More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0048 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0048  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 304 aa  612  9.999999999999999e-175  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1783  porphobilinogen deaminase  79.14 
 
 		 304 aa  487  1e-136  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.370283  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0120  porphobilinogen deaminase  77.48 
 
 		 304 aa  482  1e-135  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.375076 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0680  porphobilinogen deaminase  77.81 
 
 		 304 aa  481  1e-135  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.301712  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1324  porphobilinogen deaminase  61.64 
 
 		 342 aa  357  9.999999999999999e-98  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  43.9 
 
 		 310 aa  192  6e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1121  porphobilinogen deaminase  41.22 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.878665 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3450  porphobilinogen deaminase  45.2 
 
 		 526 aa  190  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.78794 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  43.09 
 
 		 306 aa  189  7e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1259  porphobilinogen deaminase  42.24 
 
 		 308 aa  186  6e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.925729  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  43.36 
 
 		 311 aa  186  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0217  porphobilinogen deaminase  41.8 
 
 		 290 aa  185  7e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000356603  normal  0.0285906 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2580  porphobilinogen deaminase  41.18 
 
 		 311 aa  182  6e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1226  porphobilinogen deaminase  41.22 
 
 		 309 aa  182  6e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000455197  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1465  porphobilinogen deaminase  41.08 
 
 		 316 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1725  porphobilinogen deaminase  41.39 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1237  porphobilinogen deaminase  41.38 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2559  porphobilinogen deaminase  40.41 
 
 		 295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1398  porphobilinogen deaminase  38.25 
 
 		 300 aa  179  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02860  porphobilinogen deaminase  39.85 
 
 		 316 aa  178  9e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.302767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0526  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  41.06 
 
 		 542 aa  177  2e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.419548  normal  0.654893 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  35.62 
 
 		 309 aa  176  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0066  porphobilinogen deaminase  38.84 
 
 		 312 aa  176  6e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0447079  normal  0.735502 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2245  porphobilinogen deaminase  40.08 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.53648  normal  0.202815 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1014  porphobilinogen deaminase  39.09 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0827893  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  39.03 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0280  porphobilinogen deaminase  39.68 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  38.49 
 
 		 310 aa  172  5e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0050  porphobilinogen deaminase  38.15 
 
 		 301 aa  172  5e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1163  porphobilinogen deaminase  39.26 
 
 		 293 aa  172  5.999999999999999e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.749247  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0237  hydroxymethylbilane synthase  38.26 
 
 		 331 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1342  porphobilinogen deaminase  35.93 
 
 		 300 aa  171  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0863  porphobilinogen deaminase  40 
 
 		 313 aa  170  2e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0113254  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0677  porphobilinogen deaminase  39.75 
 
 		 314 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0690  porphobilinogen deaminase  39.75 
 
 		 314 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.118278 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  39.41 
 
 		 313 aa  171  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0670  porphobilinogen deaminase  39.75 
 
 		 314 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1454  porphobilinogen deaminase  40.22 
 
 		 288 aa  170  3e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.179158  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0845  porphobilinogen deaminase  37.6 
 
 		 312 aa  170  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.026448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0044  porphobilinogen deaminase  38.55 
 
 		 321 aa  169  7e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1891  porphobilinogen deaminase  39.85 
 
 		 312 aa  169  7e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1022  porphobilinogen deaminase  39.22 
 
 		 297 aa  168  9e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4309  porphobilinogen deaminase  39.06 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0256  porphobilinogen deaminase  38.58 
 
 		 313 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.874316 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4582  porphobilinogen deaminase  39.06 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05591  porphobilinogen deaminase  42.34 
 
 		 316 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0186  porphobilinogen deaminase  38.58 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0208  porphobilinogen deaminase  38.58 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4313  porphobilinogen deaminase  40.15 
 
 		 310 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4197  porphobilinogen deaminase  38.67 
 
 		 309 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4208  porphobilinogen deaminase  38.67 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1750  porphobilinogen deaminase  38.34 
 
 		 303 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0354  porphobilinogen deaminase  37.92 
 
 		 298 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0983  porphobilinogen deaminase  39.34 
 
 		 294 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.188272  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0491  porphobilinogen deaminase  34.54 
 
 		 311 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5487  porphobilinogen deaminase  38.97 
 
 		 313 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0211  porphobilinogen deaminase  38.98 
 
 		 313 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.204763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4551  porphobilinogen deaminase  39.52 
 
 		 309 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1234  porphobilinogen deaminase  38.68 
 
 		 294 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.33164  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0542  porphobilinogen deaminase  36.89 
 
 		 292 aa  166  4e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0630058  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0496  porphobilinogen deaminase  39.17 
 
 		 316 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0062  porphobilinogen deaminase  38.19 
 
 		 313 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1702  porphobilinogen deaminase  39.36 
 
 		 305 aa  166  5.9999999999999996e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05221  porphobilinogen deaminase  39.3 
 
 		 316 aa  166  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47600  porphobilinogen deaminase  38.06 
 
 		 314 aa  165  6.9999999999999995e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0112  porphobilinogen deaminase  38.74 
 
 		 309 aa  165  8e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4361  porphobilinogen deaminase  38.28 
 
 		 309 aa  165  9e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.448902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4696  porphobilinogen deaminase  38.28 
 
 		 309 aa  165  9e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  40.23 
 
 		 312 aa  165  9e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69450  porphobilinogen deaminase  37.8 
 
 		 313 aa  165  9e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0899  porphobilinogen deaminase  42.91 
 
 		 308 aa  165  9e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.28159  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4555  porphobilinogen deaminase  38.28 
 
 		 309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4600  porphobilinogen deaminase  38.28 
 
 		 309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0652  porphobilinogen deaminase  39.11 
 
 		 309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0388  porphobilinogen deaminase  39.77 
 
 		 310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.571998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3638  porphobilinogen deaminase  39.77 
 
 		 310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0386  porphobilinogen deaminase  39.77 
 
 		 310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00551577  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  40.82 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3568  porphobilinogen deaminase  41.43 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133183  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0944  porphobilinogen deaminase  39.48 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700736  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1385  porphobilinogen deaminase  42.04 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0495  porphobilinogen deaminase  38.06 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24400  hydroxymethylbilane synthase  38.46 
 
 		 358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.485393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  40.82 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05521  porphobilinogen deaminase  38.59 
 
 		 316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.132832  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2984  porphobilinogen deaminase  35.6 
 
 		 304 aa  163  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.896426 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0208  porphobilinogen deaminase  38.8 
 
 		 320 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0872  porphobilinogen deaminase  37.45 
 
 		 310 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  38.38 
 
 		 309 aa  163  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  39.6 
 
 		 313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6729  porphobilinogen deaminase  35.25 
 
 		 313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0968  porphobilinogen deaminase  38.25 
 
 		 296 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.918465  hitchhiker  0.00994772 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  40.41 
 
 		 320 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6006  porphobilinogen deaminase  37.4 
 
 		 313 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.254392  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  40.41 
 
 		 320 aa  162  6e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  40.41 
 
 		 318 aa  162  6e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  40.41 
 
 		 320 aa  162  6e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0701  porphobilinogen deaminase  35.22 
 
 		 298 aa  162  6e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.141584  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  40.41 
 
 		 320 aa  162  6e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  40.41 
 
 		 320 aa  162  6e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>