More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1378 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  100 
 
 
382 aa  780    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  82.89 
 
 
382 aa  666    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  83.68 
 
 
382 aa  672    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  83.95 
 
 
382 aa  674    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  73.89 
 
 
387 aa  579  1e-164  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  47.06 
 
 
383 aa  332  7.000000000000001e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  44.3 
 
 
381 aa  332  8e-90  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  48.1 
 
 
380 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  46.67 
 
 
383 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  43.16 
 
 
384 aa  320  3e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  42.58 
 
 
386 aa  315  7e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2475  Serine--glyoxylate transaminase  43.98 
 
 
377 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0418  Alanine--glyoxylate transaminase  43.57 
 
 
375 aa  311  9e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  42.82 
 
 
385 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  43.08 
 
 
382 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  43.08 
 
 
382 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  40.53 
 
 
384 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  44.47 
 
 
382 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0208  hypothetical protein  43.72 
 
 
387 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  43.75 
 
 
387 aa  302  7.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  40.38 
 
 
384 aa  302  7.000000000000001e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0053  aminotransferase, class V  44.76 
 
 
376 aa  300  2e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0056  aminotransferase, class V  43.72 
 
 
376 aa  300  4e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  43.06 
 
 
387 aa  299  6e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  42.78 
 
 
387 aa  298  8e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  41.29 
 
 
384 aa  298  2e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  40.68 
 
 
385 aa  295  9e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  40.64 
 
 
384 aa  294  1e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  46.61 
 
 
381 aa  294  1e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  40.64 
 
 
384 aa  293  3e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  40.5 
 
 
363 aa  290  3e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  42.62 
 
 
387 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  40.05 
 
 
400 aa  286  5e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  42.22 
 
 
362 aa  286  5.999999999999999e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  41.94 
 
 
362 aa  285  7e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  41.94 
 
 
362 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  40.73 
 
 
384 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  40.79 
 
 
380 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  41.64 
 
 
383 aa  281  1e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  37.76 
 
 
382 aa  281  1e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  41.07 
 
 
385 aa  281  2e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  39.89 
 
 
385 aa  280  3e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  41.95 
 
 
386 aa  279  5e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  37.01 
 
 
380 aa  279  5e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  40.27 
 
 
382 aa  278  1e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  40.76 
 
 
382 aa  277  2e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  38.32 
 
 
388 aa  277  2e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  40.21 
 
 
382 aa  275  8e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2994  alanine-glyoxylate aminotransferase  38.99 
 
 
395 aa  272  7e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  40.76 
 
 
397 aa  271  1e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  37.73 
 
 
379 aa  270  2e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  39.19 
 
 
383 aa  270  2e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  37.37 
 
 
379 aa  270  4e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3194  aminotransferase class V  39.73 
 
 
396 aa  268  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3093  aminotransferase class V  39.73 
 
 
396 aa  268  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  37.01 
 
 
401 aa  267  2.9999999999999995e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  39.29 
 
 
381 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  39.07 
 
 
382 aa  263  4e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2128  aminotransferase, class V  37.74 
 
 
391 aa  261  2e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2538  Serine--pyruvate transaminase  36.49 
 
 
413 aa  261  2e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102161  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  35.7 
 
 
404 aa  259  5.0000000000000005e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  36.41 
 
 
379 aa  257  2e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3325  serine--glyoxylate aminotransferase  36.32 
 
 
422 aa  257  3e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  37.2 
 
 
379 aa  256  4e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3524  Serine--glyoxylate transaminase  38.5 
 
 
398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119567  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1162  aminotransferase, class V  36.48 
 
 
398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000700049  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  33.86 
 
 
380 aa  252  6e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5729  Serine-glyoxylate aminotransferase  35.49 
 
 
401 aa  252  8.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2509  alanine-glyoxylate aminotransferase  36.24 
 
 
377 aa  252  9.000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0163  Alanine--glyoxylate transaminase  37.2 
 
 
396 aa  249  5e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  37.71 
 
 
360 aa  248  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5094  aminotransferase class V  37.28 
 
 
381 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2957  aminotransferase class V  39.29 
 
 
392 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.351742 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1789  Serine--pyruvate transaminase  35.53 
 
 
367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1765  aminotransferase class V  34.97 
 
 
388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.333913  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3001  Serine--glyoxylate transaminase  36.15 
 
 
406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000231297  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  35.81 
 
 
379 aa  243  3e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1420  aminotransferase class V  37.15 
 
 
360 aa  242  7.999999999999999e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1895  Serine--pyruvate transaminase  35.36 
 
 
393 aa  242  7.999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6959  Serine--glyoxylate transaminase  35.9 
 
 
406 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987633  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4850  Alanine--glyoxylate transaminase  35.73 
 
 
390 aa  241  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1813  aminotransferase class V  35.71 
 
 
385 aa  241  1e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.300679  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1778  aminotransferase, class V  35.71 
 
 
385 aa  241  1e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.182739  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5630  Serine-glyoxylate aminotransferase (SGAT)  37.89 
 
 
401 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3400  Serine--glyoxylate transaminase  38.64 
 
 
402 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  35.53 
 
 
417 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5728  serine-glyoxylate aminotransferase  38.06 
 
 
395 aa  239  6.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  34.99 
 
 
401 aa  238  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3670  aminotransferase class V  38.12 
 
 
402 aa  237  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  35.26 
 
 
417 aa  236  6e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3795  aminotransferase class V  35.57 
 
 
375 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4200  aminotransferase class V  36.53 
 
 
391 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.357141 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1287  aminotransferase, class V  36.87 
 
 
387 aa  233  3e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17916  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3418  Serine--glyoxylate transaminase  37.27 
 
 
400 aa  233  5e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  36.2 
 
 
396 aa  233  6e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2804  Serine--glyoxylate transaminase  35.43 
 
 
399 aa  233  6e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19938  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2043  Serine--pyruvate transaminase  35.96 
 
 
375 aa  233  6e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3847  aminotransferase class V  35.47 
 
 
375 aa  232  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.15565  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0736  aminotransferase class V  37.76 
 
 
356 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3660  alanine-glyoxylate aminotransferase  36.94 
 
 
377 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>