More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1009 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_1009  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  100 
 
 		 265 aa  533  1e-150  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0982  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  85.66 
 
 		 265 aa  467  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1699  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  84.15 
 
 		 265 aa  464  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.328913  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0964  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  84.53 
 
 		 265 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.497618  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0703  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  66.79 
 
 		 262 aa  363  1e-99  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1152  translation initiation factor 2, alpha subunit  45.04 
 
 		 254 aa  229  3e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1567  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  42.91 
 
 		 268 aa  219  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1396  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  44.79 
 
 		 265 aa  217  2e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0200343  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2790  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  43.08 
 
 		 266 aa  208  7e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.289487  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0957  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  42.31 
 
 		 261 aa  207  2e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.652274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1128  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  42.15 
 
 		 264 aa  207  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0416  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  42.91 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.131172  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2880  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  41.33 
 
 		 277 aa  202  5e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.651055  normal  0.408906 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2051  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  40.68 
 
 		 259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0870  translation initiation factor 2, alpha subunit  40.38 
 
 		 266 aa  196  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1951  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  39.62 
 
 		 263 aa  195  7e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.612676 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2502  translation initiation factor 2, alpha subunit  39.23 
 
 		 266 aa  189  4e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1299  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  39.77 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1009  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  41.92 
 
 		 266 aa  185  8e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0642  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  34.85 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000204722  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2023  translation initiation factor 2, alpha subunit  36.95 
 
 		 266 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1802  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  35.06 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1359  translation initiation factor 2, alpha subunit  35.5 
 
 		 277 aa  148  7e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.256809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0077  RNA-binding S1 domain-containing protein  35.5 
 
 		 265 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.541121 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0433  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  33.47 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1783  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  32.42 
 
 		 265 aa  126  3e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.030089 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1687  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  32.79 
 
 		 264 aa  127  3e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.640158  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0995  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  31.64 
 
 		 266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00230  eukaryotic translation initiation factor 2 alpha subunit, putative  27.49 
 
 		 300 aa  94.7  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.433033  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34538  predicted protein  26.64 
 
 		 320 aa  89.7  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000454395  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03156  translation initiation factor eIF2 alpha subunit (Eurofung)  28.02 
 
 		 308 aa  86.7  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119592  Eukaryotic translation initiation factor 2, alpha subunit  27.34 
 
 		 322 aa  83.6  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0150821  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0146  hypothetical protein  42.42 
 
 		 133 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1795  SSU ribosomal protein S1P  47.95 
 
 		 539 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0543  hypothetical protein  43.43 
 
 		 133 aa  67.4  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000100816  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0530  hypothetical protein  43.43 
 
 		 133 aa  67.4  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000417558  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2662  RNA binding S1  38.98 
 
 		 140 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000144376  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07900  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  45.12 
 
 		 705 aa  66.6  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0230  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.65 
 
 		 693 aa  65.9  0.0000000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.336814  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2860  general stress protein 13  36.9 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0696  hypothetical protein  41.67 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000983919  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3572  RNA binding S1 domain protein  47.22 
 
 		 557 aa  65.9  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2797  hypothetical protein  43.21 
 
 		 134 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000939181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2483  hypothetical protein  43.21 
 
 		 134 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000579369  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3588  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  43.24 
 
 		 746 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0949  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  43.24 
 
 		 747 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2015  RNA-binding S1 domain-containing protein  35.9 
 
 		 411 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0652883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1638  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  35.79 
 
 		 705 aa  63.5  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.32153 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1223  RNA binding S1 domain protein  35.04 
 
 		 756 aa  63.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.572551 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2169  30S ribosomal protein S1  41.03 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000104963  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2860  ribosomal protein S1  41.33 
 
 		 557 aa  62.8  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3070  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.52 
 
 		 707 aa  63.2  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.526485  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0896  30S ribosomal protein S1  35.88 
 
 		 408 aa  62.8  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0892  30S ribosomal protein S1  36.96 
 
 		 399 aa  62.8  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000236762  decreased coverage  0.00000000000000302812 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2118  ribosomal protein S1  35.87 
 
 		 596 aa  63.2  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000596679  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1221  30S ribosomal protein S1  40.26 
 
 		 382 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000730459  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3080  RNA binding S1 domain protein  44.74 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000220475  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3028  RNA binding S1 domain protein  34.19 
 
 		 754 aa  62.4  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0059  hypothetical protein  40.43 
 
 		 160 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000000544172  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1150  30S ribosomal protein S1  41.67 
 
 		 400 aa  62  0.000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000136012  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0060  hypothetical protein  40.43 
 
 		 160 aa  62  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0056  hypothetical protein  40.43 
 
 		 160 aa  62  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.61011e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0056  hypothetical protein  40.43 
 
 		 160 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000079318  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0060  hypothetical protein  40.43 
 
 		 160 aa  62  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119651  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0070  hypothetical protein  40.43 
 
 		 160 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000137683  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0067  hypothetical protein  40.43 
 
 		 160 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0235  30S ribosomal protein S1  37.93 
 
 		 577 aa  62  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.00000120876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0066  hypothetical protein  40.43 
 
 		 161 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000157952  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0058  hypothetical protein  43.62 
 
 		 132 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000238948  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2022  30S ribosomal protein S1  35.78 
 
 		 472 aa  61.2  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000000578746  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0142  RNA binding S1 domain protein  38.39 
 
 		 128 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000417569  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0056  hypothetical protein  40.43 
 
 		 161 aa  62  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000117621  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1995  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.08 
 
 		 815 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0984059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5250  hypothetical protein  40.43 
 
 		 161 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000341067  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2080  cytidylate kinase/ribosomal protein S1  41.33 
 
 		 811 aa  60.8  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0380  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  40.28 
 
 		 703 aa  60.5  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00000345435  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0666  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40 
 
 		 728 aa  60.8  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0066  RNA binding S1 domain protein  41.56 
 
 		 129 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0056  hypothetical protein  36.61 
 
 		 132 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1689  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  43.18 
 
 		 728 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0455  30S ribosomal protein S1  30.61 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1437  RNA binding S1 domain protein  38.89 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.245145  normal  0.159598 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0265  RNA binding S1 domain-containing protein  44.87 
 
 		 125 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.383538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1577  30S ribosomal protein S1  41.77 
 
 		 587 aa  60.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00419028  normal  0.668764 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1632  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.89 
 
 		 703 aa  60.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.141024  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1344  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  31.52 
 
 		 687 aa  60.1  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0642692  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1292  SSU ribosomal protein S1P  41.67 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00025498  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3511  general stress protein 13  40 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1730  RNA-binding S1 domain-containing protein  35.53 
 
 		 403 aa  59.7  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0218599  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3968  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.78 
 
 		 514 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507698  normal  0.122374 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0122  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.1 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0502  RNA-binding S1 domain-containing protein  41.33 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0677  hypothetical protein  32.77 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0825  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.24 
 
 		 698 aa  59.7  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0159879 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0056  hypothetical protein  44.44 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000148596  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3847  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  43.04 
 
 		 711 aa  59.7  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.147568  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0552  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.45 
 
 		 732 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1167  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.54 
 
 		 721 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.859366  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1235  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.54 
 
 		 721 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.434132  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2976  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.97 
 
 		 696 aa  59.3  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.31401e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>