More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0839 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0839  ribonuclease III  100 
 
 
227 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0774  ribonuclease III  74.34 
 
 
229 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.811993  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0049  ribonuclease III  71.24 
 
 
229 aa  325  5e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1144  ribonuclease III  72.12 
 
 
229 aa  320  9.999999999999999e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  50 
 
 
241 aa  214  9.999999999999999e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  48.64 
 
 
246 aa  212  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  49.78 
 
 
246 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  48.25 
 
 
245 aa  195  6e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  48.64 
 
 
245 aa  192  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  46.02 
 
 
259 aa  192  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  49.32 
 
 
245 aa  192  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  49.32 
 
 
245 aa  192  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  48.86 
 
 
245 aa  191  9e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  48.86 
 
 
245 aa  191  9e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  48.86 
 
 
245 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  48.86 
 
 
245 aa  191  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  48.86 
 
 
245 aa  190  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  48.86 
 
 
245 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  48.86 
 
 
245 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  47.98 
 
 
229 aa  189  2e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  44 
 
 
243 aa  189  4e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  44 
 
 
243 aa  189  4e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  46.33 
 
 
235 aa  189  4e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  44.29 
 
 
245 aa  188  5.999999999999999e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  46.4 
 
 
236 aa  180  1e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  47.76 
 
 
236 aa  178  5.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  44 
 
 
246 aa  176  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1159  ribonuclease III  43.05 
 
 
233 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000332232  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  42.73 
 
 
233 aa  172  5e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  47.14 
 
 
236 aa  171  5.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  41.1 
 
 
233 aa  170  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  42.48 
 
 
235 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  39.07 
 
 
235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  42.13 
 
 
236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  41.18 
 
 
231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  45.58 
 
 
246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  38.81 
 
 
232 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  43.86 
 
 
245 aa  162  6e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  39.56 
 
 
377 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  41.59 
 
 
262 aa  159  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  42.2 
 
 
240 aa  156  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  41.26 
 
 
230 aa  154  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  42.73 
 
 
242 aa  154  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  38.89 
 
 
383 aa  151  7e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  38.89 
 
 
383 aa  151  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0453  ribonuclease III  40.18 
 
 
231 aa  150  1e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0380  ribonuclease III  36.09 
 
 
234 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.492905  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  38.89 
 
 
385 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  39.91 
 
 
221 aa  150  2e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1947  ribonuclease III  47.32 
 
 
253 aa  149  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  36.62 
 
 
246 aa  149  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  39.45 
 
 
237 aa  149  4e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  40.09 
 
 
241 aa  149  4e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  39.63 
 
 
241 aa  148  6e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  37.38 
 
 
246 aa  148  7e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1641  ribonuclease III  40.83 
 
 
240 aa  148  7e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  41.48 
 
 
222 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  39.38 
 
 
231 aa  146  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  41.2 
 
 
246 aa  145  5e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  38.73 
 
 
240 aa  145  6e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  39.37 
 
 
225 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  38.07 
 
 
248 aa  144  1e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  39.37 
 
 
225 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4602  ribonuclease III  36.11 
 
 
237 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  40 
 
 
238 aa  144  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  40.69 
 
 
224 aa  144  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  40.69 
 
 
225 aa  143  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2312  ribonuclease III  37.89 
 
 
222 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.842494  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  36.87 
 
 
260 aa  143  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  38.07 
 
 
248 aa  142  3e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  40.26 
 
 
225 aa  142  4e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  40.18 
 
 
223 aa  142  6e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  41.59 
 
 
226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1604  ribonuclease III  43.32 
 
 
231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  39.34 
 
 
231 aa  139  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  39.39 
 
 
223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  34.53 
 
 
240 aa  138  7e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0951  ribonuclease III  40.11 
 
 
233 aa  138  7e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.608841  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0780  ribonuclease III  42.29 
 
 
226 aa  138  8.999999999999999e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  6.30965e-17 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  36.4 
 
 
230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  42.23 
 
 
223 aa  135  4e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  40.52 
 
 
229 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1240  ribonuclease III  37.93 
 
 
227 aa  135  6.0000000000000005e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1609  ribonuclease III  34.63 
 
 
252 aa  134  8e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1975  ribonuclease III  38.96 
 
 
227 aa  134  9e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  36.92 
 
 
222 aa  134  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  34.11 
 
 
240 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11290  RNAse III  34.96 
 
 
234 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  37.79 
 
 
228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  39.32 
 
 
282 aa  133  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1081  ribonuclease III  41.67 
 
 
239 aa  132  3e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0928  ribonuclease III  34.08 
 
 
256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0993  ribonuclease III  34.08 
 
 
256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0631846  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  37.25 
 
 
234 aa  132  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1588  ribonuclease III  36.02 
 
 
234 aa  131  7.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18360  RNAse III  34.93 
 
 
250 aa  131  7.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1063  ribonuclease III  34.53 
 
 
256 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0362018  normal  0.166075 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl231  ribonuclease III, dsRNA-specific ribonuclease  40.64 
 
 
231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1444  ribonuclease III  36.07 
 
 
227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1375  ribonuclease III  36.07 
 
 
227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>