286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0495 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  100 
 
 
372 aa  757    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0411  periplasmic binding protein  56.38 
 
 
374 aa  451  1e-125  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1494  periplasmic binding protein  55.85 
 
 
374 aa  450  1e-125  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00826016  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0425  periplasmic binding protein  57.22 
 
 
365 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.264248  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0424  periplasmic binding protein  54.81 
 
 
373 aa  438  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.212243  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  49.58 
 
 
372 aa  363  3e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0427  periplasmic binding protein  47.47 
 
 
373 aa  359  5e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1493  periplasmic binding protein  46.56 
 
 
386 aa  358  8e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.277986  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0410  periplasmic binding protein  46.67 
 
 
373 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.579049  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  50.13 
 
 
390 aa  332  9e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  48.52 
 
 
358 aa  332  9e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  47.93 
 
 
358 aa  325  8.000000000000001e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  43.28 
 
 
378 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1466  periplasmic binding protein  41.51 
 
 
369 aa  308  6.999999999999999e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0440112  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3056  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  43.77 
 
 
369 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  38.67 
 
 
374 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  39.49 
 
 
403 aa  269  7e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1047  Fe3+-hydroxamate binding protein  40.86 
 
 
370 aa  267  2e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.271921  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  41.29 
 
 
375 aa  267  2e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  39.82 
 
 
381 aa  267  2e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0251  periplasmic binding protein  38.98 
 
 
369 aa  265  1e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  38.72 
 
 
401 aa  264  2e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  37.95 
 
 
401 aa  261  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1622  iron transport periplasmic binding protein  38.17 
 
 
370 aa  259  6e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000308392  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2147  periplasmic binding protein  39.02 
 
 
387 aa  256  3e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.985671  normal  0.111935 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  39.77 
 
 
370 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  41.02 
 
 
375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  39.2 
 
 
381 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2328  periplasmic binding protein  39.47 
 
 
384 aa  251  1e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  36.68 
 
 
373 aa  250  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  37.37 
 
 
375 aa  249  5e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  38.46 
 
 
376 aa  248  1e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1653  periplasmic binding protein  37.33 
 
 
386 aa  246  6e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2329  periplasmic binding protein  39.02 
 
 
384 aa  245  8e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  39.72 
 
 
362 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  37.65 
 
 
396 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0497  periplasmic binding protein  42.39 
 
 
377 aa  243  3e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  36.42 
 
 
409 aa  239  5.999999999999999e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1091  hypothetical protein  39.71 
 
 
337 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  36.57 
 
 
689 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0216  periplasmic binding protein  37.27 
 
 
393 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.941778  normal  0.148136 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  36.05 
 
 
375 aa  233  5e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  36.02 
 
 
688 aa  228  1e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1424  periplasmic binding protein  34.66 
 
 
374 aa  224  2e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.813522  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0998  iron ABC transporter, solute-binding protein  38.1 
 
 
373 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1174  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  35.61 
 
 
367 aa  222  9e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00124091  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1823  periplasmic binding protein  32.89 
 
 
366 aa  206  4e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.717749  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1092  hypothetical protein  35.88 
 
 
378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0991  periplasmic binding protein  32.81 
 
 
359 aa  176  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.960819  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0816  periplasmic binding protein  31.34 
 
 
344 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  25.89 
 
 
375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1354  periplasmic binding protein  24.43 
 
 
371 aa  105  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  27.14 
 
 
389 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  24.53 
 
 
384 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  27.14 
 
 
381 aa  104  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  27.14 
 
 
389 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  27.45 
 
 
334 aa  103  6e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  26.97 
 
 
351 aa  102  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  29.65 
 
 
362 aa  101  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  27.79 
 
 
366 aa  98.6  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  24.93 
 
 
369 aa  97.1  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  26.95 
 
 
344 aa  97.4  4e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  25.95 
 
 
333 aa  96.3  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  26.86 
 
 
354 aa  94.7  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  27.43 
 
 
427 aa  94.4  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  26.88 
 
 
354 aa  93.6  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  26.78 
 
 
365 aa  92.8  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  24.65 
 
 
360 aa  92.4  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1093  Fe3+-hydroxamate binding protein  23.4 
 
 
426 aa  92.4  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000629133  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  23.5 
 
 
361 aa  91.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  25.21 
 
 
354 aa  89.7  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1691  periplasmic binding protein  24.44 
 
 
353 aa  89.7  7e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000252356  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  24.58 
 
 
354 aa  89.4  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1675  hypothetical protein  24.25 
 
 
368 aa  89  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1044  hypothetical protein  26.32 
 
 
397 aa  88.2  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  25.25 
 
 
363 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0283  periplasmic binding protein  22.79 
 
 
383 aa  86.7  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.996344  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5522  periplasmic binding protein  26.43 
 
 
361 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  24.13 
 
 
350 aa  86.3  8e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1176  ABC transporter, solute-binding protein  25.97 
 
 
408 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2097  periplasmic binding protein  24.86 
 
 
376 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.328694  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1477  periplasmic binding protein  24.24 
 
 
345 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.47905  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  23.74 
 
 
350 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  23.44 
 
 
350 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  23.74 
 
 
350 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  23.74 
 
 
350 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1702  periplasmic binding protein  26.27 
 
 
364 aa  83.6  0.000000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  27.32 
 
 
370 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0148  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  23.76 
 
 
349 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0440522  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  22.99 
 
 
354 aa  82.4  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1687  periplasmic binding protein  25.24 
 
 
378 aa  80.9  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.372146  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0448  periplasmic binding protein  23.35 
 
 
345 aa  80.5  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0352349  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3842  periplasmic binding protein  24.06 
 
 
349 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294669  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1673  ferrichrome-binding periplasmic protein  23.12 
 
 
353 aa  80.5  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  24.1 
 
 
351 aa  80.5  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2140  periplasmic binding protein  25 
 
 
394 aa  80.5  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.07383  normal  0.925288 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2078  periplasmic binding protein  24.2 
 
 
327 aa  80.1  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1995  periplasmic binding protein  23.58 
 
 
360 aa  79  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  22.38 
 
 
478 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1314  periplasmic binding protein  25.13 
 
 
380 aa  78.2  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0394754 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>