76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4572 on replicon NC_008244
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008244  Meso_4572  hypothetical protein  100 
 
 
495 aa  1005    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00813276  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0359  hypothetical protein  57.6 
 
 
487 aa  566  1e-160  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.296452  normal  0.0315828 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1368  hypothetical protein  56.1 
 
 
486 aa  541  1e-153  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0471  hypothetical protein  46.64 
 
 
544 aa  443  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.565409  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2306  hypothetical protein  42.72 
 
 
588 aa  437  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.816445  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2474  hypothetical protein  46.19 
 
 
551 aa  396  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.671413  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0171  sulfurtransferase DndC  44.49 
 
 
507 aa  397  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0833  hypothetical protein  41.83 
 
 
522 aa  390  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1932  hypothetical protein  43.49 
 
 
518 aa  378  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0230474  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2209  hypothetical protein  41.98 
 
 
566 aa  373  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2458  hypothetical protein  43.44 
 
 
538 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2401  hypothetical protein  42.98 
 
 
528 aa  360  3e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0011  hypothetical protein  42.5 
 
 
484 aa  356  5e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4840  hypothetical protein  41.98 
 
 
541 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.567316 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0739  hypothetical protein  42.32 
 
 
496 aa  350  3e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25742  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2950  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase  41.29 
 
 
391 aa  282  7.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000917196  normal  0.689261 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0620  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  41.19 
 
 
378 aa  277  4e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1300  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.97 
 
 
342 aa  221  3e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2353  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.62 
 
 
335 aa  177  5e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0038  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  31.4 
 
 
590 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000866534 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0104  hypothetical protein  31.4 
 
 
600 aa  167  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.149062  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0061  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  36.36 
 
 
310 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0021  hypothetical protein  31.08 
 
 
663 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4980  hypothetical protein  32.09 
 
 
604 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.519167  hitchhiker  0.00845932 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6782  hypothetical protein  33.66 
 
 
600 aa  113  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0703339  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0317  hypothetical protein  29.86 
 
 
607 aa  108  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2713  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.69 
 
 
803 aa  107  5e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.92017 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5041  hypothetical protein  31.6 
 
 
632 aa  100  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0110707  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4327  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.42 
 
 
612 aa  97.4  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1053  hypothetical protein  28.57 
 
 
574 aa  95.9  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0944363  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0129  hypothetical protein  29.81 
 
 
817 aa  93.2  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6191  hypothetical protein  29.79 
 
 
597 aa  92.8  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.450588 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5337  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.62 
 
 
608 aa  92.4  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0127085  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5743  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.68 
 
 
419 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.613269  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0022  hypothetical protein  24.55 
 
 
388 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0523508  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1110  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.05 
 
 
392 aa  87.8  4e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00714375  hitchhiker  0.00000984633 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4334  hypothetical protein  27.57 
 
 
598 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6014  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase (PAPS reductase)/FAD synthetase  26.62 
 
 
597 aa  80.9  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.605416  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4362  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.02 
 
 
531 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178305  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0827  hypothetical protein  27.4 
 
 
588 aa  68.2  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2578  hypothetical protein  26.72 
 
 
466 aa  68.2  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1177  hypothetical protein  27.17 
 
 
509 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112818  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1809  hypothetical protein  26.6 
 
 
592 aa  65.5  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000370304 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2713  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.43 
 
 
334 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2089  hypothetical protein  25.21 
 
 
469 aa  63.9  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2060  hypothetical protein  27.27 
 
 
594 aa  62.4  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.124935 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1596  hypothetical protein  27.45 
 
 
594 aa  61.6  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.37 
 
 
580 aa  58.5  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0248  hypothetical protein  28.81 
 
 
491 aa  57.4  0.0000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  23.95 
 
 
633 aa  56.2  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1263  hypothetical protein  27.27 
 
 
464 aa  55.5  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0437521  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1327  hypothetical protein  24.86 
 
 
667 aa  55.8  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1153  hypothetical protein  26.37 
 
 
469 aa  55.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1714  hypothetical protein  25 
 
 
512 aa  54.3  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.414906  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0188  hypothetical protein  24.49 
 
 
502 aa  54.3  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.882321 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0410  hypothetical protein  26.49 
 
 
472 aa  54.3  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0165126  hitchhiker  0.000394368 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0173  putative phage-related protein  31.21 
 
 
280 aa  53.5  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000630983 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1182  putative phage-related protein  31.21 
 
 
280 aa  53.5  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.225996  normal  0.11373 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0790  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.85 
 
 
784 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0748  hypothetical protein  23.88 
 
 
503 aa  51.2  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1725  hypothetical protein  28 
 
 
491 aa  50.1  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.830403  normal  0.95658 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1751  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.29 
 
 
723 aa  48.9  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.837837  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2943  hypothetical protein  24.79 
 
 
796 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  decreased coverage  0.00440971 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  24 
 
 
634 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0702  IbrA protein  24.51 
 
 
411 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.980382  normal  0.0561993 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0644  IbrA protein  24.51 
 
 
411 aa  45.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0717  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase (PAPS reductase)/FAD synthetase  24.51 
 
 
411 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1789  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  27.18 
 
 
267 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000000854791  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0943  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.1 
 
 
421 aa  45.1  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6216  hypothetical protein  27.18 
 
 
496 aa  44.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0763  IbrA protein  24.51 
 
 
411 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.216199  normal  0.291619 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0658  IbrA protein  24.51 
 
 
411 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4585  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.25 
 
 
279 aa  44.3  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0665  hypothetical protein  24.79 
 
 
614 aa  43.9  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.545372  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.56 
 
 
885 aa  43.9  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2091  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.88 
 
 
298 aa  43.5  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>