28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1084 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_1084  putative DNA primase, small subunit  100 
 
 
355 aa  724    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.346262  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0877  DNA primase, small subunit  75.84 
 
 
357 aa  567  1e-161  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1606  DNA primase small subunit  76.69 
 
 
357 aa  568  1e-161  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1070  putative DNA primase, small subunit  74.17 
 
 
363 aa  557  1e-157  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0882  putative DNA primase, small subunit  62.78 
 
 
364 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.506684  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1378  putative DNA primase, small subunit  28.77 
 
 
348 aa  104  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.214397  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1392  DNA primase small subunit  26.4 
 
 
390 aa  86.7  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369939  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1303  DNA primase small subunit  27.17 
 
 
380 aa  85.1  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0622  putative DNA primase, small subunit  23.4 
 
 
389 aa  84.3  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1245  DNA primase, small subunit  25.39 
 
 
404 aa  80.9  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1955  putative DNA primase, small subunit  24.08 
 
 
374 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.804448 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1571  DNA primase small subunit  24.33 
 
 
414 aa  79.7  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2047  putative DNA primase, small subunit  22.28 
 
 
387 aa  78.6  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2753  DNA primase small subunit  24.53 
 
 
386 aa  76.6  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1683  DNA primase, small subunit  24.92 
 
 
312 aa  75.9  0.0000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.773478 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1787  putative DNA primase, small subunit  24.91 
 
 
312 aa  75.9  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.057405 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1798  DNA primase small subunit  25.12 
 
 
387 aa  72.8  0.000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0437  putative DNA primase, small subunit  25.97 
 
 
312 aa  67.8  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2482  DNA primase, small subunit  24.22 
 
 
392 aa  67.4  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0410  DNA primase, small subunit  23.68 
 
 
391 aa  66.6  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193863  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0991  DNA primase small subunit  26.25 
 
 
312 aa  65.9  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2564  DNA primase, small subunit  24.35 
 
 
391 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1132  DNA primase, small subunit, putative  21.85 
 
 
388 aa  64.3  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0953  DNA primase, small subunit  21.87 
 
 
378 aa  63.9  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0066  DNA primase small subunit  21.77 
 
 
373 aa  63.5  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1793  DNA primase small subunit  23.41 
 
 
320 aa  62.4  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0420  DNA primase small subunit  28.65 
 
 
395 aa  58.9  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.669616  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2019  DNA primase small subunit  25.57 
 
 
330 aa  58.5  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.358314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>