33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0010 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0010  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  775    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0011  hypothetical protein  96.16 
 
 		 394 aa  727    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.162736  normal  0.742614 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0009  hypothetical protein  85.93 
 
 		 394 aa  672    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2089  hypothetical protein  29.35 
 
 		 427 aa  145  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0189745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1822  hypothetical protein  26.89 
 
 		 418 aa  140  4.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2131  hypothetical protein  28.64 
 
 		 432 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.347062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2408  hypothetical protein  27.72 
 
 		 432 aa  134  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4918  hypothetical protein  27.34 
 
 		 400 aa  124  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1456  hypothetical protein  28.42 
 
 		 415 aa  123  7e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0787604  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1745  hypothetical protein  24.94 
 
 		 416 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5545  hypothetical protein  28.42 
 
 		 437 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.005595 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2338  hypothetical protein  29.74 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0451029  normal  0.318955 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2872  hypothetical protein  27.34 
 
 		 411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6358  hypothetical protein  29.37 
 
 		 421 aa  116  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.171472 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2397  hypothetical protein  30.34 
 
 		 403 aa  110  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.69184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0232  hypothetical protein  27.61 
 
 		 404 aa  110  6e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0256  hypothetical protein  27.54 
 
 		 391 aa  109  7.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.854321  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3018  hypothetical protein  26.18 
 
 		 425 aa  102  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.188051  normal  0.264335 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3986  hypothetical protein  27.69 
 
 		 399 aa  96.7  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455536  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7134  hypothetical protein  30 
 
 		 429 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.488446  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0967  hypothetical protein  24.54 
 
 		 398 aa  85.1  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0474629  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4921  hypothetical protein  24.5 
 
 		 406 aa  82.4  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4736  hypothetical protein  25.5 
 
 		 417 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1390  hypothetical protein  22.88 
 
 		 398 aa  80.9  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1599  hypothetical protein  20.21 
 
 		 373 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.848347  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1411  hypothetical protein  20.61 
 
 		 373 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.586251  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1745  hypothetical protein  19.69 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0321  hypothetical protein  19.84 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4560  hypothetical protein  28.57 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.539028 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1936  hypothetical protein  21.52 
 
 		 392 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2146  hypothetical protein  21.09 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139768  normal  0.582732 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0809  hypothetical protein  25.13 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2136  hypothetical protein  25.86 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>