111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0264 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0264  restriction modification system DNA specificity subunit  100 
 
 		 407 aa  836    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1783  restriction modification system DNA specificity subunit  42.72 
 
 		 448 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.311566 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0640  restriction modification system DNA specificity subunit  38.73 
 
 		 447 aa  232  9e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0842  hypothetical protein  55.21 
 
 		 446 aa  224  2e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.229597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3443  restriction modification system DNA specificity domain protein  34.58 
 
 		 445 aa  190  5e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1516  restriction modification system DNA specificity subunit  31.07 
 
 		 395 aa  187  3e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.205219 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1366  hypothetical protein  32.09 
 
 		 462 aa  182  8.000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6260  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.48 
 
 		 441 aa  176  6e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2200  type I restriction-modification system specificity subunit  33.46 
 
 		 461 aa  172  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.844306  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19070  hypothetical protein  29.47 
 
 		 425 aa  164  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0871344 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2682  putative restriction endonuclease S subunit  24.49 
 
 		 400 aa  155  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.845062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2939  type I restriction-modification system  29.73 
 
 		 432 aa  147  5e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0304782 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1153  restriction modification system DNA specificity subunit  27.16 
 
 		 429 aa  146  7.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.487263  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0414  restriction modification system DNA specificity subunit  27.42 
 
 		 439 aa  137  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.405933  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2869  type I restriction-modification system, S subunit  28.57 
 
 		 448 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0947716  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0416  type I restriction-modification system S subunit  25.28 
 
 		 457 aa  129  7.000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0531711 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1860  type I restriction enzyme, S subunit  28.11 
 
 		 474 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0504746  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0796  restriction modification system DNA specificity domain  28.19 
 
 		 441 aa  126  8.000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343889 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2688  restriction endonuclease S subunits-like  28.57 
 
 		 487 aa  125  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.165356  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3989  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.6 
 
 		 456 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0737122 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0076  type I restriction-modification system subunit S  25.16 
 
 		 464 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4472  restriction modification system DNA specificity subunit  27.04 
 
 		 415 aa  124  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.270866  normal  0.0902542 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2176  restriction modification system DNA specificity subunit  32.99 
 
 		 444 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.962317  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1858  restriction modification system DNA specificity subunit  22.15 
 
 		 456 aa  119  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0777  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  25.88 
 
 		 422 aa  117  3e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00318537  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0487  restriction modification system DNA specificity subunit  23.76 
 
 		 438 aa  116  6e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal  0.0187002 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1481  restriction endonuclease S subunits-like protein  23.8 
 
 		 443 aa  113  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0233  restriction modification system DNA specificity subunit  28.91 
 
 		 461 aa  113  7.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0967889  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3571  hypothetical protein  30.99 
 
 		 458 aa  108  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3940  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.5 
 
 		 453 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2607  restriction modification system DNA specificity subunit  23.87 
 
 		 462 aa  107  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003235  type I restriction-modification system specificity subunit S  26.98 
 
 		 437 aa  104  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0277  restriction modification system DNA specificity subunit  24.71 
 
 		 413 aa  105  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4761  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  25.95 
 
 		 428 aa  104  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0193  type I restriction-modification system specificity determinant  27.86 
 
 		 416 aa  102  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1544  restriction modification system DNA specificity domain protein  36.42 
 
 		 374 aa  99.8  8e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2606  restriction modification system DNA specificity subunit  24.68 
 
 		 429 aa  99.4  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0658  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.21 
 
 		 473 aa  98.2  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1366  putative type I site-specific restriction-modification system, S subunit  27.33 
 
 		 422 aa  98.2  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0493853  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1221  restriction modification system DNA specificity subunit  24.88 
 
 		 463 aa  96.7  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0750  putative type I restriction-modification system  29.76 
 
 		 436 aa  97.1  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.769779  normal  0.272821 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2268  putative type I restriction enzyme, S subunit  30.3 
 
 		 457 aa  96.7  7e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0277  hypothetical protein  29.95 
 
 		 474 aa  95.9  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1015  hypothetical protein  29.08 
 
 		 477 aa  95.1  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0599  type I restriction-modification system, S subunit  24.19 
 
 		 458 aa  94.4  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1791  restriction modification system DNA specificity subunit  25.18 
 
 		 419 aa  94.4  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4252  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.96 
 
 		 462 aa  92.4  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1327  restriction modification system DNA specificity subunit  28.97 
 
 		 431 aa  90.9  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280518 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1071  restriction modification system DNA specificity subunit  26.96 
 
 		 429 aa  89.7  9e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2226  restriction modification system DNA specificity subunit  23.03 
 
 		 451 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.890862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1064  type I restriction-modification  25.68 
 
 		 453 aa  88.2  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000898872  normal  0.027841 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0455  restriction modification system DNA specificity subunit  30.43 
 
 		 403 aa  86.7  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0467  restriction modification system DNA specificity subunit  30.43 
 
 		 403 aa  86.7  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1551  type I restriction enzyme  32.58 
 
 		 439 aa  86.7  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0768  N-6 DNA methylase  27.75 
 
 		 799 aa  80.5  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04450  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.16 
 
 		 422 aa  79.7  0.00000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0387  restriction modification system DNA specificity domain  28.99 
 
 		 435 aa  75.9  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0681662  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3358  restriction modification system DNA specificity subunit  37.8 
 
 		 429 aa  72.8  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0521612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2904  restriction modification system DNA specificity subunit  25.46 
 
 		 425 aa  72  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1671  restriction modification system DNA specificity subunit  30.5 
 
 		 442 aa  71.6  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.517259  hitchhiker  0.00037426 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1220  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.97 
 
 		 620 aa  71.2  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1526  restriction endonuclease S subunits-like  29.45 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1496  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.4 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.136919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0988  type I restriction-modification system, S subunit  24.63 
 
 		 401 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0041  restriction modification system DNA specificity subunit  29.59 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1357  restriction modification system DNA specificity domain  29.06 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0971497  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2621  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.41 
 
 		 400 aa  65.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0382  type I restriction-modification system, S subunit  22.42 
 
 		 439 aa  64.7  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4455  restriction modification system DNA specificity subunit  22.97 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.353509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0607  restriction modification system DNA specificity subunit  21.72 
 
 		 438 aa  63.2  0.000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3793  restriction modification system DNA specificity subunit  22.51 
 
 		 425 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1160  restriction modification system DNA specificity subunit  21.02 
 
 		 407 aa  62.4  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2698  restriction modification system DNA specificity subunit  51.02 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0854775  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1897  restriction modification system DNA specificity subunit  23.36 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0347  type I restriction-modification system, S subunit  22.44 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000269296  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0102  restriction modification system DNA specificity domain protein  18.64 
 
 		 442 aa  60.5  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2689  restriction modification system DNA specificity subunit  23.51 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.841682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03180  hypothetical protein  39.39 
 
 		 159 aa  58.5  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000950219 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0959  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.49 
 
 		 442 aa  57.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3569  restriction modification system DNA specificity domain  24.52 
 
 		 395 aa  55.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185936  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0899  restriction endonuclease S subunit  26.45 
 
 		 396 aa  55.5  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000681459  hitchhiker  0.00000169581 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0507  restriction modification system DNA specificity subunit  23.69 
 
 		 429 aa  53.9  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1091  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.94 
 
 		 444 aa  53.1  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17387  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0951  restriction modification system DNA specificity subunit  20.91 
 
 		 419 aa  52.8  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000406123 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2277  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.71 
 
 		 433 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  hitchhiker  0.00000677276 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22810  hypothetical protein  24.88 
 
 		 418 aa  51.6  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2194  restriction modification system DNA specificity subunit  26.26 
 
 		 427 aa  50.4  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.122675  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1674  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.03 
 
 		 477 aa  50.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13680  hypothetical protein  20.66 
 
 		 354 aa  50.1  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.247083  normal  0.424884 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3075  restriction modification system DNA specificity domain protein  19.66 
 
 		 388 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.40504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1204  restriction modification system DNA specificity subunit  25.44 
 
 		 547 aa  48.5  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340549  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2391  restriction modification system DNA specificity subunit  34.15 
 
 		 374 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164769  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0334  restriction modification system DNA specificity domain  25.37 
 
 		 430 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.284396 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0789  type I restriction-modification system, S subunit  24.75 
 
 		 407 aa  46.6  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190219  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0841  type I restriction-modification system, S subunit  24.75 
 
 		 407 aa  46.6  0.0009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2792  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.88 
 
 		 423 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2926  restriction modification system DNA specificity subunit  23.32 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2548  restriction modification system DNA specificity domain  22.9 
 
 		 405 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1037  restriction modification system DNA specificity domain  19.22 
 
 		 364 aa  46.2  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0890662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4930  type I restriction enzyme StySJI specificity protein  21.02 
 
 		 469 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>