110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0022 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0022  ATP/GTP-binding motif-containing protein  100 
 
 		 219 aa  437  9.999999999999999e-123  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.450925  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0146  ATP/GTP-binding motif-containing protein  64.06 
 
 		 219 aa  289  2e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.241583  normal  0.100532 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0706  ATP/GTP-binding motif-containing protein  64.52 
 
 		 219 aa  289  3e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1757  ATP/GTP-binding motif-containing protein  63.59 
 
 		 219 aa  286  1e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.850088  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0929  hypothetical protein  52.07 
 
 		 225 aa  206  3e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3130  tRNA 2-selenouridine synthase  33.09 
 
 		 358 aa  68.6  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000658834  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0985  tRNA 2-selenouridine synthase  36.02 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3859  tRNA 2-selenouridine synthase  30.64 
 
 		 353 aa  62  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2327  tRNA 2-selenouridine synthase  39.02 
 
 		 356 aa  62.4  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2041  tRNA 2-selenouridine synthase  38.21 
 
 		 356 aa  62  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2199  2-selenouridine synthase  28.92 
 
 		 281 aa  61.6  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.569831 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0948  tRNA 2-selenouridine synthase  31.3 
 
 		 338 aa  59.3  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0113987  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0816  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 365 aa  58.2  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.400282  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2715  tRNA 2-selenouridine synthase  32.31 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370816 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0301  tRNA 2-selenouridine synthase  34.75 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.812118  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3480  tRNA 2-selenouridine synthase  31.9 
 
 		 373 aa  57  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.54526 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2244  tRNA 2-selenouridine synthase  35.09 
 
 		 350 aa  57  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.590434  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0822  tRNA 2-selenouridine synthase  34.13 
 
 		 370 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0932  tRNA 2-selenouridine synthase  31.9 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0754  tRNA 2-selenouridine synthase  31.9 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0765  tRNA 2-selenouridine synthase  31.9 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3113  tRNA 2-selenouridine synthase  32.2 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.227771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0849  tRNA 2-selenouridine synthase  34.13 
 
 		 370 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43270  tRNA 2-selenouridine synthase  27.47 
 
 		 369 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.829954 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1434  tRNA 2-selenouridine synthase  34.17 
 
 		 332 aa  55.8  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.719494  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3699  tRNA 2-selenouridine synthase  36.13 
 
 		 366 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.919346 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1488  tRNA 2-selenouridine synthase  33.05 
 
 		 375 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489913  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09351  tRNA 2-selenouridine synthase  32.69 
 
 		 346 aa  55.1  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1933  tRNA 2-selenouridine synthase  29.92 
 
 		 375 aa  55.1  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.806249  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0608  tRNA 2-selenouridine synthase  34.17 
 
 		 332 aa  54.3  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0278  tRNA 2-selenouridine synthase  26.32 
 
 		 344 aa  54.7  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3032  tRNA 2-selenouridine synthase  27.17 
 
 		 352 aa  54.7  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000366048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2556  tRNA 2-selenouridine synthase  37.5 
 
 		 355 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09341  tRNA 2-selenouridine synthase  33.33 
 
 		 346 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4364  tRNA 2-selenouridine synthase  33.07 
 
 		 365 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.307655  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4284  rhodanese-like protein  40.18 
 
 		 339 aa  53.9  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00812807 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0521  tRNA 2-selenouridine synthase  35.04 
 
 		 334 aa  54.3  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1349  tRNA 2-selenouridine synthase  28 
 
 		 356 aa  53.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.462447  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2454  tRNA 2-selenouridine synthase  32.26 
 
 		 373 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.156444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1508  tRNA 2-selenouridine synthase  33.05 
 
 		 375 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.154037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6564  tRNA 2-selenouridine synthase  37.5 
 
 		 355 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0745888  hitchhiker  0.00486619 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3301  tRNA 2-selenouridine synthase  31.9 
 
 		 353 aa  53.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0230491  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2719  tRNA 2-selenouridine synthase  32.41 
 
 		 372 aa  53.1  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422567 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3666  tRNA 2-selenouridine synthase  30.71 
 
 		 356 aa  53.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383889  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0863  tRNA 2-selenouridine synthase  30.22 
 
 		 370 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0875  tRNA 2-selenouridine synthase  33.97 
 
 		 347 aa  52.8  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3656  tRNA 2-selenouridine synthase  23.92 
 
 		 371 aa  52.8  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.167107 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1645  tRNA 2-selenouridine synthase  31.39 
 
 		 377 aa  52.4  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2803  tRNA 2-selenouridine synthase  31.03 
 
 		 349 aa  52.4  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0620  tRNA 2-selenouridine synthase  31.03 
 
 		 359 aa  52.4  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1022  tRNA 2-selenouridine synthase  31.06 
 
 		 358 aa  51.6  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.239082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2423  tRNA 2-selenouridine synthase  36.84 
 
 		 353 aa  51.6  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2691  tRNA 2-selenouridine synthase  30.15 
 
 		 346 aa  50.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.7307300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3629  tRNA 2-selenouridine synthase  26.37 
 
 		 369 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0928  tRNA 2-selenouridine synthase  32.52 
 
 		 327 aa  50.8  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1190  tRNA 2-selenouridine synthase  29.91 
 
 		 344 aa  50.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000287258  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1757  tRNA 2-selenouridine synthase  28.04 
 
 		 346 aa  50.4  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3754  tRNA 2-selenouridine synthase  26.39 
 
 		 367 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0900033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3539  tRNA 2-selenouridine synthase  27.08 
 
 		 349 aa  50.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2384  tRNA 2-selenouridine synthase  28.57 
 
 		 345 aa  49.7  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.55321e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2386  tRNA 2-selenouridine synthase  36.17 
 
 		 335 aa  49.7  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1569  tRNA 2-selenouridine synthase  31.62 
 
 		 375 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.866156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1525  tRNA 2-selenouridine synthase  29.41 
 
 		 346 aa  49.7  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0672649  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4991  tRNA 2-selenouridine synthase  37.35 
 
 		 358 aa  49.3  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0663375  normal  0.0359024 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1023  tRNA 2-selenouridine synthase  26.06 
 
 		 374 aa  49.7  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00249135  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1161  tRNA 2-selenouridine synthase  34.43 
 
 		 364 aa  49.7  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.965775  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3349  tRNA 2-selenouridine synthase  31.09 
 
 		 353 aa  49.7  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.382984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1112  tRNA 2-selenouridine synthase  31.62 
 
 		 375 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1592  tRNA 2-selenouridine synthase  31.62 
 
 		 375 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0414382  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1955  tRNA 2-selenouridine synthase  31.36 
 
 		 336 aa  48.9  0.00006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.190021  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10190  tRNA 2-selenouridine synthase  30.71 
 
 		 370 aa  48.9  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.320471  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0697  tRNA 2-selenouridine synthase  32.26 
 
 		 366 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.710906 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2383  tRNA 2-selenouridine synthase  26.77 
 
 		 346 aa  48.1  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0160  tRNA 2-selenouridine synthase  34.15 
 
 		 365 aa  48.1  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.334237  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5476  tRNA 2-selenouridine synthase  38.27 
 
 		 353 aa  47.8  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.361534 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0043  tRNA 2-selenouridine synthase  41.1 
 
 		 346 aa  47.8  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0136  tRNA 2-selenouridine synthase  31.58 
 
 		 350 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.303131  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4730  tRNA 2-selenouridine synthase  29.1 
 
 		 375 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.913097  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0174  tRNA 2-selenouridine synthase  32.52 
 
 		 384 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0169  tRNA 2-selenouridine synthase  32.52 
 
 		 369 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0272703 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1887  tRNA 2-selenouridine synthase  34.12 
 
 		 352 aa  47  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227051  normal  0.457474 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1622  tRNA 2-selenouridine synthase  28.93 
 
 		 365 aa  47  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4183  tRNA 2-selenouridine synthase  32.26 
 
 		 368 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2084  tRNA 2-selenouridine synthase  39.24 
 
 		 359 aa  46.6  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.441545 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4081  tRNA 2-selenouridine synthase  32.26 
 
 		 368 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1272  tRNA 2-selenouridine synthase  28.57 
 
 		 347 aa  46.2  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1545  tRNA 2-selenouridine synthase  31.93 
 
 		 347 aa  46.2  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.256667  normal  0.0827797 
 
 
-
 
NC_002950  PG1887  tRNA 2-selenouridine synthase  37.35 
 
 		 344 aa  45.8  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.739187 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0175  tRNA 2-selenouridine synthase  28.81 
 
 		 365 aa  45.8  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0794  hypothetical protein  26.88 
 
 		 366 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1198  tRNA 2-selenouridine synthase  30.68 
 
 		 347 aa  45.4  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1926  tRNA 2-selenouridine synthase  32.53 
 
 		 353 aa  45.4  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0172  tRNA 2-selenouridine synthase  32.26 
 
 		 368 aa  45.4  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3478  tRNA 2-selenouridine synthase  24.16 
 
 		 348 aa  45.4  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.527623 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0769  tRNA 2-selenouridine synthase  30.23 
 
 		 372 aa  44.7  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.649423  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0227  tRNA 2-selenouridine synthase  32.77 
 
 		 367 aa  45.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.254912  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0523  tRNA 2-selenouridine synthase  38.46 
 
 		 365 aa  44.3  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07681  tRNA 2-selenouridine synthase  30.08 
 
 		 350 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.104212  normal  0.0677332 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07211  tRNA 2-selenouridine synthase  44.64 
 
 		 347 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.989493  normal  0.414024 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0195  tRNA 2-selenouridine synthase  31.75 
 
 		 376 aa  44.3  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>