More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0283 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0283  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
239 aa  478  1e-134  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.274556  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0340  extracellular solute-binding protein  39.06 
 
 
248 aa  169  4e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.419937  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1775  extracellular solute-binding protein  37.19 
 
 
251 aa  156  3e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.742308  hitchhiker  0.000324527 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0143  extracellular solute-binding protein  37.86 
 
 
252 aa  154  1e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.216874  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1806  extracellular solute-binding protein  36.71 
 
 
253 aa  148  7e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0263139  unclonable  0.0000000066734 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1630  extracellular solute-binding protein  35.92 
 
 
247 aa  148  8e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0564  extracellular solute-binding protein  39.17 
 
 
243 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.323644  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0283  extracellular solute-binding protein  35.48 
 
 
248 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.37574  hitchhiker  0.000912938 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0366  extracellular solute-binding protein  33.19 
 
 
253 aa  143  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1164  extracellular solute-binding protein  37.16 
 
 
252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.065416  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1448  extracellular solute-binding protein  34.3 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.194926  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0471  extracellular solute-binding protein  34.71 
 
 
254 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.295976  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0414  extracellular solute-binding protein  35.42 
 
 
252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0820  extracellular solute-binding protein  36.53 
 
 
252 aa  132  6e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0754  extracellular solute-binding protein  37.5 
 
 
252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00633321  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0013  extracellular solute-binding protein  34.76 
 
 
253 aa  128  6e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126244  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0067  extracellular solute-binding protein  36.24 
 
 
252 aa  128  6e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.571905  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  32.59 
 
 
265 aa  125  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  32.79 
 
 
266 aa  123  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  32.79 
 
 
266 aa  123  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  32.79 
 
 
266 aa  123  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  33.63 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4024  extracellular solute-binding protein  31.51 
 
 
270 aa  118  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400278  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  34.17 
 
 
501 aa  118  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  31.84 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  31.84 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  31.84 
 
 
266 aa  116  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  31.84 
 
 
285 aa  116  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  32.29 
 
 
266 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  31.84 
 
 
266 aa  116  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  31.84 
 
 
266 aa  116  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  31.84 
 
 
266 aa  116  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  32.29 
 
 
266 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  31.39 
 
 
266 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  31.39 
 
 
266 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  31.39 
 
 
266 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  29.44 
 
 
265 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  30.74 
 
 
266 aa  113  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2189  extracellular solute-binding protein  30.17 
 
 
272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000000925831  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  32.49 
 
 
265 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  30.36 
 
 
271 aa  112  7.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0743  extracellular solute-binding protein  29.92 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2908  cystine transporter subunit  30.64 
 
 
265 aa  109  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.647057  normal  0.0539473 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  28.81 
 
 
260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1805  extracellular solute-binding protein  32.5 
 
 
246 aa  108  6e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0545186  unclonable  0.00000000660342 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  29.39 
 
 
502 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  29.39 
 
 
502 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  30 
 
 
268 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  30.49 
 
 
266 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1565  extracellular solute-binding protein family 3  30.89 
 
 
260 aa  107  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  30.49 
 
 
266 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  30.49 
 
 
266 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  29.1 
 
 
264 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  30.49 
 
 
266 aa  106  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0859  amino acid ABC transporter permease  29.05 
 
 
990 aa  106  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0204986  normal  0.722319 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1036  amino acid ABC transporter permease  29.05 
 
 
990 aa  106  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.328178 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  30.49 
 
 
266 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  30.49 
 
 
266 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1652  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  32.52 
 
 
244 aa  105  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.513751 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 
266 aa  105  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0971  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.72 
 
 
259 aa  105  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0864  extracellular solute-binding protein  34.02 
 
 
248 aa  105  8e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.887861  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  31.49 
 
 
254 aa  105  9e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0208  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.13 
 
 
257 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  30 
 
 
264 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1739  extracellular solute-binding protein  31.84 
 
 
248 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.376685 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4902  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.45 
 
 
264 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0259  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.13 
 
 
257 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000559258 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0416  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.04 
 
 
264 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  28.28 
 
 
264 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  29.26 
 
 
266 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4264  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.72 
 
 
259 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1767  extracellular solute-binding protein  29.31 
 
 
276 aa  103  3e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.99488  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  31.14 
 
 
264 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  31.14 
 
 
264 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4059  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  29.32 
 
 
259 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988465  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3898  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.32 
 
 
259 aa  102  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4376  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  29.32 
 
 
259 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000139221  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4174  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.32 
 
 
259 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0433211 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3905  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.32 
 
 
259 aa  102  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000878527  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  30.28 
 
 
281 aa  101  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  30.99 
 
 
247 aa  101  8e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4225  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.32 
 
 
259 aa  101  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000103966  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2711  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  29.61 
 
 
243 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2397  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 
257 aa  101  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38840  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  32.14 
 
 
272 aa  100  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.621896 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0724  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 
260 aa  100  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.531273  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4285  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.32 
 
 
259 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1471  hypothetical protein  32.27 
 
 
238 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1044  extracellular solute-binding protein family 3  31.28 
 
 
247 aa  101  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1582  arginine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein ArtI  29.61 
 
 
243 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3131  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 
266 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0172  extracellular solute-binding protein  30.17 
 
 
248 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2626  arginine ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein ArtI  29.61 
 
 
243 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.359067  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1475  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 
260 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0984243  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.02 
 
 
513 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1295  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.76 
 
 
267 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.397869 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  30.7 
 
 
264 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1512  hypothetical protein  31.42 
 
 
238 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  29.2 
 
 
270 aa  99.8  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>