235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4558 on replicon NC_008243
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008243  Meso_4558  transposase  100 
 
 
215 aa  441  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5626  integrase catalytic region  50.8 
 
 
243 aa  202  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880162  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1668  transposase  50.75 
 
 
341 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.892331  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1660  transposase  50.25 
 
 
263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1573  integrase catalytic subunit  48.51 
 
 
238 aa  195  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5316  putative transposase  47.52 
 
 
238 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.110723  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5309  putative transposase  49.72 
 
 
212 aa  185  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4520  transposase  45.08 
 
 
228 aa  176  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163983  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7685  integrase catalytic region  46.84 
 
 
236 aa  176  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.686467 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4664  integrase catalytic region  43.52 
 
 
230 aa  175  5e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000673893  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4406  integrase catalytic region  43.52 
 
 
230 aa  175  5e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000104677  normal  0.339026 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4341  Transposase and inactivated derivatives-like protein  43.52 
 
 
230 aa  175  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209545  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4345  Transposase and inactivated derivatives-like protein  43.52 
 
 
230 aa  175  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.177177  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1851  transposase, putative  45.08 
 
 
228 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1855  transposase, putative  45.08 
 
 
228 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2883  ISSod8, transposase  45.11 
 
 
206 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0063  ISSod8, transposase  42.47 
 
 
185 aa  172  5e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.372655  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0105  ISSod8, transposase  42.47 
 
 
185 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5663  integrase catalytic region  45.13 
 
 
235 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884972 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5614  integrase catalytic region  45.64 
 
 
235 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5509  integrase catalytic region  46.32 
 
 
222 aa  170  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.384257 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5621  integrase catalytic region  45.13 
 
 
235 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1785  putative transposase  43.43 
 
 
228 aa  171  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.702349  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5656  integrase catalytic region  45.64 
 
 
235 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.0204963 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0085  ISSod8, transposase  43.5 
 
 
181 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0953687  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7114  transposase  40.7 
 
 
227 aa  160  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1747  hypothetical protein  42.71 
 
 
302 aa  159  4e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2937 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0897  hypothetical protein  42.93 
 
 
235 aa  158  5e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.116662 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5422  putative insertion sequence transposase-like protein  42.56 
 
 
250 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5438  putative insertion sequence transposase-like protein  42.56 
 
 
250 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7034  hypothetical protein  44.33 
 
 
250 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0794917  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6736  putative insertion sequence transposase-like protein  44.85 
 
 
250 aa  152  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2743  Integrase catalytic region  41.71 
 
 
238 aa  150  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.161234 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0219  hypothetical protein  42.41 
 
 
235 aa  150  1e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8630  Transposase and inactivated derivatives-like protein  41.63 
 
 
319 aa  150  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6108  hypothetical protein  42.42 
 
 
250 aa  149  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6131  Transposase and inactivated derivatives-like protein  42.42 
 
 
346 aa  149  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1866  putative insertion sequence transposase-like protein  43.81 
 
 
250 aa  149  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.308333  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1886  putative transposase  42.93 
 
 
250 aa  149  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0071  transposase  40.72 
 
 
224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.507355 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3886  putative insertion sequence transposase-like protein  41.18 
 
 
227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.829291  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3209  transposase  41.71 
 
 
218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262352  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0485  hypothetical protein  38.58 
 
 
235 aa  145  4.0000000000000006e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8070  transposase  40.21 
 
 
346 aa  145  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.837659  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5335  transposase  40.2 
 
 
254 aa  145  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5344  transposase  40.2 
 
 
254 aa  145  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5211  integrase catalytic subunit  40.2 
 
 
264 aa  145  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12008  normal  0.236418 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3803  putative insertion sequence transposase-like protein  40.21 
 
 
259 aa  144  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.6204 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1881  putative insertion sequence transposase-like protein  43.3 
 
 
246 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8531  hypothetical protein  42.27 
 
 
250 aa  143  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7500  transposase  38.46 
 
 
255 aa  143  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3336  IS240 transposase  43.71 
 
 
202 aa  141  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1619  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  41.58 
 
 
237 aa  141  9e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  41.05 
 
 
236 aa  139  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2851  putative transposase  40.1 
 
 
237 aa  139  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878699  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0078  IS26 transposase  41.03 
 
 
234 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.753409 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0048  IS26 transposase  41.03 
 
 
234 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000229018  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0055  IS26 transposase  41.03 
 
 
234 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0070  IS26 transposase  41.03 
 
 
234 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.321063 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0160  transposase InsB4 for insertion sequence IS26  41.03 
 
 
240 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0865619  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0096  IS26 transposase  41.03 
 
 
234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0040  IS26 transposase  41.03 
 
 
234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.318026 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0115  IS26 transposase  41.03 
 
 
240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.754112  normal  0.0114398 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0132  IS26 transposase  41.03 
 
 
240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.667104  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0116  IS26 transposase  41.03 
 
 
240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0605578 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1578  IS26 transposase  41.03 
 
 
234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0392285  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0149  IS26 transposase  41.03 
 
 
240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0014  IS26 transposase  41.03 
 
 
234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1583  IS26 transposase  41.03 
 
 
234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.736134  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1565  IS26 transposase  41.03 
 
 
234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106684  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0099  IS26 transposase  41.03 
 
 
234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0076  IS26 transposase  41.03 
 
 
234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.572199  normal  0.511731 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0156  IS26 transposase  41.03 
 
 
240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.374184  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0160  IS26 transposase  41.03 
 
 
240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0100115  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0033  transposase InsB1 for insertion sequence IS26  41.03 
 
 
240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.210279 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0035  transposase InsB2 for insertion sequence IS26  41.03 
 
 
240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.401823  normal  0.39623 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0159  transposase InsB3 for insertion sequence IS26  41.03 
 
 
240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432493  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0119  IS26 transposase  41.03 
 
 
240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.16763 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0136  IS26 transposase  41.03 
 
 
240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0122  IS26 transposase  41.03 
 
 
240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.559056 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4110  integrase  40 
 
 
236 aa  137  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0613  hypothetical protein  38.95 
 
 
235 aa  137  1e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5033  hypothetical protein  41.67 
 
 
250 aa  136  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4081  putative transposase  39.47 
 
 
224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4462  transposase  61.95 
 
 
128 aa  134  8e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.344074  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3358  integrase catalytic region  41.32 
 
 
198 aa  134  8e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C51  transposase  35.45 
 
 
226 aa  132  3e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8409  hypothetical protein  40.7 
 
 
250 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C44  transposase  34.92 
 
 
226 aa  131  7.999999999999999e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C41  transposase  35.45 
 
 
226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_52  transposase  35.9 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00159101  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2874  integrase catalytic region  40.54 
 
 
213 aa  129  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C32  transposase  34.92 
 
 
226 aa  129  3e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0008  IS431mec-like transposase  36.52 
 
 
224 aa  128  6e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297638  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A03  transposase  34.44 
 
 
226 aa  127  9.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136081  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A07  transposase  34.44 
 
 
226 aa  127  9.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00101418  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0541  transposase  34.44 
 
 
226 aa  127  9.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.509994  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0961  transposase  36.67 
 
 
226 aa  127  9.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000241394  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2808  integrase catalytic region  37.08 
 
 
224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0988586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0026  integrase catalytic region  36.52 
 
 
224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.509582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>