More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0652 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  56.82 
 
 
993 aa  989    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  100 
 
 
1019 aa  1946    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  57.8 
 
 
993 aa  985    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  58.22 
 
 
993 aa  1010    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  37.49 
 
 
994 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  22.58 
 
 
1057 aa  119  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  31.38 
 
 
858 aa  107  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  31.93 
 
 
890 aa  106  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  35.27 
 
 
891 aa  105  5e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  32.16 
 
 
864 aa  103  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  29.48 
 
 
891 aa  99.8  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  29.17 
 
 
888 aa  98.2  8e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  29.48 
 
 
895 aa  97.8  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  32.42 
 
 
1074 aa  95.5  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  24.04 
 
 
902 aa  95.1  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  27.75 
 
 
910 aa  93.6  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  32.83 
 
 
789 aa  92.8  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  28.32 
 
 
924 aa  91.7  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  24.34 
 
 
926 aa  89  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0448  SMC protein-like protein  29.51 
 
 
955 aa  87.4  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507994  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  25.81 
 
 
693 aa  82.4  0.00000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  31.32 
 
 
859 aa  80.9  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1725  nuclease SbcCD, C subunit, putative  25.38 
 
 
813 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.536729  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  30.77 
 
 
859 aa  80.5  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_490  DNA repair ATPase  31.32 
 
 
859 aa  80.5  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  27.32 
 
 
1021 aa  80.1  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  21.82 
 
 
702 aa  79.7  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  30.49 
 
 
812 aa  78.6  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1333  nuclease sbcCD subunit C  29.14 
 
 
1226 aa  78.2  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  40.59 
 
 
804 aa  77.4  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  27.78 
 
 
935 aa  77  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  30.32 
 
 
1234 aa  76.3  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3179  SMC domain-containing protein  23.05 
 
 
1023 aa  75.5  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0019664  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  26.34 
 
 
1016 aa  75.9  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4561  exonuclease SbcC  25.91 
 
 
1007 aa  75.1  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  25.42 
 
 
1049 aa  75.1  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3443  SMC protein-like  28.09 
 
 
1232 aa  74.7  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  26.06 
 
 
904 aa  73.9  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  23.66 
 
 
702 aa  74.3  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  31.94 
 
 
1039 aa  73.9  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  28.41 
 
 
857 aa  73.6  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  27.34 
 
 
1008 aa  72.8  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  27.11 
 
 
1061 aa  72  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  25.93 
 
 
1019 aa  71.6  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4093  SMC domain-containing protein  25.93 
 
 
1022 aa  71.6  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240758  normal  0.708538 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0944  SMC protein-like protein  36.96 
 
 
483 aa  71.6  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.665094  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2848  exonuclease SbcC  27.27 
 
 
1308 aa  70.9  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  23.36 
 
 
702 aa  69.7  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2451  SMC domain-containing protein  28.05 
 
 
1232 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1922  SMC domain protein  24.34 
 
 
987 aa  68.9  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.664102 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  23.18 
 
 
987 aa  68.9  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2570  SMC domain-containing protein  19.46 
 
 
984 aa  69.3  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03135  exonuclease SbcC  26.38 
 
 
1238 aa  68.9  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  31.13 
 
 
1114 aa  68.6  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2505  SMC protein-like protein  26.71 
 
 
1265 aa  68.2  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0217131  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0905  SMC domain-containing protein  23.92 
 
 
1022 aa  68.2  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.995306  hitchhiker  0.000299578 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  28.32 
 
 
1029 aa  67.4  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  26.37 
 
 
1346 aa  66.6  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1213  SMC domain-containing protein  25.68 
 
 
806 aa  67  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2343  SMC domain protein  25.85 
 
 
912 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0527  SMC domain-containing protein  29.71 
 
 
784 aa  67  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0283  SMC domain protein  29.17 
 
 
1223 aa  66.6  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  26.34 
 
 
700 aa  67  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1375  DNA repair ATPase  34.09 
 
 
814 aa  66.2  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000366162  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  27.94 
 
 
978 aa  66.2  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1637  SMC domain-containing protein  26.97 
 
 
795 aa  66.2  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2355  SMC domain-containing protein  27.74 
 
 
1247 aa  66.6  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  27.01 
 
 
1307 aa  65.9  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  27.5 
 
 
1303 aa  65.5  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  26.97 
 
 
1029 aa  65.5  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2009  hypothetical protein  21.16 
 
 
922 aa  65.1  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  26.8 
 
 
1029 aa  65.1  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3009  exonuclease SbcC  24.9 
 
 
1008 aa  65.1  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.291694  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  28.69 
 
 
1180 aa  64.7  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  26.99 
 
 
852 aa  64.7  0.000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1155  SMC domain-containing protein  26.99 
 
 
852 aa  64.7  0.000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  26.4 
 
 
1029 aa  64.3  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0947  SMC domain protein  29.1 
 
 
1082 aa  64.3  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.823623  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0855  SMC domain protein  24.84 
 
 
802 aa  63.9  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.128097  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  29.87 
 
 
1116 aa  63.9  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1006  SMC domain protein  25.31 
 
 
1227 aa  63.9  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817412  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  26.4 
 
 
1029 aa  63.9  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  26.8 
 
 
1029 aa  64.3  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  26.4 
 
 
1029 aa  63.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  26.4 
 
 
1029 aa  63.5  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  26.4 
 
 
1029 aa  63.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  26.4 
 
 
1029 aa  63.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0032  hypothetical protein  31.3 
 
 
664 aa  63.2  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3111  exonuclease SbcC  24.5 
 
 
1008 aa  63.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  22.81 
 
 
1223 aa  63.2  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  26.4 
 
 
1029 aa  63.5  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  28.39 
 
 
1165 aa  62.8  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  31.08 
 
 
961 aa  62.8  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2637  SMC domain-containing protein  24.39 
 
 
1164 aa  62.8  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257916  normal  0.0339127 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  28.79 
 
 
1134 aa  62.4  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  23.18 
 
 
1025 aa  62.8  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1574  SMC domain-containing protein  27.31 
 
 
840 aa  62  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0162335  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  22.49 
 
 
1189 aa  61.6  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1750  SMC domain protein  26.47 
 
 
445 aa  61.2  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.524117  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  21.36 
 
 
953 aa  60.5  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>