125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1578 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_1578  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 185 aa  366  1e-101  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59882  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1727  PadR-like family transcriptional regulator  66.85 
 
 		 179 aa  235  3e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.765397 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0184  PadR-like family transcriptional regulator  66.29 
 
 		 179 aa  227  8e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0876  PadR family transcriptional regulator  64.04 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.184962  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4233  PadR-like family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1537  PadR-like family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708005 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1786  transcriptional regulator, PadR-like family  31.16 
 
 		 186 aa  102  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0112  PadR-like family transcriptional regulator  25 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0122  PadR-like family transcriptional regulator  25 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.270668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0121  PadR-like family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3302  PadR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 190 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2974  PadR family transcriptional regulator  25 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3335  PadR family transcriptional regulator  25 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1565  PadR family transcriptional regulator  25 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3948  PadR family transcriptional regulator  25 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4021  PadR family transcriptional regulator  25 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3036  PadR family transcriptional regulator  25 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0152  putative PadR transcriptional regulator  25 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.762671  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2933  PadR-like family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.568859  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0122  PadR-like family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166129  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0136  PadR-like family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0503  transcriptional regulator, PadR-like family  27.01 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100232  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6124  PadR-like family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 253 aa  55.1  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372402  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0887  transcriptional regulator, PadR-like family  25.58 
 
 		 206 aa  54.3  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.84074  normal  0.410025 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3223  transcriptional regulator, PadR-like family  26.98 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3285  PadR-like family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 180 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400255 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3685  transcriptional regulator, PadR-like family  27.36 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1777  hypothetical protein  21.94 
 
 		 176 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.354573 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  31.33 
 
 		 263 aa  51.2  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  34.21 
 
 		 252 aa  50.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3549  transcriptional regulator, PadR-like family  25.85 
 
 		 232 aa  49.7  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.353373 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1887  transcriptional regulator PadR family protein  22.96 
 
 		 232 aa  49.7  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  32.89 
 
 		 180 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1448  PadR-like family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 124 aa  49.3  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  36.49 
 
 		 180 aa  49.3  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2526  PadR-like family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 183 aa  48.5  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0713427  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1309  PadR-like family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 189 aa  48.5  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.123604 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  37.35 
 
 		 191 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  25.74 
 
 		 226 aa  48.5  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0865  hypothetical protein  23.81 
 
 		 179 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 191 aa  48.1  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6039  PadR-like family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 181 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2308  transcriptional regulator, PadR-like family  39.71 
 
 		 124 aa  47  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197276 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1999  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 198 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.893773  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4677  PadR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1147  PadR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 240 aa  47  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3098  PadR family transcriptional regulator  32 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3292  PadR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 210 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3702  transcriptional regulator, PadR-like family  25.75 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3006  PadR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536861  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2716  PadR-like family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 112 aa  46.6  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0032771  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2773  transcriptional regulator PadR family protein  38.67 
 
 		 112 aa  46.6  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.480734  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0957  transcriptional regulator, PadR-like family  29.29 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0586102  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5734  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 172 aa  45.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  22.79 
 
 		 255 aa  45.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3013  transcriptional regulator, PadR-like family  30 
 
 		 109 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00626511 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5149  transcriptional regulator, PadR-like family  32.18 
 
 		 117 aa  46.2  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0918525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5624  transcriptional regulator, PadR-like family  32.43 
 
 		 191 aa  45.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1228  PadR-like family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 120 aa  45.4  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  35 
 
 		 181 aa  45.1  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  25.96 
 
 		 217 aa  44.7  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0098  transcriptional regulator, PadR family  23.97 
 
 		 203 aa  45.1  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.846374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0868  PadR-like family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 181 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525718  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  22.97 
 
 		 203 aa  44.7  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6512  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 114 aa  44.7  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.299933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0813  transcriptional regulator, PadR-like family  21.48 
 
 		 201 aa  44.3  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2223  PadR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 372 aa  44.3  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0957891  hitchhiker  0.0000188934 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4389  PadR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0699  PadR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 110 aa  43.9  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000596024  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1330  PadR-like family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 240 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.855689  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1446  transcriptional regulator, PadR-like family  25.83 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  33.68 
 
 		 250 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  31.52 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2527  transcriptional regulator, PadR-like family  31.4 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5383  transcriptional regulator, PadR-like family  31.08 
 
 		 249 aa  43.9  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1117  transcriptional regulator, PadR-like family  28.57 
 
 		 122 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  37.33 
 
 		 114 aa  43.5  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2708  PadR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 209 aa  43.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1805  PadR-like family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 118 aa  43.1  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8856  transcriptional regulator, PadR family  31.43 
 
 		 109 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4125  hypothetical protein  31.58 
 
 		 185 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0396692  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  32 
 
 		 107 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1487  transcriptional regulator, PadR-like family  27.93 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.241527  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37830  transcriptional regulator, PadR family  25.29 
 
 		 227 aa  43.5  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1507  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 175 aa  43.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3486  PadR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 155 aa  42.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.179924 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 229 aa  42.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  43.66 
 
 		 179 aa  42.7  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1843  PadR-like family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 117 aa  42.7  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  35.9 
 
 		 210 aa  42.7  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0106416  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4102  transcriptional regulator, PadR-like family  30.7 
 
 		 277 aa  42.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.615501 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0778  transcriptional regulator, PadR-like family  27.5 
 
 		 115 aa  42.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1531  transcriptional regulator PadR family protein  27.78 
 
 		 218 aa  42.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4957  transcriptional regulator, PadR-like family  40.35 
 
 		 212 aa  42.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5568  transcriptional regulator, PadR-like family  41.27 
 
 		 176 aa  42.4  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.630063  normal  0.41654 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3743  transcriptional regulator  30.26 
 
 		 185 aa  42  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898433  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4217  hypothetical protein  30.26 
 
 		 185 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000647114  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1562  transcriptional regulator, PadR-like family  31.08 
 
 		 186 aa  42.4  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.553173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4059  PadR-like family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 105 aa  42  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>