More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1600 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1749  excinuclease ABC subunit C  77.8 
 
 
527 aa  846    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0671774  normal  0.123213 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0158  excinuclease ABC subunit C  76.47 
 
 
527 aa  825    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0854  excinuclease ABC subunit C  76.28 
 
 
526 aa  810    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149188  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1600  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 
527 aa  1047    Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.0084899  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2709  excinuclease ABC subunit C  57.22 
 
 
519 aa  634  1e-180  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.890107  normal  0.0209335 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1093  excinuclease ABC subunit C  53.31 
 
 
517 aa  583  1.0000000000000001e-165  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295686  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0936  excinuclease ABC subunit C  53.51 
 
 
520 aa  581  1e-164  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0694942 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1822  excinuclease ABC subunit C  49.9 
 
 
521 aa  581  1e-164  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.201866  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1321  excinuclease ABC subunit C  51.33 
 
 
516 aa  567  1e-160  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0107777  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1161  excinuclease ABC subunit C  51.9 
 
 
520 aa  555  1e-157  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.342266  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1103  excinuclease ABC subunit C  42.53 
 
 
528 aa  414  1e-114  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  39.46 
 
 
607 aa  380  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  37.41 
 
 
604 aa  365  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  38.39 
 
 
615 aa  362  1e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0044  excinuclease ABC, C subunit  38.96 
 
 
613 aa  358  1.9999999999999998e-97  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.101531  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  36.28 
 
 
624 aa  352  8.999999999999999e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  37.36 
 
 
610 aa  351  2e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  33.51 
 
 
614 aa  343  5.999999999999999e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  35.04 
 
 
607 aa  342  1e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3221  excinuclease ABC, C subunit  37 
 
 
602 aa  342  1e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.0605848 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  36.45 
 
 
685 aa  340  2.9999999999999998e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_002950  PG1993  excinuclease ABC subunit C  36.51 
 
 
599 aa  340  4e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.589477 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  34.5 
 
 
601 aa  338  9.999999999999999e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  36.41 
 
 
631 aa  337  3.9999999999999995e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  34.87 
 
 
628 aa  335  1e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  34.19 
 
 
613 aa  333  4e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  36.58 
 
 
616 aa  333  4e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  34.05 
 
 
611 aa  333  4e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  38.36 
 
 
594 aa  332  9e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  34.48 
 
 
591 aa  332  1e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  37.13 
 
 
598 aa  331  2e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  37.06 
 
 
591 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0024  excinuclease ABC subunit C  37.11 
 
 
596 aa  330  5.0000000000000004e-89  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5031  excinuclease ABC, C subunit  36.49 
 
 
603 aa  330  5.0000000000000004e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  36.04 
 
 
607 aa  329  6e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  38 
 
 
594 aa  329  7e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  38 
 
 
594 aa  329  7e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  38 
 
 
594 aa  329  7e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  38 
 
 
594 aa  329  7e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  38.18 
 
 
594 aa  329  7e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  37.27 
 
 
593 aa  329  7e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  38 
 
 
594 aa  329  7e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  38.07 
 
 
594 aa  329  9e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  36.15 
 
 
590 aa  329  9e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0477  excinuclease ABC, C subunit  35.39 
 
 
615 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.966563  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  35.58 
 
 
626 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  35.83 
 
 
628 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1283  excinuclease ABC subunit C  36.22 
 
 
596 aa  328  2.0000000000000001e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2478  excinuclease ABC, C subunit  35.07 
 
 
652 aa  327  3e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.446818  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  34.84 
 
 
641 aa  327  3e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  37.82 
 
 
594 aa  326  5e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  37.7 
 
 
594 aa  326  6e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3066  excinuclease ABC subunit C  36.86 
 
 
607 aa  326  6e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0175  excinuclease ABC, subunit C  37.43 
 
 
596 aa  326  6e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149834  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  34.64 
 
 
627 aa  326  6e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  34.22 
 
 
619 aa  326  7e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  34.85 
 
 
613 aa  326  8.000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  35.68 
 
 
607 aa  325  1e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2374  excinuclease ABC subunit C  36.2 
 
 
607 aa  325  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.483342  normal  0.0306932 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1205  excinuclease ABC subunit C  36.68 
 
 
593 aa  325  2e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  35.13 
 
 
588 aa  325  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1227  excinuclease ABC subunit C  36.68 
 
 
593 aa  325  2e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  35.3 
 
 
610 aa  323  4e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1280  excinuclease ABC subunit C  38.93 
 
 
595 aa  323  5e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0729  excinuclease ABC subunit C  36.75 
 
 
594 aa  323  6e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2306  excinuclease ABC subunit C  34.38 
 
 
605 aa  323  6e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.391453  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25040  excinuclease ABC subunit C  35.22 
 
 
607 aa  322  8e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  36.08 
 
 
596 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2038  excinuclease ABC subunit C  34.25 
 
 
603 aa  322  9.999999999999999e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331579  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0902  excinuclease ABC subunit C  35.4 
 
 
658 aa  322  9.999999999999999e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.839452  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1681  excinuclease ABC, C subunit  34.55 
 
 
626 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  35.35 
 
 
609 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  34.95 
 
 
614 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  35.5 
 
 
607 aa  320  6e-86  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  31.6 
 
 
666 aa  319  7e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  31.95 
 
 
656 aa  319  9e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3023  excinuclease ABC, C subunit  35.34 
 
 
607 aa  319  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.623507  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  37.46 
 
 
620 aa  318  1e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3248  excinuclease ABC subunit C  35.07 
 
 
617 aa  318  2e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04670  excinuclease ABC, C subunit  36.08 
 
 
598 aa  317  3e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0853  excinuclease ABC, C subunit  31.93 
 
 
608 aa  317  4e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2896  excinuclease ABC subunit C  35.28 
 
 
607 aa  317  5e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.189646  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0979  excinuclease ABC, C subunit  31.93 
 
 
623 aa  317  5e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0363417 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4046  excinuclease ABC subunit C  34.52 
 
 
649 aa  315  9e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  34.78 
 
 
629 aa  315  9e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  37.39 
 
 
620 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0726  excinuclease ABC subunit C  36.2 
 
 
597 aa  315  9.999999999999999e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3961  excinuclease ABC subunit C  34.34 
 
 
623 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00581214  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4098  excinuclease ABC subunit C  35.45 
 
 
607 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125966  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30660  excinuclease ABC subunit C  35.34 
 
 
608 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.385406  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1766  excinuclease ABC subunit C  35.45 
 
 
607 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0738607  decreased coverage  0.000573829 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  35.3 
 
 
613 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2614  excinuclease ABC subunit C  35.15 
 
 
608 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1246  excinuclease ABC subunit C  37.19 
 
 
565 aa  313  5.999999999999999e-84  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1279  excinuclease ABC subunit C  30.7 
 
 
707 aa  313  5.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0496012  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  33.16 
 
 
644 aa  312  7.999999999999999e-84  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1222  excinuclease ABC subunit C  36.31 
 
 
593 aa  311  2e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11085  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3919  excinuclease ABC subunit C  33.88 
 
 
631 aa  311  2e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3374  excinuclease ABC subunit C  35.04 
 
 
607 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2678  excinuclease ABC subunit C  31.04 
 
 
707 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>