More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0013 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0013  signal transduction protein  100 
 
 
127 aa  254  3e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.636073  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0155  signal transduction protein  66.67 
 
 
126 aa  185  2e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.383666  normal  0.0532643 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0715  signal transduction protein  66.67 
 
 
128 aa  184  4e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1747  signal transduction protein  65.08 
 
 
126 aa  180  5.0000000000000004e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0729  signal transduction protein  41.09 
 
 
132 aa  103  7e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0315509  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  32.54 
 
 
215 aa  74.3  0.0000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  31.75 
 
 
215 aa  73.2  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  35.82 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  30.58 
 
 
250 aa  64.3  0.0000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  30.3 
 
 
211 aa  62.4  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  33.08 
 
 
214 aa  62  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  30.16 
 
 
214 aa  61.6  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  31.78 
 
 
215 aa  61.2  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0707  CBS domain containing membrane protein  30.83 
 
 
221 aa  60.8  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  28.57 
 
 
212 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  29.32 
 
 
256 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  29.32 
 
 
212 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0262  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  28.69 
 
 
586 aa  59.7  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141081  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  29.17 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  30.83 
 
 
219 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1479  signal-transduction protein  30.65 
 
 
238 aa  58.5  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.543565  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1169  CBS domain-containing protein  26.98 
 
 
214 aa  57  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.137259  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  29.13 
 
 
211 aa  57  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  29.92 
 
 
216 aa  57  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  29.63 
 
 
216 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2009  CBS domain-containing protein  31.25 
 
 
143 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.416479  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  27.27 
 
 
230 aa  56.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  29.32 
 
 
223 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1474  signal transduction protein  31.09 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  29.13 
 
 
281 aa  55.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0183  hypothetical protein  28.12 
 
 
165 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0517579 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  27.07 
 
 
145 aa  54.3  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  26.83 
 
 
867 aa  53.9  0.0000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1097  hypothetical protein  27.41 
 
 
222 aa  53.9  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1725  signal-transduction protein  29.69 
 
 
155 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.467768 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1899  putative signal transduction protein with CBS domains  30.16 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3271  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.73 
 
 
143 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  27.73 
 
 
145 aa  52.8  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2290  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  25 
 
 
589 aa  53.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  27.41 
 
 
225 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  28.15 
 
 
216 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3056  putative signal-transduction protein with CBS domains  30.25 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185367  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  30.53 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  27.82 
 
 
224 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  30.95 
 
 
877 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  24 
 
 
258 aa  52  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  27.82 
 
 
209 aa  52  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5608  signal transduction protein  26.36 
 
 
151 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606425  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  32.26 
 
 
164 aa  51.6  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0401  signal-transduction protein  28.26 
 
 
302 aa  52  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2208  CBS domain-containing protein  26.98 
 
 
221 aa  51.6  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000650498  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  24.24 
 
 
320 aa  51.2  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1182  putative transcriptional regulator, XRE family  29.66 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000705125  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  40.74 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  30 
 
 
262 aa  50.4  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1085  putative signal transduction protein with CBS domains  26.02 
 
 
300 aa  50.4  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.971141  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3107  hypothetical protein  29.41 
 
 
137 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0515224  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  25.93 
 
 
225 aa  50.1  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1585  CBS domain containing protein  25.93 
 
 
217 aa  50.1  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0307  signal-transduction protein  27.78 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.400951 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  25.41 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  29.13 
 
 
208 aa  50.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  28.1 
 
 
614 aa  50.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2607  CBS domain containing membrane protein  25.55 
 
 
384 aa  49.7  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00560791  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  28.46 
 
 
300 aa  50.1  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.548765 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0942  CBS domain containing membrane protein  27.64 
 
 
277 aa  49.3  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0100206  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  27.56 
 
 
162 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4568  putative signal transduction protein with CBS domains  28.12 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0446023  normal  0.17585 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0072  CBS domain containing membrane protein  26.81 
 
 
398 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1776  CBS domain containing membrane protein  27.54 
 
 
381 aa  49.3  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17343  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2153  signal-transduction protein  27.93 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.268313  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3706  CBS domain containing protein  29.84 
 
 
208 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312715  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  27.54 
 
 
426 aa  48.9  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0661  signal-transduction protein  27.34 
 
 
129 aa  48.9  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0346092  normal  0.201572 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25.83 
 
 
605 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  30.08 
 
 
769 aa  48.9  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4435  putative signal-transduction protein with CBS domains  28.12 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  42.59 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1119  signal transduction protein  28 
 
 
295 aa  49.3  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.700202 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3652  CBS domain containing protein  29.84 
 
 
208 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2061  protein of unknown function CP12  31.15 
 
 
203 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0774  putative signal transduction protein with CBS domains  28.57 
 
 
143 aa  48.9  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  24.81 
 
 
279 aa  48.5  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1407  signal transduction protein  27.64 
 
 
322 aa  48.5  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  27.07 
 
 
386 aa  48.5  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  28.46 
 
 
615 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  22.4 
 
 
269 aa  48.5  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3089  sensory box protein  27.73 
 
 
858 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.168178  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  29.17 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  24.81 
 
 
232 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3508  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.09 
 
 
498 aa  48.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  28.91 
 
 
208 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0446  putative signal transduction protein with CBS domains  31.09 
 
 
136 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0212406  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  29.75 
 
 
618 aa  48.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  30.83 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0816417 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1555  signal transduction protein  30 
 
 
286 aa  47.8  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1676  signal-transduction protein  30.83 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.780489  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0035  signal-transduction protein  26.92 
 
 
138 aa  47.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000525301  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3667  cyclic nucleotide-binding protein  27.05 
 
 
606 aa  47.8  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.773951  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  29.73 
 
 
688 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>