189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0029 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0029  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  100 
 
 		 189 aa  390  1e-108  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.929727  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0699  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  78.84 
 
 		 191 aa  323  1e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.192375  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1764  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  78.31 
 
 		 191 aa  318  3.9999999999999996e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.387329  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0139  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  77.78 
 
 		 190 aa  318  3.9999999999999996e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0192788 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1161  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  46.6 
 
 		 189 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0011  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  46.6 
 
 		 189 aa  171  5e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.536124  hitchhiker  0.000865916 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1920  putative DNA polymerase III, epsilon subunit  42.47 
 
 		 204 aa  139  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.931749  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1638  DNA polymerase III, epsilon subunit, putative  41.94 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.400233  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1670  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  35.03 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.217345  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0639  exonuclease  30.39 
 
 		 215 aa  64.7  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0446468 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0194  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.01 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4900  DNA polymerase III subunit epsilon  28.21 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.989955  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4989  DNA polymerase III subunit epsilon  28.21 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5268  DNA polymerase III subunit epsilon  28.21 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.674728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1292  DNA polymerase III subunit epsilon  29.41 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2943  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.97 
 
 		 410 aa  59.3  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000266032  decreased coverage  0.0000042458 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0423  DNA polymerase III, epsilon subunit  30 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3198  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.23 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.205342  normal  0.0244899 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4419  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.58 
 
 		 224 aa  57.8  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.280676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0297  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.46 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0105  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.77 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0597936 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1339  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.89 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0133405  hitchhiker  0.000000000461521 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0303  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.23 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3611  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.77 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2539  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.31 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5519  DNA polymerase III subunit epsilon  28.57 
 
 		 333 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.716069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1251  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.55 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0398  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.46 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.542302 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3448  DNA polymerase III subunit epsilon  29.46 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0506  DNA polymerase III, epsilon subunit:DNA polymerase 3, epsilon subunit  32.11 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.021444  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1478  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.33 
 
 		 231 aa  54.7  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0948171  normal  0.333081 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0158  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.77 
 
 		 232 aa  54.7  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0866  DNA polymerase III, alpha subunit  30.36 
 
 		 1476 aa  54.3  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672697 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2838  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.64 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0462127 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1310  DNA polymerase III, alpha subunit  29.07 
 
 		 1510 aa  54.3  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  32.41 
 
 		 1367 aa  54.3  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  32.41 
 
 		 1367 aa  54.3  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04615  putative DNA polymerase III alpha subunit  29.82 
 
 		 1454 aa  53.1  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1831  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.01 
 
 		 240 aa  52.8  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0389617 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1761  DNA polymerase III, epsilon chain  29.66 
 
 		 236 aa  52.8  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0426  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.66 
 
 		 232 aa  52.8  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.32865  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2648  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.04 
 
 		 769 aa  53.1  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0262  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.32 
 
 		 243 aa  52.8  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1505  putative sensor with HAMP domain  29.2 
 
 		 616 aa  52.8  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0470  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.45 
 
 		 228 aa  52.4  0.000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0352  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.57 
 
 		 426 aa  52.4  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0371  DNA polymerase III, alpha subunit  30.29 
 
 		 1485 aa  52  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0251  exonuclease  26.67 
 
 		 256 aa  52  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4913  DNA polymerase III subunit epsilon  25.19 
 
 		 389 aa  52  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  hitchhiker  0.00553803 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0028  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.07 
 
 		 237 aa  52  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2828  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.91 
 
 		 234 aa  52  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.37287  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3970  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.52 
 
 		 406 aa  51.6  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.126437  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0866  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.62 
 
 		 204 aa  51.6  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.183272 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2256  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.19 
 
 		 234 aa  51.6  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.313606 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1592  DNA polymerase III, epsilon subunit:DNA polymerase 3, epsilon subunit  34.19 
 
 		 238 aa  51.6  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2765  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.15 
 
 		 225 aa  51.2  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0720  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.36 
 
 		 267 aa  51.2  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.387284  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3631  DNA polymerase III subunit epsilon  34.86 
 
 		 315 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.095912  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1041  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.08 
 
 		 241 aa  50.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1633  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.02 
 
 		 721 aa  50.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1553  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.77 
 
 		 462 aa  50.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0294191  normal  0.0154238 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0115  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.92 
 
 		 239 aa  50.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196999  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9062  DNA-directed DNA polymerase  29.29 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  29.09 
 
 		 1390 aa  51.2  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3316  DNA polymerase III subunit epsilon  33.94 
 
 		 315 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3719  DNA polymerase III subunit epsilon  27.89 
 
 		 315 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0714  exonuclease  26.27 
 
 		 516 aa  50.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1662  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.19 
 
 		 232 aa  50.1  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.862026 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3297  DNA polymerase III subunit epsilon  34.86 
 
 		 315 aa  49.7  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.413632  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1618  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.16 
 
 		 234 aa  50.1  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.910547  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0006  DNA polymerase III subunit epsilon  23.94 
 
 		 236 aa  50.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1597  DNA polymerase III subunit epsilon  33.94 
 
 		 315 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0450283  hitchhiker  0.0000576312 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2298  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.83 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.207631 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4282  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.07 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0555283 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1383  exonuclease  25.35 
 
 		 181 aa  49.7  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3404  DNA polymerase III subunit epsilon  33.94 
 
 		 315 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3366  DNA polymerase III subunit epsilon  33.94 
 
 		 315 aa  49.3  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146706  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3622  DNA polymerase III subunit epsilon  33.94 
 
 		 315 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000564162 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1278  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.73 
 
 		 238 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3672  DNA polymerase III subunit epsilon  33.94 
 
 		 315 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.22056  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2021  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.66 
 
 		 238 aa  49.3  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1818  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.42 
 
 		 180 aa  49.3  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.562654 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0501  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.89 
 
 		 238 aa  49.7  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.872409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2815  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.07 
 
 		 239 aa  49.3  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3637  DNA polymerase III subunit epsilon  33.94 
 
 		 315 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00085894  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2129  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.67 
 
 		 547 aa  49.3  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165153  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2260  DNA polymerase III subunit epsilon  34.82 
 
 		 299 aa  49.3  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.155641  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2673  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.15 
 
 		 237 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.510131 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3482  DNA polymerase III subunit epsilon  24.52 
 
 		 242 aa  49.3  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1991  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.12 
 
 		 243 aa  48.9  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.886511  normal  0.0774886 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1880  DNA-directed DNA polymerase  25.27 
 
 		 242 aa  48.9  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0115193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0421  helicase/exonuclease  25.87 
 
 		 870 aa  48.5  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1899  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.48 
 
 		 956 aa  48.5  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589249 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1680  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.34 
 
 		 449 aa  48.5  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2978  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.81 
 
 		 230 aa  48.1  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2479  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.19 
 
 		 209 aa  48.1  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.114272  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.47 
 
 		 565 aa  47.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3777  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.52 
 
 		 722 aa  47.4  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1965  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.07 
 
 		 459 aa  47.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.249813  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2858  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  31.82 
 
 		 198 aa  47  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>