114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_R0015 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_R0015  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.914639  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0034  tRNA-Tyr  91.76 
 
 		 85 bp  113  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0365863  normal  0.384153 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0036  tRNA-Tyr  91.76 
 
 		 85 bp  113  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.391408 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0046  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 86 bp  103  6e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.000000858289  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0068  tRNA-Tyr  90.7 
 
 		 86 bp  99.6  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.544581  normal  0.0861147 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0058  tRNA-Tyr  90.7 
 
 		 86 bp  99.6  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1215  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 87 bp  97.6  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0016  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0163881 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0034  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4565  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795414  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0060  tRNA-Tyr  93.06 
 
 		 86 bp  95.6  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00028228  normal  0.398472 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t23  tRNA-Tyr  89.02 
 
 		 82 bp  91.7  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.676233  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0058  tRNA-Tyr  89.53 
 
 		 86 bp  91.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0117646  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0059  tRNA-Tyr  89.53 
 
 		 86 bp  91.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0060  tRNA-Tyr  89.53 
 
 		 86 bp  91.7  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000231954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0058  tRNA-Tyr  90.24 
 
 		 86 bp  91.7  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0057  tRNA-Tyr  89.53 
 
 		 86 bp  91.7  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.658819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0025  tRNA-Tyr  89.53 
 
 		 86 bp  91.7  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.578313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0003  tRNA-Tyr  89.53 
 
 		 86 bp  91.7  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0047  tRNA-Tyr  89.53 
 
 		 86 bp  91.7  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.460212  normal  0.496186 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0063  tRNA-Tyr  89.53 
 
 		 86 bp  91.7  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0007  tRNA-Tyr  88.24 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000157532  hitchhiker  0.000000000121254 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0046  tRNA-Tyr  92.19 
 
 		 82 bp  87.7  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0017  tRNA-Tyr  89.33 
 
 		 85 bp  85.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.411262  normal  0.2939 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0016  tRNA-Tyr  89.33 
 
 		 85 bp  85.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Tyr-3  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 86 bp  83.8  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000509746  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3797  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 86 bp  83.8  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000392981  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3087  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 86 bp  83.8  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000100368  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0079  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 86 bp  83.8  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0061  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 86 bp  83.8  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.0000000782814  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0012  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 86 bp  83.8  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000828702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0011  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 86 bp  83.8  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000000561505  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3189  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 86 bp  83.8  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000533959  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1903  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 86 bp  83.8  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000431131  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3765  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 86 bp  83.8  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3827  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 86 bp  83.8  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.400436  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3458  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 86 bp  83.8  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000255407  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0009  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 86 bp  83.8  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000816684  normal  0.0119926 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0012  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 86 bp  83.8  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000122749  normal  0.1453 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0012  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 86 bp  83.8  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000498022  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0072  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 86 bp  83.8  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000172192  normal  0.224883 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0059  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 86 bp  83.8  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111463  hitchhiker  0.000000693164 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0560  tRNA-Tyr  88.24 
 
 		 84 bp  81.8  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000480165  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0007  tRNA-Tyr  87.06 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000312079  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0038  tRNA-Tyr  90.62 
 
 		 82 bp  79.8  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.105251 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0036  tRNA-Tyr  90.62 
 
 		 85 bp  79.8  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.45022  normal  0.113165 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0029  tRNA-Tyr  90.62 
 
 		 85 bp  79.8  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0020  tRNA-Tyr  87.95 
 
 		 83 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000230184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0035  tRNA-Tyr  88.73 
 
 		 82 bp  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.923295  normal  0.851315 
 
 
-
 
NC_003295  RS05585  tRNA-Tyr  87.21 
 
 		 86 bp  75.8  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000486194  normal  0.206056 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0050  tRNA-Tyr  87.8 
 
 		 86 bp  75.8  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00161887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0050  tRNA-Tyr  87.21 
 
 		 86 bp  75.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.160697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0053  tRNA-Tyr  87.21 
 
 		 86 bp  75.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798877 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0014  tRNA-Tyr  95.56 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000000194257  hitchhiker  0.00490505 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0042  tRNA-Tyr  89.06 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.755335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0020  tRNA-Tyr  86.21 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0033  tRNA-Tyr  89.06 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0042  tRNA-Tyr  88.06 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0015  tRNA-Tyr  88.06 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNATyrVIMSS1309080  tRNA-Tyr  88.06 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNATyrVIMSS1309112  tRNA-Tyr  88.06 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.722386  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNATyrVIMSS1309201  tRNA-Tyr  88.06 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0854141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNATyrVIMSS1309156  tRNA-Tyr  88.06 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0050  tRNA-Tyr  86.05 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.11931  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0003  tRNA-Tyr  86.05 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0022  tRNA-Tyr  86.57 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0313146  normal  0.1141 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNATyrVIMSS1309298  tRNA-Tyr  86.57 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0675624 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNATyrVIMSS1309353  tRNA-Tyr  86.57 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09740  tRNA-Tyr  86.89 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000000943193  hitchhiker  0.0000123318 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0006  tRNA-Tyr  93.18 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0005  tRNA-Tyr  93.18 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.1889 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0005  tRNA-Tyr  93.18 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.998784  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0012  tRNA-Tyr  89.29 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000201631  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0038  tRNA-Tyr  89.29 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000481051  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0054  tRNA-Tyr  90.7 
 
 		 82 bp  54  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.593906  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0065  tRNA-Tyr  87.27 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135481  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0024  tRNA-Tyr  96.77 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.640159  normal  0.173611 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0002  tRNA-Tyr  96.77 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0090  tRNA-Tyr  87.04 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000140728  hitchhiker  0.00740419 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0047  tRNA-Tyr  85.25 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000031585  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0012  tRNA-Tyr  90.24 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0045  tRNA-Tyr  89.58 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000472337  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0056  tRNA-Tyr  89.58 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00201285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0731  tRNA-Tyr  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08620  tRNA-Tyr  86.89 
 
 		 84 bp  50.1  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000490301  hitchhiker  0.0000012455 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0037  tRNA-Tyr  82.35 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0466069  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t05  tRNA-Tyr  91.67 
 
 		 81 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000929423  unclonable  0.000000191468 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0023  tRNA-Tyr  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0238179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0028  tRNA-Tyr  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000249872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0009  tRNA-Tyr  90.91 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0055  tRNA-Tyr  90.91 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0006  tRNA-Tyr  90.91 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0014  tRNA-Tyr  91.67 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000673515  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0002  tRNA-Tyr  90.91 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000899619  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0017  tRNA-Tyr  91.67 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0316061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0086  tRNA-Tyr  91.67 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000985673  normal  0.992402 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0054  tRNA-Tyr  87.5 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000219013  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0054  tRNA-Tyr  87.5 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000000756603  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna4  tRNA-Tyr  87.5 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.619166  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0015  tRNA-Tyr  87.5 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000666826  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>