19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0432 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0432  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  100 
 
 		 89 aa  180  5.0000000000000004e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00986722  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0477  signal recognition particle, subunit SRP19 (srp19)  72.73 
 
 		 89 aa  137  7e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0359  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  70.79 
 
 		 89 aa  131  3e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.128282  hitchhiker  0.00176843 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1560  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  69.66 
 
 		 89 aa  130  6.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.972556  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0004  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  47.19 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000181188  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0274  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  38.37 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1829  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  35 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3604  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  35 
 
 		 93 aa  64.7  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.653493  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0717  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  31.76 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2790  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  31.46 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2505  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  31.76 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1413  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  30.23 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1273  signal recognition particle protein Srp19  28.05 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.831098  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00643  signal recognition particle 19 kDa protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16820)  33.33 
 
 		 257 aa  50.4  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2116  signal recognition particle protein Srp19  26.74 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0576  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  30.77 
 
 		 95 aa  47.8  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00280682 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1746  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  33.8 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.100961  hitchhiker  0.00245079 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0359  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  26.74 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.473363  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0519  signal recognition particle, subunit SRP19  29.89 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>