33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0951 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0951  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 159 aa  321  2e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1025  XRE family transcriptional regulator  72.96 
 
 		 158 aa  245  2e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0919  helix-turn-helix domain-containing protein  72.96 
 
 		 158 aa  245  2e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.960971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1762  XRE family transcriptional regulator  72.33 
 
 		 159 aa  244  2e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1032  helix-turn-helix domain-containing protein  56.79 
 
 		 162 aa  186  1e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1419  transcriptional regulator, XRE family  41.25 
 
 		 178 aa  100  7e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2372  transcriptional regulator, XRE family  34.5 
 
 		 173 aa  94.4  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1037  XRE family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 172 aa  90.1  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.223775  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0621  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 161 aa  88.6  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0459  XRE family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 165 aa  86.7  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2112  XRE family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 164 aa  86.3  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.79317  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1462  helix-turn-helix domain-containing protein  33.53 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.217714  normal  0.212223 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0938  transcriptional regulator, XRE family  33.74 
 
 		 162 aa  80.9  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.117119  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0360  transcriptional regulator, XRE family  29.78 
 
 		 181 aa  80.5  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0686  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 177 aa  77  0.00000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0604  transcriptional regulator, XRE family  29.19 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196411  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1304  helix-turn-helix domain-containing protein  32.92 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1903  transcriptional regulator, XRE family  28.33 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2145  XRE family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 161 aa  70.5  0.000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0037  helix-turn-helix domain-containing protein  26.99 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1076  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0112  helix-turn-helix domain-containing protein  25.99 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.1301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1173  XRE family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 177 aa  60.8  0.000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.359549 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1247  transcriptional regulator, XRE family  31.29 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.797623  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0707  helix-turn-helix domain-containing protein  32.85 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.866911  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2276  XRE family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0034  XRE family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00826547 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2081  DNA binding domain-containing protein  25.78 
 
 		 166 aa  50.8  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0460  XRE family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 325 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4622  transcriptional regulator, XRE family  35.14 
 
 		 170 aa  41.6  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759922  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1345  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 209 aa  41.2  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 252 aa  40.8  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 200 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>