More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1689 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 356 aa  711    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  74.42 
 
 		 359 aa  542  1e-153  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  70.03 
 
 		 360 aa  525  1e-148  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  74.13 
 
 		 360 aa  521  1e-147  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  45.95 
 
 		 283 aa  206  4e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0514  MscS Mechanosensitive ion channel  42.52 
 
 		 288 aa  206  4e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0476  MscS mechanosensitive ion channel  46.05 
 
 		 279 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139506  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2981  hypothetical protein  44.71 
 
 		 298 aa  188  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0759175  normal  0.0858863 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0971  MscS mechanosensitive ion channel  46.7 
 
 		 272 aa  188  1e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0975842 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1701  phosphoglycerate mutase  42.31 
 
 		 310 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1335  MscS mechanosensitive ion channel  38.29 
 
 		 275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2381  MscS mechanosensitive ion channel  39.22 
 
 		 287 aa  168  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  0.00000285336 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0569  MscS Mechanosensitive ion channel  35.09 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912877  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  40.89 
 
 		 310 aa  166  5e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2355  MscS mechanosensitive ion channel  37.95 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0549147  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3051  MscS mechanosensitive ion channel  34.33 
 
 		 285 aa  152  8e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0787633 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  29.28 
 
 		 389 aa  149  9e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  32.88 
 
 		 289 aa  145  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  32.81 
 
 		 276 aa  143  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  30.15 
 
 		 305 aa  142  9e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  32.66 
 
 		 561 aa  142  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0547  MscS mechanosensitive ion channel  31.66 
 
 		 305 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.881892  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  37.2 
 
 		 547 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1189  MscS Mechanosensitive ion channel  35.51 
 
 		 445 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1320  MscS Mechanosensitive ion channel  35.91 
 
 		 300 aa  140  3e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.23225 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  28.78 
 
 		 408 aa  139  7e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  36.18 
 
 		 540 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  33.6 
 
 		 534 aa  139  7.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  35.68 
 
 		 538 aa  139  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  31.98 
 
 		 547 aa  137  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  37.44 
 
 		 414 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  34.33 
 
 		 298 aa  137  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  29.63 
 
 		 531 aa  136  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  36.6 
 
 		 533 aa  136  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1188  MscS mechanosensitive ion channel  29.63 
 
 		 267 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0730  MscS mechanosensitive ion channel  30.74 
 
 		 267 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.506108  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0091  MscS Mechanosensitive ion channel  36.36 
 
 		 297 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 400 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1034  MscS mechanosensitive ion channel  38.29 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0091  MscS mechanosensitive ion channel  31.1 
 
 		 267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2090  hypothetical protein  35.36 
 
 		 301 aa  134  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  43.96 
 
 		 393 aa  134  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  33.94 
 
 		 276 aa  133  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  35.78 
 
 		 286 aa  133  6e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0795  MscS mechanosensitive ion channel  31.56 
 
 		 269 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0452  MscS mechanosensitive ion channel  32.55 
 
 		 283 aa  132  6.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00426986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  35.23 
 
 		 274 aa  132  7.999999999999999e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2284  MscS mechanosensitive ion channel  34.36 
 
 		 273 aa  132  9e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3168  MscS Mechanosensitive ion channel  30.27 
 
 		 311 aa  132  9e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0116515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0663  MscS Mechanosensitive ion channel  31.14 
 
 		 336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2000  MscS Mechanosensitive ion channel  40.94 
 
 		 302 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.03582 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  35.27 
 
 		 549 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  29.71 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  35.27 
 
 		 549 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0661  MscS Mechanosensitive ion channel  31.25 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1359  MscS mechanosensitive ion channel  35.91 
 
 		 275 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  31.73 
 
 		 551 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  31.73 
 
 		 550 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  35.27 
 
 		 549 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  32.13 
 
 		 292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  30.15 
 
 		 277 aa  130  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  31.73 
 
 		 551 aa  130  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  34.3 
 
 		 563 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  36 
 
 		 270 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01752  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  33.33 
 
 		 328 aa  130  5.0000000000000004e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249612  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  34.52 
 
 		 275 aa  129  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  35.71 
 
 		 279 aa  129  8.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  33.33 
 
 		 532 aa  129  8.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1186  MscS mechanosensitive ion channel  38.1 
 
 		 256 aa  129  8.000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.757811 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1202  MscS Mechanosensitive ion channel  29.92 
 
 		 270 aa  129  8.000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.49703  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0556  MscS Mechanosensitive ion channel  30.52 
 
 		 293 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0521  MscS mechanosensitive ion channel  35.57 
 
 		 200 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.108923  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0890  MscS mechanosensitive ion channel  32.54 
 
 		 330 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  32.7 
 
 		 275 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  32.7 
 
 		 275 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  31.08 
 
 		 544 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  36 
 
 		 277 aa  127  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0515  MscS Mechanosensitive ion channel  26.44 
 
 		 292 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  32.23 
 
 		 275 aa  126  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  33.71 
 
 		 291 aa  126  6e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2273  MscS mechanosensitive ion channel  31.46 
 
 		 258 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2771  MscS Mechanosensitive ion channel  31.94 
 
 		 296 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  29.32 
 
 		 286 aa  125  9e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  29.32 
 
 		 286 aa  125  9e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  29.32 
 
 		 286 aa  125  9e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  29.32 
 
 		 286 aa  125  9e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  29.32 
 
 		 286 aa  125  9e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  29.32 
 
 		 286 aa  125  9e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  29.32 
 
 		 286 aa  125  9e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  29.32 
 
 		 286 aa  125  9e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  29.18 
 
 		 291 aa  125  9e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1342  MscS Mechanosensitive ion channel  35.39 
 
 		 266 aa  125  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00293598  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0589  MscS mechanosensitive ion channel  33.14 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.516163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  32.74 
 
 		 842 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0057  MscS Mechanosensitive ion channel  33.7 
 
 		 421 aa  124  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.185804  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  32.23 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1187  MscS Mechanosensitive ion channel  33.98 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0250538  hitchhiker  0.00000123969 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3627  MscS mechanosensitive ion channel  36.05 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  33.51 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  32.14 
 
 		 273 aa  124  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>