168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0221 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0221  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  100 
 
 
154 aa  300  5.000000000000001e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0450541  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1727  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  75.97 
 
 
154 aa  245  2e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0175  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  74.68 
 
 
154 aa  243  4.9999999999999997e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.155132  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0735  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  74.68 
 
 
154 aa  239  1e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.466982  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2024  CheD  46.98 
 
 
162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2022  CheD, stimulates methylation of MCP protein  48.61 
 
 
166 aa  128  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2687  hypothetical protein  44.97 
 
 
161 aa  128  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2146  CheD  40.54 
 
 
160 aa  124  7e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00139115  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0955  CheD, stimulates methylation of MCP protein  44.37 
 
 
173 aa  123  8.000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1665  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  43.62 
 
 
162 aa  120  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00633684  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07640  chemotaxis protein CheD  42.47 
 
 
158 aa  120  8e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000135078  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0024  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  45.14 
 
 
157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.375225  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1137  CheD  40 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176263  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0024  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  45.14 
 
 
157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000154554  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2385  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  40.54 
 
 
166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0382  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  40.28 
 
 
159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3146  CheD  42.38 
 
 
173 aa  117  7e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0941  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  44.96 
 
 
163 aa  117  7.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.326065  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1741  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  41.22 
 
 
171 aa  116  9e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0800  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  42.28 
 
 
167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0621769  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0493  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  42.28 
 
 
161 aa  115  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1334  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  44.53 
 
 
137 aa  115  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.104931  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1432  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  41.67 
 
 
160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1308  CheD  40 
 
 
163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.950792  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2029  CheD, stimulates methylation of MCP protein  37.74 
 
 
165 aa  110  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0111  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  41.38 
 
 
166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290541  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1417  CheD  41.86 
 
 
145 aa  108  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0653716  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1854  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  40.28 
 
 
164 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2485  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  36.71 
 
 
159 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.380035  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1986  CheD family protein  37.09 
 
 
156 aa  107  8.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0103025  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2581  CheD  39.26 
 
 
159 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4129  CheD  37.5 
 
 
160 aa  106  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000670022  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0982  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  40.85 
 
 
151 aa  105  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1372  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  36.08 
 
 
159 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.239439  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0877  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  37.58 
 
 
161 aa  102  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.312761  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1421  CheD  39.47 
 
 
160 aa  100  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.216006  normal  0.348077 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1201  CheD-like chemotaxis protein  40 
 
 
162 aa  100  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0604  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  34.48 
 
 
171 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0638  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  33.79 
 
 
171 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0629  CheD  33.79 
 
 
171 aa  98.6  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3300  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.56 
 
 
170 aa  97.1  8e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0363  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  38.28 
 
 
220 aa  97.1  8e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3209  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  36.67 
 
 
162 aa  95.5  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000200637 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1007  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  35.66 
 
 
157 aa  94.7  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000449804  normal  0.590403 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0712  CheD  35.14 
 
 
157 aa  94.4  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1310  CheD  34.85 
 
 
161 aa  94.4  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0061  CheD, stimulates methylation of MCP protein  36.99 
 
 
173 aa  93.6  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0431  hypothetical protein  38.06 
 
 
173 aa  92.8  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.13773  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0955  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.22 
 
 
171 aa  92.4  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.301241  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0662  CheD, stimulates methylation of MCP protein  37.01 
 
 
163 aa  90.9  6e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.436046  normal  0.296152 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2617  CheD, stimulates methylation of MCP protein  34.46 
 
 
165 aa  90.1  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3201  chemotaxis protein CheD, putative  35.1 
 
 
162 aa  89.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.945605  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3061  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.86 
 
 
204 aa  89  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.583013  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0977  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  34.27 
 
 
156 aa  87.8  4e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3294  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  32.62 
 
 
175 aa  88.2  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.370177 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3787  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.86 
 
 
245 aa  88.2  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.54993  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1596  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  32.45 
 
 
165 aa  88.2  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1782  CheD  35.06 
 
 
234 aa  87.4  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.544534 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0782  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  30.77 
 
 
177 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3472  hypothetical protein  34.92 
 
 
156 aa  85.5  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.771884 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0088  CheD  32 
 
 
197 aa  85.1  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0439  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  33.55 
 
 
210 aa  85.5  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00596403  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2173  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.1 
 
 
242 aa  84.3  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0902871  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0235  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.38 
 
 
172 aa  84.3  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.367659  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1382  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  33.77 
 
 
201 aa  84  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0909  chemotaxis protein CheD, putative  29.37 
 
 
168 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22580  chemotaxis protein CheD  38.03 
 
 
168 aa  83.2  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3303  hypothetical protein  37.4 
 
 
206 aa  83.6  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2899  CheD, stimulates methylation of MCP protein  35.14 
 
 
198 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5563900000000001e-18 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2889  catalytic domain of components of various dehydrogenase complexes  32.03 
 
 
205 aa  82.8  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1321  CheD, stimulates methylation of MCP protein  30.67 
 
 
194 aa  82.4  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.776014  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0701  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  29.22 
 
 
167 aa  81.6  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0356622  normal  0.347186 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4342  hypothetical protein  32.24 
 
 
209 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0169  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  36.09 
 
 
273 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.413087 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1613  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  30.32 
 
 
191 aa  81.3  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166674  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1616  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  33.77 
 
 
202 aa  80.9  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0524891 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0648  hypothetical protein  36.72 
 
 
170 aa  80.9  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0642567  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2983  CheD, stimulates methylation of MCP protein  29.41 
 
 
175 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1407  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  33.09 
 
 
176 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.577059  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1931  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.53 
 
 
203 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0398  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  30.07 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.152516 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1527  hypothetical protein  31.47 
 
 
160 aa  79.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101375 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0658  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  31.72 
 
 
245 aa  79.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0343248 
 
 
-
 
NC_003296  RS02054  chemotaxis protein  36.05 
 
 
233 aa  78.2  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124025  normal  0.0167614 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2326  chemotaxis protein CheD, putative  33.77 
 
 
199 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2419  CheD, stimulates methylation of MCP proteins  30.07 
 
 
160 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.333698  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1441  CheD  37.31 
 
 
191 aa  78.2  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0610  hypothetical protein  30.92 
 
 
209 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4165  CheD  35.37 
 
 
236 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0242  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.07 
 
 
247 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137526  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4053  CheD  35.37 
 
 
236 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2847  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.07 
 
 
247 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169491  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0260  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  35.07 
 
 
247 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00168623  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3178  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.62 
 
 
234 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2563  CheD  35.33 
 
 
175 aa  77.4  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.236478  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0072  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.62 
 
 
234 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3362  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.33 
 
 
241 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0117903  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4153  CheD, stimulates methylation of MCP protein  34.09 
 
 
217 aa  77  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.340514  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3430  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.62 
 
 
234 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3932  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  34.62 
 
 
234 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>