297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_R0067 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_R0027  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  178  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.5818  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRAt11  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  178  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644598  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1009  tRNA-Ser  100 
 
 
92 bp  178  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0067  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  178  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0911  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  178  1e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.531015  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0025  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  178  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00148437  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0057  tRNA-Ser  98.89 
 
 
90 bp  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0033  tRNA-Ser  98.89 
 
 
90 bp  170  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56325  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0040  tRNA-Ser  98.89 
 
 
90 bp  170  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.140248 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0060  tRNA-Ser  96.51 
 
 
90 bp  147  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0004  tRNA-Ser  94.44 
 
 
90 bp  139  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.888303  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0014  tRNA-Ser  93.33 
 
 
90 bp  131  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.359735  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0016  tRNA-Ser  93.41 
 
 
91 bp  125  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2302  tRNA-Ser  93.1 
 
 
92 bp  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000177345  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0008  tRNA-Ser  92.22 
 
 
90 bp  123  8e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27190  tRNA-Ser  94.74 
 
 
87 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000521392  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0015  tRNA-Ser  91.11 
 
 
90 bp  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6042  tRNA-Ser  91.11 
 
 
90 bp  115  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.516287  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0016  tRNA-Ser  91.11 
 
 
90 bp  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266045  normal  0.745909 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0008  tRNA-Ser  91.11 
 
 
90 bp  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289156  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60240  tRNA-Ser  94.59 
 
 
87 bp  115  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268246  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0033  tRNA-Ser  94.59 
 
 
90 bp  115  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0025  tRNA-Ser  91.11 
 
 
90 bp  115  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.217878  normal  0.142788 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0017  tRNA-Ser  91.11 
 
 
90 bp  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  91.21 
 
 
91 bp  109  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.179799  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt13  tRNA-Ser  91.11 
 
 
88 bp  109  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt13  tRNA-Ser  91.11 
 
 
88 bp  109  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0047  tRNA-Ser  91.21 
 
 
91 bp  109  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.018693  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0021  tRNA-Ser  91.21 
 
 
91 bp  109  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0717904 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0029  tRNA-Ser  91.21 
 
 
91 bp  109  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.287395  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4596  tRNA-Ser  90.7 
 
 
90 bp  107  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0025  tRNA-Ser  90 
 
 
90 bp  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4314  tRNA-Ser  90 
 
 
90 bp  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.650713  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0034  tRNA-Ser  90 
 
 
90 bp  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0051  tRNA-Ser  89.66 
 
 
90 bp  101  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00319398  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0055  tRNA-Ser  89.66 
 
 
90 bp  101  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0044  tRNA-Ser  89.66 
 
 
90 bp  101  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0046  tRNA-Ser  90.11 
 
 
91 bp  101  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0006  tRNA-Ser  89.66 
 
 
90 bp  101  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0040  tRNA-Ser  89.66 
 
 
90 bp  101  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0064  tRNA-Ser  89.53 
 
 
90 bp  99.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0051    88.89 
 
 
90 bp  99.6  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA6  tRNA-Ser  88.89 
 
 
90 bp  99.6  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0015  tRNA-Ser  88.89 
 
 
90 bp  99.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0069  tRNA-Ser  88.89 
 
 
90 bp  99.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.234081 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0023  tRNA-Ser  88.89 
 
 
90 bp  99.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.928958  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0059  tRNA-Ser  88.89 
 
 
90 bp  99.6  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00925485  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0048  tRNA-Ser  88.89 
 
 
90 bp  99.6  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0798542  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0047  tRNA-Ser  88.89 
 
 
90 bp  99.6  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0062  tRNA-Ser  89.53 
 
 
90 bp  99.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.633699 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0022  tRNA-Ser  89.13 
 
 
92 bp  97.6  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0041  tRNA-Ser  89.01 
 
 
91 bp  93.7  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.142753  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0037  tRNA-Ser  89.01 
 
 
91 bp  93.7  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0675311 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNASerVIMSS1309205  tRNA-Ser  88.51 
 
 
87 bp  93.7  7e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.98258  normal  0.324955 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0005  tRNA-Ser  88.51 
 
 
87 bp  93.7  7e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.087026  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0006  tRNA-Ser  89.01 
 
 
91 bp  93.7  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0057  tRNA-Ser  88.51 
 
 
90 bp  93.7  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154466  normal  0.0269773 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0006  tRNA-Ser  89.01 
 
 
91 bp  93.7  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.22052e-25 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0004  tRNA-Ser  87.78 
 
 
90 bp  91.7  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000198819  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0012  tRNA-Ser  90.54 
 
 
87 bp  91.7  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0017  tRNA-Ser  88.37 
 
 
90 bp  91.7  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.576804  normal  0.691356 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0032  tRNA-Ser  87.78 
 
 
90 bp  91.7  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.945587  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07713  tRNA-Ser  91.03 
 
 
88 bp  91.7  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0015  tRNA-Ser  87.78 
 
 
90 bp  91.7  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109725  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0002  tRNA-Ser  90.32 
 
 
93 bp  89.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0002  tRNA-Ser  90.32 
 
 
93 bp  89.7  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000353165 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0042  tRNA-Ser  92.31 
 
 
90 bp  89.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.121503  normal  0.0171671 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0043  tRNA-Ser  88.51 
 
 
88 bp  87.7  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.027845  normal  0.0982553 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tSer01  tRNA-Ser  88.75 
 
 
93 bp  87.7  4e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0568907  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0044  tRNA-Ser  88.51 
 
 
88 bp  87.7  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0279967  normal  0.0982553 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0017  tRNA-Ser  90.28 
 
 
90 bp  87.7  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00284743  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0041  tRNA-Ser  87.91 
 
 
91 bp  85.7  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.592847  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4234  tRNA-Ser  87.36 
 
 
92 bp  85.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.460251  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0023  tRNA-Ser  87.36 
 
 
90 bp  85.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0021  tRNA-Ser  87.36 
 
 
87 bp  85.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.146581  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNASerVIMSS1309091  tRNA-Ser  87.36 
 
 
87 bp  85.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0008  tRNA-Ser  87.95 
 
 
90 bp  85.7  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1071  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0056  tRNA-Ser  87.91 
 
 
91 bp  85.7  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607701  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2453  tRNA-Ser  87.36 
 
 
92 bp  85.7  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0002  tRNA-Ser  87.91 
 
 
91 bp  85.7  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00130042  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2051  tRNA-Ser  88.46 
 
 
90 bp  83.8  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244521  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  88.46 
 
 
90 bp  83.8  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1941  tRNA-Ser  88.46 
 
 
90 bp  83.8  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2014  tRNA-Ser  88.46 
 
 
90 bp  83.8  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0295784  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1078  tRNA-Ser  88.46 
 
 
90 bp  83.8  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0381421  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0785  tRNA-Ser  88.46 
 
 
90 bp  83.8  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0533  tRNA-Ser  88.46 
 
 
90 bp  83.8  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0631  tRNA-Ser  88.46 
 
 
90 bp  83.8  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.985518  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0057  tRNA-Ser  89.25 
 
 
93 bp  81.8  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.328322  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0004  tRNA-Ser  89.25 
 
 
93 bp  81.8  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000327404  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0048  tRNA-Ser  89.25 
 
 
93 bp  81.8  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000235294  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0058  tRNA-Ser  89.25 
 
 
93 bp  81.8  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.325073  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0049  tRNA-Ser  87.36 
 
 
88 bp  79.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000614407  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0040  tRNA-Ser  87.36 
 
 
88 bp  79.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.469236  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0048  tRNA-Ser  87.36 
 
 
88 bp  79.8  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.17387  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0059  tRNA-Ser  87.36 
 
 
88 bp  79.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00759198  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  88.3 
 
 
94 bp  77.8  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4233  tRNA-Ser  86.21 
 
 
92 bp  77.8  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0022  tRNA-Ser  86.21 
 
 
90 bp  77.8  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.058085  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0024  tRNA-Ser  86.81 
 
 
91 bp  77.8  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>