More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1171 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  80.92 
 
 
460 aa  726    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  100 
 
 
457 aa  890    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  81.58 
 
 
460 aa  728    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  80.26 
 
 
460 aa  719    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  48.05 
 
 
437 aa  418  1e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  46.14 
 
 
485 aa  414  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  49.89 
 
 
458 aa  414  1e-114  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  47.6 
 
 
437 aa  414  1e-114  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  47.15 
 
 
478 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  42.44 
 
 
454 aa  367  1e-100  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  43.37 
 
 
473 aa  358  8e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1953  MATE efflux family protein  40.09 
 
 
454 aa  342  9e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1858  MATE efflux family protein  40.13 
 
 
467 aa  334  2e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0434953  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2029  MATE efflux family protein  41.76 
 
 
455 aa  324  2e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139982  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1708  MATE efflux family protein  40.23 
 
 
470 aa  297  3e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  34.2 
 
 
460 aa  219  6e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  29.75 
 
 
455 aa  179  7e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  28.45 
 
 
455 aa  171  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  28.23 
 
 
455 aa  170  4e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  30.25 
 
 
451 aa  169  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  30.32 
 
 
461 aa  166  9e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  29.66 
 
 
462 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  30.37 
 
 
456 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  26.62 
 
 
458 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  29.08 
 
 
452 aa  160  3e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  28.57 
 
 
477 aa  160  4e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  29.12 
 
 
439 aa  160  6e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  29.76 
 
 
451 aa  159  9e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  29.08 
 
 
442 aa  159  1e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  25.69 
 
 
458 aa  159  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  29.67 
 
 
447 aa  159  1e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  30.82 
 
 
459 aa  157  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  29.21 
 
 
447 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  29.77 
 
 
449 aa  156  6e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  30 
 
 
456 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  26.73 
 
 
463 aa  153  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  28.34 
 
 
470 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  27.53 
 
 
457 aa  152  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  27.53 
 
 
459 aa  151  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  29.15 
 
 
455 aa  150  4e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  28.93 
 
 
468 aa  149  7e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  28.03 
 
 
462 aa  149  9e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  27.25 
 
 
453 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  27.59 
 
 
456 aa  147  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  24.35 
 
 
484 aa  147  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  28.03 
 
 
453 aa  146  6e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1081  MATE efflux family protein  31.83 
 
 
447 aa  146  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000165796  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  27.27 
 
 
461 aa  146  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  27.74 
 
 
462 aa  145  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1575  hypothetical protein  32.84 
 
 
459 aa  144  3e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.195902  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  31 
 
 
460 aa  144  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  26.95 
 
 
452 aa  143  5e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3661  integral membrane protein  38.19 
 
 
210 aa  143  8e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  decreased coverage  0.00609977 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  29.78 
 
 
447 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  28.25 
 
 
493 aa  141  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  29.03 
 
 
460 aa  140  3e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  27.84 
 
 
440 aa  140  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  26.29 
 
 
475 aa  140  7e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  27.74 
 
 
499 aa  139  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5728  hypothetical protein  28.68 
 
 
470 aa  138  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44189  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  27.34 
 
 
462 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  27.29 
 
 
485 aa  136  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  26.52 
 
 
464 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  28.31 
 
 
486 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  28.41 
 
 
496 aa  134  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  26.88 
 
 
466 aa  133  6e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  25.45 
 
 
468 aa  133  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  28.19 
 
 
454 aa  132  1.0000000000000001e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  28.19 
 
 
455 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  28.21 
 
 
454 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  26.5 
 
 
448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  27.03 
 
 
451 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  25.06 
 
 
453 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  26.79 
 
 
451 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  25 
 
 
460 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  26.97 
 
 
449 aa  131  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  26.76 
 
 
452 aa  131  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  28.22 
 
 
451 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  23.19 
 
 
538 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  25.34 
 
 
475 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  26.43 
 
 
460 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  27.03 
 
 
451 aa  130  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  26.79 
 
 
451 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  26.79 
 
 
451 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  26.79 
 
 
451 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  26.32 
 
 
451 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  27.42 
 
 
445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  28.99 
 
 
454 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  26.56 
 
 
451 aa  128  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  27.82 
 
 
477 aa  128  3e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  23.95 
 
 
525 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  25.35 
 
 
464 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  24.01 
 
 
554 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  27.75 
 
 
469 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  27.03 
 
 
475 aa  127  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  26.52 
 
 
461 aa  127  5e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0383  MATE efflux family protein  27.52 
 
 
451 aa  127  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.504119  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0393  MATE efflux family protein  27.52 
 
 
451 aa  127  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.530968  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  27.35 
 
 
498 aa  126  7e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  26.32 
 
 
451 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>