More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0859 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0859  50S ribosomal protein L23P  100 
 
 		 86 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.455359  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0793  50S ribosomal protein L23P  87.21 
 
 		 86 aa  153  8e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.110307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0031  50S ribosomal protein L23P  87.21 
 
 		 86 aa  152  1e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1125  50S ribosomal protein L23P  87.21 
 
 		 86 aa  152  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0805  50S ribosomal protein L23P  76.74 
 
 		 86 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.720418  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0228  ribosomal protein L25/L23  50.59 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00350  ribosomal protein, putative  50 
 
 		 154 aa  85.1  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1798  50S ribosomal protein L23P  48.75 
 
 		 81 aa  82.4  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.217622  normal  0.590833 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16602  Ribosomal protein L23a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  43.53 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1519  ribosomal protein L23  55.56 
 
 		 87 aa  80.5  0.000000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000262554  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61259  predicted protein  48.81 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2048  50S ribosomal protein L23P  42.5 
 
 		 82 aa  78.2  0.00000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.700766 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0815  50S ribosomal protein L23P  47.5 
 
 		 81 aa  77  0.00000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1585  50S ribosomal protein L23P  43.75 
 
 		 81 aa  76.3  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0093  50S ribosomal protein L23P  46.25 
 
 		 81 aa  72.8  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000249681  unclonable  0.000000335999 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1776  ribosomal protein L23  46.91 
 
 		 81 aa  71.2  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2294  50S ribosomal protein L23P  42.35 
 
 		 87 aa  71.2  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2447  50S ribosomal protein L23P  35.8 
 
 		 84 aa  70.1  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08856  60S ribosomal protein L23 (AFU_orthologue; AFUA_5G05630)  43.9 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1726  ribosomal protein L25/L23  40 
 
 		 82 aa  69.3  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0978109  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2220  ribosomal protein L23  39.51 
 
 		 84 aa  68.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0212  ribosomal protein L23  39.51 
 
 		 84 aa  68.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0566  50S ribosomal protein L23P  43.21 
 
 		 82 aa  68.6  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0431079  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0534  50S ribosomal protein L23P  43.04 
 
 		 83 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.646212  normal  0.481774 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1830  50S ribosomal protein L23P  37.35 
 
 		 85 aa  64.7  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.649517 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0444  50S ribosomal protein L23P  40 
 
 		 82 aa  64.7  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0443463  normal  0.681719 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0083  50S ribosomal protein L23P  42.11 
 
 		 82 aa  62.8  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.657611  normal  0.218333 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0807  50S ribosomal protein L25/L23  37.35 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.563432 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0315  ribosomal protein L25/L23  36.47 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.997937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  41.67 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2251  50S ribosomal protein L23P  36.25 
 
 		 82 aa  57  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000000299035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  46.88 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  46.88 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2855  50S ribosomal protein L23  42.35 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0878449  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  46.88 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0758  50S ribosomal protein L23  40.24 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000156644  normal  0.0173378 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1088  50S ribosomal protein L23  45.31 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  44.62 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0935  50S ribosomal protein L23  40.91 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000134151  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3326  50S ribosomal protein L23  40.91 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.23257e-16 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  47.69 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_004310  BR1231  50S ribosomal protein L23  43.75 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244915  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1194  50S ribosomal protein L23  43.75 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1958  50S ribosomal protein L23  43.75 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0171198  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0710  50S ribosomal protein L23  47.54 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.58529  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  42.35 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3993  Ribosomal protein L25/L23  40.7 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0108  50S ribosomal protein L23P  37.97 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  45.31 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  37.14 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3665  50S ribosomal protein L23  45.31 
 
 		 99 aa  53.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0194  Ribosomal protein L25/L23  38.82 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1366  50S ribosomal protein L23  43.94 
 
 		 98 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.263915  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0628  50S ribosomal protein L23  38.64 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000116587  hitchhiker  0.000000000000956309 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2297  50S ribosomal protein L23  43.75 
 
 		 99 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1547  50S ribosomal protein L23  45.31 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1617  Ribosomal protein L25/L23  39.13 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0788  ribosomal protein L25/L23  38.3 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1251  50S ribosomal protein L23  46.88 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.781143  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2816  50S ribosomal protein L23  45.31 
 
 		 102 aa  52.8  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.947427  normal  0.439693 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1676  50S ribosomal protein L23  45.31 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62104  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  48.44 
 
 		 98 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0496  50S ribosomal protein L23  36.56 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000003402  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0668  50S ribosomal protein L23  48.44 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142276  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0700  50S ribosomal protein L23  48.44 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000143862  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  45.31 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1356  ribosomal protein L25/L23  43.75 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.385939  normal  0.0499735 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3446  50S ribosomal protein L23  45.31 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.947767  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  46.88 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0578  Ribosomal protein L25/L23  43.48 
 
 		 102 aa  51.6  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  45.31 
 
 		 95 aa  51.6  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3182  50S ribosomal protein L23  43.75 
 
 		 99 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0330  ribosomal protein L23  48.44 
 
 		 100 aa  51.6  0.000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1743  50S ribosomal protein L23  38.04 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745247  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17140  50S ribosomal protein L23  45.45 
 
 		 101 aa  51.2  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.538328  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1069  50S ribosomal protein L23  38.64 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000947106  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0693  50S ribosomal protein L23  34.15 
 
 		 104 aa  50.8  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.001904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0435  50S ribosomal protein L23  35.48 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00486251  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3010  50S ribosomal protein L23  36.47 
 
 		 101 aa  51.2  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00732369 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2561  Ribosomal protein L25/L23  34.15 
 
 		 104 aa  51.2  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1294  50S ribosomal protein L23  36.59 
 
 		 105 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000921122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0325  Ribosomal protein L25/L23  37.8 
 
 		 97 aa  50.4  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000179883  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0198  50S ribosomal protein L23  43.94 
 
 		 95 aa  50.1  0.000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00352738  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1432  50S ribosomal protein L23  42.19 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11483  normal  0.0319487 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  42.86 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0250  50S ribosomal protein L23  39.02 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1681  50S ribosomal protein L23  42.19 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0570438  hitchhiker  0.0000115816 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0247  50S ribosomal protein L23  39.02 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1334  50S ribosomal protein L23  42.19 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212671  normal  0.17449 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  39.06 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129787 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0761  50S ribosomal protein L23  43.75 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0679128  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5068  50S ribosomal protein L23  43.75 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.304969 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  40.51 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0285  50S ribosomal protein L23  37.65 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000248684  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0584  50S ribosomal protein L23  39.51 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4542  50S ribosomal protein L23  37.65 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000172317  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001740  LSU ribosomal protein L23p (L23Ae)  39.76 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000423409  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0267  50S ribosomal protein L23  46.15 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000129072  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1351  50S ribosomal protein L23  43.75 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1557  ribosomal protein L25/L23  39.68 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271789  normal  0.935147 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>