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1362  Xylono-1,4-lactonase  34.28 
 
 
294 aa  133  4e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2755  hypothetical protein  33.8 
 
 
303 aa  132  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.334703  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2994  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.92 
 
 
304 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.412095  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2584  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  35.14 
 
 
304 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3586  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.1 
 
 
569 aa  132  7e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63579  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2084  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.72 
 
 
300 aa  131  1e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.206563  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1987  SMP-30/CGR1 family protein  30.26 
 
 
288 aa  130  3e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0747  senescence marker protein-30 (SMP-30)  34.4 
 
 
284 aa  129  6e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2143  hypothetical protein  32.73 
 
 
291 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0063  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.14 
 
 
292 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4675  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  40.31 
 
 
318 aa  129  7e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2681  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.46 
 
 
574 aa  128  9e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0398  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.35 
 
 
302 aa  128  9e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.993472 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2339  regucalcin-like protein  31.75 
 
 
300 aa  128  1e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0015  gluconolactonase  29.89 
 
 
288 aa  127  2e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2611  regucalcin family protein  30.55 
 
 
300 aa  127  2e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00251849  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2373  regucalcin-like protein  31.52 
 
 
303 aa  126  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2759  regucalcin family protein  30.55 
 
 
300 aa  126  4e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.86621e-08 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6028  transcriptional regulator, IclR family  33.89 
 
 
546 aa  126  4e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0187184  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2566  regucalcin family protein  30.91 
 
 
300 aa  126  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2649  regucalcin family protein  31.16 
 
 
300 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00899995  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4002  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.75 
 
 
293 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5444  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.62 
 
 
295 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00675978 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00122  regucalcin  31.77 
 
 
303 aa  122  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.235017  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5175  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.47 
 
 
296 aa  121  2e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0979633  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2337  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.03 
 
 
289 aa  121  2e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.992536  normal  0.0209348 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3407  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.93 
 
 
300 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13947  normal  0.0742686 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0519  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.52 
 
 
285 aa  119  5e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.530056  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0550  L-arabinonolactonase  31.52 
 
 
304 aa  119  8e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621286  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0279  gluconolactonase  31.39 
 
 
295 aa  118  1e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.27578  normal  0.327592 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5252  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.71 
 
 
281 aa  117  2e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3664  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.77 
 
 
304 aa  116  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  4.66286e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6939  gluconolactonase  30.85 
 
 
308 aa  116  4e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000441161  normal  0.601759 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1529  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.91 
 
 
292 aa  116  4e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2088  hypothetical protein  29.92 
 
 
300 aa  115  7e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  5.45594e-07 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02040  gluconolactonase  37.67 
 
 
298 aa  115  9e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2046  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.21 
 
 
302 aa  115  1e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00681526  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1974  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.92 
 
 
302 aa  115  1e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.18647  hitchhiker  0.00196761 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29900  gluconolactonase  33.33 
 
 
283 aa  113  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2186  senescence marker protein-30 (SMP-30)  30.31 
 
 
292 aa  113  4e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2001  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.17 
 
 
302 aa  112  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00903181  hitchhiker  3.14659e-08 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3160  senescence marker protein-30 (SMP-30)  31.32 
 
 
289 aa  111  1e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2670  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.09 
 
 
574 aa  111  1e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.142476  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1592  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.52 
 
 
300 aa  112  1e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1052  senescence marker protein-30 family protein  30.69 
 
 
294 aa  111  2e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2259  gluconolactonase  32.51 
 
 
315 aa  110  2e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0162749  unclonable  1.78231e-08 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1813  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.47 
 
 
293 aa  110  2e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.869871 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3214  gluconolactonase  28.97 
 
 
290 aa  110  2e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0353  putative senescence marker protein-30 (SMP-30)  32.11 
 
 
295 aa  111  2e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.91446e-06  hitchhiker  1.1261e-06 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2014  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.17 
 
 
289 aa  109  4e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.169753  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3209  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.12 
 
 
301 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0193044 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.85 
 
 
300 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0439453  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1188  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.91 
 
 
292 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.227591  normal  0.0804871 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4918  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.87 
 
 
299 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.117058  normal  0.866361 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0901  senescence marker protein-30 (SMP-30)  30.07 
 
 
294 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.936604  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4580  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.85 
 
 
300 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1292  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.73 
 
 
274 aa  106  4e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0048  L-arabinonolactonase  31.32 
 
 
300 aa  106  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17570  gluconolactonase  33.33 
 
 
280 aa  106  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0137637  normal  0.639926 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4867  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.93 
 
 
309 aa  106  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0126426  normal  0.175747 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0568  regucalcin family protein  31.29 
 
 
291 aa  106  6e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4241  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.52 
 
 
293 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.557262  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2536  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.83 
 
 
346 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1799  gluconolactonase  30.92 
 
 
309 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328228  hitchhiker  0.000281102 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0524  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.73 
 
 
290 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0437489 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3534  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.46 
 
 
299 aa  103  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0305763 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5473  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.3 
 
 
299 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0410042 
 
 
-
 
NC_003296  RS05363  hypothetical protein  31.23 
 
 
296 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00449707 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1170  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain protein  30.91 
 
 
293 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.482172  normal  0.0648021 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3180  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain protein  30.97 
 
 
346 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4591  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.82 
 
 
300 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253275 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1625  senescence marker protein-30 family protein  31.19 
 
 
310 aa  103  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3544  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.33 
 
 
280 aa  103  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0286848 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3300  gluconolactonase  31.14 
 
 
291 aa  102  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.875463 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0241  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.87 
 
 
291 aa  102  7e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5506  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.29 
 
 
293 aa  102  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1204  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.82 
 
 
293 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5221  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  29.89 
 
 
300 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2099  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.6 
 
 
291 aa  99.8  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.83958 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5638  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.89 
 
 
300 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700082  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3297  response regulator receiver protein  26.98 
 
 
279 aa  99.4  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.402229  normal  0.818338 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2356  senescence marker protein-30 family protein  30.94 
 
 
311 aa  99.4  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3453  gluconolactonase  29.33 
 
 
297 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.222045 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1143  gluconolactonase  30.41 
 
 
311 aa  99  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68325  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51450  gluconolactonase  27.62 
 
 
284 aa  98.6  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>