263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0013 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0014  glutaredoxin-like protein  100 
 
 
111 aa  227  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.110732  normal  0.900956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0013  glutaredoxin-like protein  100 
 
 
111 aa  227  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0012  glutaredoxin-like protein  95.5 
 
 
111 aa  221  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1124  glutaredoxin-like protein  89.19 
 
 
112 aa  206  8e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0007  glutaredoxin-like protein  84.68 
 
 
112 aa  205  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0011  glutaredoxin-like protein  81.08 
 
 
112 aa  201  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1936  glutaredoxin-related protein  69.37 
 
 
111 aa  172  1e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1939  glutaredoxin-like protein  70.27 
 
 
111 aa  172  2e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0358021  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2149  glutaredoxin-like protein  69.37 
 
 
111 aa  170  7e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.907449 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5393  putative glutaredoxin family protein  72.12 
 
 
112 aa  167  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1273  glutaredoxin-like protein  68.47 
 
 
111 aa  166  7e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.909876  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1508  glutaredoxin-like protein  66.67 
 
 
111 aa  162  1e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4088  glutaredoxin-like protein  70.37 
 
 
128 aa  162  1e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0827  glutaredoxin-related protein  68.18 
 
 
130 aa  162  2e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0835  glutaredoxin-related protein  68.18 
 
 
130 aa  162  2e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1599  glutaredoxin-like protein  69.23 
 
 
123 aa  162  2e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.283027  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2391  glutaredoxin-like protein  67.27 
 
 
110 aa  162  2e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593827  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1312  glutaredoxin-like protein  65.74 
 
 
112 aa  161  3e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1796  glutaredoxin-like protein  66.67 
 
 
108 aa  160  7e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565897  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1641  glutaredoxin-like protein  63.96 
 
 
113 aa  159  8e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1760  glutaredoxin-like protein  65.77 
 
 
127 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.608629  normal  0.443925 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2584  glutaredoxin-like protein  68.22 
 
 
112 aa  158  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.442279  normal  0.361888 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3704  glutaredoxin-like protein  66.67 
 
 
127 aa  158  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473777  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1186  glutaredoxin-like protein  65.74 
 
 
112 aa  156  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.242969 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3117  glutaredoxin-like protein  63.89 
 
 
113 aa  150  5e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.736059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0187  glutaredoxin-like protein  58.88 
 
 
111 aa  149  9e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.381703  normal  0.468757 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0123  glutaredoxin-like protein  64.76 
 
 
110 aa  147  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.826994 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0705  glutaredoxin-like protein  60.75 
 
 
109 aa  147  6e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0865  glutaredoxin-like protein  58.18 
 
 
110 aa  146  1e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.353884  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2667  glutaredoxin-like protein  60.95 
 
 
115 aa  142  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.144494  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1021  glutaredoxin-like protein  62.38 
 
 
110 aa  142  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681267  normal  0.445361 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5883  putative glutaredoxin family protein  63.37 
 
 
109 aa  139  1e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0738843  normal  0.762824 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1392  glutaredoxin-like protein  56.76 
 
 
120 aa  136  8e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.394027  normal  0.177187 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0701  glutaredoxin-like protein  55.77 
 
 
110 aa  136  8e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.244741  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2932  glutaredoxin-related protein  66 
 
 
102 aa  136  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0302  glutaredoxin-related protein  54.72 
 
 
110 aa  136  1e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.354475  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2953  glutaredoxin-related protein  57.27 
 
 
121 aa  135  3e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2519  glutaredoxin-like protein  62.24 
 
 
109 aa  134  3e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.134397  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1598  glutaredoxin-like protein  57.27 
 
 
121 aa  135  3e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0834574 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2723  glutaredoxin-like protein  66 
 
 
103 aa  134  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0502  glutaredoxin-related protein  65 
 
 
102 aa  134  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1945  glutaredoxin-related protein  65 
 
 
102 aa  134  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.980346  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0892  glutaredoxin-like protein  55.45 
 
 
121 aa  134  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.137957 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2171  glutaredoxin-like protein  59.43 
 
 
119 aa  134  5e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.95609  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3616  putative glutaredoxin  65 
 
 
102 aa  134  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0974  glutaredoxin-related protein  65 
 
 
102 aa  134  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104778  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3592  putative glutaredoxin  65 
 
 
102 aa  134  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.703507  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2597  glutaredoxin-like protein  64 
 
 
103 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583628  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0678  glutaredoxin-related protein  65 
 
 
102 aa  134  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0480  glutaredoxin-like protein  64 
 
 
103 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.505328 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0508  glutaredoxin-like protein  64 
 
 
103 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10469  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3605  glutaredoxin-like protein  65 
 
 
102 aa  134  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3595  glutaredoxin-like protein  63 
 
 
103 aa  134  6e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.826772 
 
 
-
 
NC_002978  WD0491  glutaredoxin-related protein  60.2 
 
 
107 aa  133  7e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.249105  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3524  glutaredoxin-like protein  64 
 
 
103 aa  132  1e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00765276  normal  0.116899 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0438  glutaredoxin-like protein  64 
 
 
103 aa  132  1e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.315589 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0412  glutaredoxin-like protein  64 
 
 
103 aa  132  1e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.738354  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0203  glutaredoxin-related protein  59.8 
 
 
106 aa  132  2e-30  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00589831  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3466  glutaredoxin-like protein  58.18 
 
 
113 aa  132  2e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.147483  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4712  glutaredoxin-like protein  56.31 
 
 
109 aa  132  2e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.729225  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2890  glutaredoxin-like protein  63 
 
 
103 aa  131  2e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.441106 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3377  glutaredoxin-like protein  60.61 
 
 
107 aa  131  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2734  glutaredoxin-like protein  60.61 
 
 
107 aa  131  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.546465  hitchhiker  2.9189e-06 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1710  putative monothiol glutaredoxin  54.05 
 
 
120 aa  131  4e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0700819 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0434  glutaredoxin-like protein  63 
 
 
103 aa  130  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0245  glutaredoxin-like protein  57.43 
 
 
105 aa  130  9e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.254771  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4208  glutaredoxin-like protein  58.25 
 
 
110 aa  129  1e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37615  glutaredoxin  59.38 
 
 
149 aa  129  1e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0591  glutaredoxin-like protein  57.14 
 
 
107 aa  128  2e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1426  glutaredoxin-like protein  59.62 
 
 
109 aa  129  2e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.495839  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0577  glutaredoxin-like protein  59.41 
 
 
103 aa  128  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.220445 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10761  glutaredoxin-like protein  59.6 
 
 
107 aa  128  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.431003 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1116  glutaredoxin-like protein  51.35 
 
 
120 aa  128  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5478  glutaredoxin-like protein  54.21 
 
 
107 aa  127  7e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0778  glutaredoxin-like protein  58.25 
 
 
109 aa  127  7e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.228725  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0520  hypothetical protein  58.65 
 
 
110 aa  127  7e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0968275 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0849  glutaredoxin-like protein  58.25 
 
 
109 aa  127  7e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.539719  normal  0.527344 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2904  hypothetical protein  59.22 
 
 
103 aa  125  2e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1556  glutaredoxin-like protein  55.34 
 
 
105 aa  124  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00461361 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0773  glutaredoxin-like protein  62.77 
 
 
109 aa  124  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.045295 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1480  glutaredoxin  56.7 
 
 
99 aa  124  4e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.516796  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0848  glutaredoxin-like protein  64.84 
 
 
109 aa  124  4e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.609526  normal  0.565462 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1276  glutaredoxin-like protein  53.27 
 
 
108 aa  124  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0697  glutaredoxin family protein  55.67 
 
 
99 aa  124  6e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000299958  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3886  glutaredoxin-like protein  57.84 
 
 
308 aa  122  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3047  glutaredoxin-like protein  58.42 
 
 
103 aa  123  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.994053  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1145  glutaredoxin-like protein  63.33 
 
 
108 aa  123  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3683  glutaredoxin-like protein  55.88 
 
 
106 aa  122  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3204  glutaredoxin-like protein  57.43 
 
 
117 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0357  glutaredoxin-like protein  50 
 
 
110 aa  122  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.66028 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14711  glutaredoxin-like protein  55.56 
 
 
107 aa  120  5e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.211551  normal  0.903864 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0639  glutaredoxin-like protein  55.56 
 
 
107 aa  120  5e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2460  glutaredoxin-like protein  49.07 
 
 
109 aa  120  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4396  glutaredoxin-like protein  54.55 
 
 
114 aa  120  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.308725 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3150  glutaredoxin-like protein  55.88 
 
 
103 aa  120  9e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0389298  normal  0.0157235 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12171  glutaredoxin-like protein  60.82 
 
 
107 aa  119  1e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.537864  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2784  glutaredoxin-like protein  56.25 
 
 
107 aa  119  1e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2801  glutaredoxin-like protein  54.9 
 
 
103 aa  119  1e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.420164 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0354  glutaredoxin-like protein  52.43 
 
 
109 aa  119  1e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0757306  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04720  conserved hypothetical protein  53.27 
 
 
152 aa  119  1e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.81945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>