141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0863 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 268 aa  543  1e-153  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  82.51 
 
 		 268 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  81.2 
 
 		 268 aa  448  1e-125  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  81.75 
 
 		 268 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  64.09 
 
 		 264 aa  359  3e-98  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0973  hypothetical protein  33.89 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2151  xylose isomerase-like TIM barrel  31.25 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00601378  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1592  xylose isomerase domain-containing protein  32.92 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.234456 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0361  xylose isomerase domain-containing protein  32.76 
 
 		 253 aa  125  5e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.934654  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  33.6 
 
 		 256 aa  122  9e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1364  hypothetical protein  29.63 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000110599  hitchhiker  0.0000000254981 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1555  xylose isomerase domain-containing protein  27.86 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0122  xylose isomerase domain-containing protein  32.67 
 
 		 254 aa  102  6e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.668761  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1974  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.51 
 
 		 256 aa  98.6  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.520711 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1143  xylose isomerase domain-containing protein  31.72 
 
 		 243 aa  97.4  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3128  hypothetical protein  29.57 
 
 		 257 aa  96.3  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4159  xylose isomerase domain-containing protein  29.9 
 
 		 257 aa  96.3  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1528  xylose isomerase-like TIM barrel  35.33 
 
 		 269 aa  92.8  6e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.317464  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0174  xylose isomerase domain-containing protein  27.34 
 
 		 236 aa  92  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0988  xylose isomerase domain-containing protein  27.04 
 
 		 253 aa  90.9  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.279783 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.11 
 
 		 255 aa  90.9  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1263  hypothetical protein  33.19 
 
 		 269 aa  89.4  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0600  xylose isomerase domain-containing protein  25 
 
 		 244 aa  89.4  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3793  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.05 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3371  AP endonuclease  30.77 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0871  hypothetical protein  30.21 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00496229  hitchhiker  0.00660497 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.34 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.883338 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1458  xylose isomerase domain-containing protein  31.7 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1299  xylose isomerase domain-containing protein  28.79 
 
 		 237 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.47167  normal  0.0132415 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1379  hypothetical protein  27.04 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.100757  normal  0.0567681 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.91 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0064  xylose isomerase-like TIM barrel  25 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0740  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.61 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0531  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.57 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2972  xylose isomerase domain-containing protein  27.32 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0511  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.59 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4163  xylose isomerase domain-containing protein  27.91 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1279  hypothetical protein  29.84 
 
 		 280 aa  68.9  0.00000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.393575 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3010  xylose isomerase-like TIM barrel  31.09 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0023  xylose isomerase domain-containing protein  26.06 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140146  normal  0.179482 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1644  xylose isomerase domain-containing protein  26.11 
 
 		 269 aa  67  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.960602 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1981  xylose isomerase domain-containing protein  25.86 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0474  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.5 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0655  AP endonuclease  25.23 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0270  xylose isomerase domain-containing protein  24.05 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.757164  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14000  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.04 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.50908  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0984  xylose isomerase domain-containing protein  26.19 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.221697  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1978  xylose isomerase domain-containing protein  24.81 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1980  xylose isomerase domain-containing protein  24.81 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1910  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.3 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.24 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0658  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.37 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1398  xylose isomerase-like TIM barrel  29.76 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02720  sugar phosphate isomerase/epimerase  27.32 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0319  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  22.02 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0325  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.74 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.105989  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1001  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.05 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4598  xylose isomerase-like TIM barrel  26.74 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1494  xylose isomerase domain-containing protein  26.29 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.747131  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1550  AP endonuclease  26.75 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3071  endonuclease IV  24.3 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208028  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1892  xylose isomerase domain-containing protein  23.45 
 
 		 275 aa  55.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.230832 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0442  hypothetical protein  27.14 
 
 		 240 aa  53.5  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0249  xylose isomerase domain-containing protein  27.34 
 
 		 265 aa  53.5  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.273491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6746  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.4 
 
 		 272 aa  53.9  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249045  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.89 
 
 		 282 aa  53.5  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4464  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.03 
 
 		 294 aa  53.1  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3351  xylose isomerase domain-containing protein  24.6 
 
 		 278 aa  52.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0835  xylose isomerase domain-containing protein  22.44 
 
 		 281 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.279878  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1744  apurinic endonuclease Apn1  23.39 
 
 		 282 aa  52.4  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0098767  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0310  endonuclease IV  26.34 
 
 		 304 aa  52  0.000009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17470  sugar phosphate isomerase/epimerase  23.85 
 
 		 325 aa  52  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.105049  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0530  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24 
 
 		 273 aa  51.6  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2460  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  18.96 
 
 		 270 aa  51.2  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0967776 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0077  xylose isomerase domain-containing protein  21.02 
 
 		 281 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10507  hypothetical protein  22.71 
 
 		 280 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0480257  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03223  predicted isomerase  21.01 
 
 		 276 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0340  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.01 
 
 		 276 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03175  hypothetical protein  21.01 
 
 		 276 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1349  xylose isomerase domain-containing protein  21.57 
 
 		 280 aa  50.4  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4928  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.63 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0340  fructoselysine 3-epimerase  21.01 
 
 		 276 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.452792 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3568  fructoselysine 3-epimerase  21.01 
 
 		 276 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0339  endonuclease IV  22.96 
 
 		 262 aa  49.7  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.699481 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3750  fructoselysine 3-epimerase  21.01 
 
 		 276 aa  49.7  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238004  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6463  hypothetical protein  22.64 
 
 		 273 aa  49.3  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.920651  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2110  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.21 
 
 		 249 aa  49.3  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517822  normal  0.355951 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0666  xylose isomerase-like TIM barrel  21.78 
 
 		 281 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0679  xylose isomerase domain-containing protein  21.78 
 
 		 281 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.419765 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0659  xylose isomerase domain-containing protein  21.78 
 
 		 281 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.748247 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2483  apurinic endonuclease Apn1  24.32 
 
 		 277 aa  49.3  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0247  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  26.4 
 
 		 253 aa  48.9  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3842  fructoselysine 3-epimerase  20.62 
 
 		 276 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4684  fructoselysine 3-epimerase  20.62 
 
 		 275 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3693  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.01 
 
 		 270 aa  48.9  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1356  apurinic endonuclease Apn1  25.54 
 
 		 266 aa  48.5  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0191838  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4027  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.41 
 
 		 275 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.383869  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5503  hypothetical protein  23.98 
 
 		 301 aa  48.5  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0949  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  20.38 
 
 		 272 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0440  xylose isomerase-like TIM barrel  21.93 
 
 		 323 aa  47.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.292372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>