More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0836 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0836  preprotein translocase subunit SecD  100 
 
 		 388 aa  769    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0771  preprotein translocase subunit SecD  84.79 
 
 		 388 aa  667    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1147  preprotein translocase subunit SecD  85.57 
 
 		 388 aa  672    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0052  preprotein translocase subunit SecD  85.82 
 
 		 388 aa  672    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1017  preprotein translocase subunit SecD  71.13 
 
 		 391 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.562711  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0895  preprotein translocase subunit SecD  39.34 
 
 		 558 aa  211  2e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.433485  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3176  preprotein translocase subunit SecD  37.36 
 
 		 484 aa  192  8e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0851  preprotein translocase subunit SecD  39.08 
 
 		 566 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1797  preprotein translocase subunit SecD  35.47 
 
 		 486 aa  181  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0601908  normal  0.730674 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1656  preprotein translocase subunit SecD  35.73 
 
 		 485 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00710078  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1023  preprotein translocase subunit SecD  35.56 
 
 		 507 aa  178  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0744  SecD/SecF/SecDF export membrane protein  33.33 
 
 		 537 aa  172  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0280  preprotein translocase subunit SecD  34.37 
 
 		 497 aa  149  8e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1322  preprotein translocase subunit SecD  40.24 
 
 		 546 aa  146  5e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.776168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1964  preprotein translocase subunit SecD  41.2 
 
 		 529 aa  145  1e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.94592  normal  0.207837 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2689  preprotein translocase subunit SecD  33.24 
 
 		 510 aa  145  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2707  preprotein translocase subunit SecD  43.22 
 
 		 549 aa  142  7e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  29.52 
 
 		 403 aa  124  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1987  preprotein translocase subunit SecD  37.1 
 
 		 564 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000381338  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  26.29 
 
 		 471 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  30 
 
 		 410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1272  preprotein translocase subunit SecD  26.87 
 
 		 411 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  26.51 
 
 		 461 aa  115  8.999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  28.26 
 
 		 406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  25.56 
 
 		 416 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0625  preprotein translocase subunit SecD  28.09 
 
 		 415 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000418015  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  25.7 
 
 		 464 aa  112  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  26.46 
 
 		 413 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000293049  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  26.01 
 
 		 399 aa  110  6e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  27.87 
 
 		 474 aa  110  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12260  protein-export membrane protein SecD  28.05 
 
 		 403 aa  109  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000764404  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1462  preprotein translocase subunit SecD  28.18 
 
 		 411 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000572302  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  24.78 
 
 		 470 aa  106  7e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  24.82 
 
 		 461 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.63 
 
 		 853 aa  103  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  26.12 
 
 		 470 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  26.12 
 
 		 470 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0536  protein-export membrane protein SecD  27.86 
 
 		 441 aa  99.4  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000245038  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0904  protein-export membrane protein SecD  25.2 
 
 		 445 aa  98.2  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000019832  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  28.22 
 
 		 735 aa  97.8  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  26.19 
 
 		 512 aa  97.4  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  27.2 
 
 		 534 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  25.76 
 
 		 503 aa  96.7  6e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  27.47 
 
 		 534 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  27.01 
 
 		 534 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  27.23 
 
 		 843 aa  95.1  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  27.05 
 
 		 531 aa  94.4  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0026  preprotein translocase subunit SecD  29.13 
 
 		 638 aa  94.4  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.943233  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1279  preprotein translocase subunit SecD  26.67 
 
 		 495 aa  93.2  6e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.221382  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0033  preprotein translocase subunit SecD  29.2 
 
 		 619 aa  93.2  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.33 
 
 		 844 aa  91.3  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  25.6 
 
 		 535 aa  92  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.33 
 
 		 845 aa  91.3  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0716  SecD/SecF family protein-export membrane protein  25.64 
 
 		 734 aa  91.3  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000203356  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.7 
 
 		 839 aa  90.1  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  26.77 
 
 		 554 aa  90.1  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.7 
 
 		 844 aa  89.7  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1908  preprotein translocase subunit SecD  25.74 
 
 		 419 aa  89.4  9e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154062  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  25.85 
 
 		 535 aa  89.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.88 
 
 		 848 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  26.3 
 
 		 532 aa  88.2  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0007  preprotein translocase subunit SecD  28.12 
 
 		 595 aa  88.2  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.211478 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0012  preprotein translocase subunit SecD  28.17 
 
 		 607 aa  88.2  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000769208  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.51 
 
 		 856 aa  88.2  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.7 
 
 		 849 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0011  preprotein translocase subunit SecD  29.17 
 
 		 605 aa  88.2  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.019109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2197  preprotein translocase subunit SecD  25.74 
 
 		 419 aa  88.2  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3982  protein-export membrane protein SecD  22.72 
 
 		 468 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.728055 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  23.99 
 
 		 556 aa  87  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.28 
 
 		 844 aa  87  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  25.85 
 
 		 533 aa  87  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3326  protein-export membrane protein SecD  22.38 
 
 		 474 aa  87  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  24.72 
 
 		 533 aa  86.3  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  24.87 
 
 		 531 aa  86.3  9e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1116  protein-export membrane protein SecD  23.56 
 
 		 472 aa  84.7  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.887298  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0012  preprotein translocase subunit SecD  27.17 
 
 		 594 aa  85.5  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216124  hitchhiker  0.00885825 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0013  preprotein translocase subunit SecD  28.4 
 
 		 624 aa  85.1  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295061  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0878  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.68 
 
 		 834 aa  85.1  0.000000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.335263  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16221  preprotein translocase subunit SecD  25.32 
 
 		 495 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_002936  DET0333  preprotein translocase subunit SecD  27.55 
 
 		 449 aa  84.3  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000488895  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1191  preprotein translocase subunit SecD  25.24 
 
 		 493 aa  84.3  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  23.04 
 
 		 554 aa  84  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1455  protein-export membrane protein SecD  28.45 
 
 		 622 aa  84  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.202191  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3824  protein-export membrane protein SecD  27.15 
 
 		 656 aa  84  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0504  protein-export membrane protein SecD  23.2 
 
 		 462 aa  83.2  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000522922  hitchhiker  0.000170526 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0313  preprotein translocase subunit SecD  27.3 
 
 		 449 aa  83.6  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000119854  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0086  preprotein translocase subunit SecD  24.28 
 
 		 501 aa  83.2  0.000000000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.509625  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1116  protein-export membrane protein SecD  25.82 
 
 		 500 aa  82.8  0.000000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  24.39 
 
 		 594 aa  82.8  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  24.39 
 
 		 594 aa  82.8  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_275  protein-export membrane protein, preprotein translocase SecD subunit  26.28 
 
 		 449 aa  82  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000478055  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1905  protein-export membrane protein SecD  25.3 
 
 		 477 aa  82.4  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  24.43 
 
 		 533 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1285  protein-export membrane protein SecD  26.63 
 
 		 423 aa  82  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0952765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  25.54 
 
 		 531 aa  82.4  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1762  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.86 
 
 		 981 aa  81.6  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  25.84 
 
 		 532 aa  81.6  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0883  preprotein translocase subunit SecD  27.25 
 
 		 508 aa  81.3  0.00000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  25.5 
 
 		 534 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  25.71 
 
 		 533 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>