More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4534 on replicon NC_008243
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008243  Meso_4534  ABC transporter related  100 
 
 		 365 aa  746    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0251009  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2267  ABC transporter related  41.07 
 
 		 363 aa  271  9e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1308  ABC transporter related  41.55 
 
 		 353 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.87 
 
 		 355 aa  262  6e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.57 
 
 		 372 aa  261  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1130  ABC transporter, ATP-binding protein  40.97 
 
 		 355 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0949  ABC transporter, ATP-binding protein  40.97 
 
 		 355 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662087  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0111  ABC transporter, ATP-binding protein  40.97 
 
 		 355 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4107  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.84 
 
 		 357 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1042  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  40.11 
 
 		 355 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1504  ABC transporter, ATP-binding protein  40.97 
 
 		 355 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0881972  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5678  ABC transporter related  40.11 
 
 		 355 aa  260  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.992256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3890  ABC transporter-related protein  47.8 
 
 		 354 aa  260  3e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1034  ABC transporter, ATP-binding protein  40.69 
 
 		 355 aa  259  6e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2274  ABC transporter, ATP-binding protein  40.69 
 
 		 355 aa  259  6e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3275  ABC transporter related  44.98 
 
 		 355 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0100631  normal  0.197934 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.13 
 
 		 370 aa  258  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1727  ABC transporter, ATP-binding protein  41.55 
 
 		 355 aa  256  5e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212237  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2703  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  43.24 
 
 		 359 aa  256  5e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4138  ABC transporter related  40.11 
 
 		 355 aa  256  6e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392842  normal  0.329133 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.72 
 
 		 355 aa  256  6e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1518  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.19 
 
 		 362 aa  255  8e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0467578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1865  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.72 
 
 		 364 aa  255  8e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4124  ABC transporter related  44.64 
 
 		 355 aa  255  9e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.680035  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4242  ABC transporter related  44.64 
 
 		 355 aa  255  9e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.575223  normal  0.0385451 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3147  ABC transporter ATP-binding protein  47.24 
 
 		 356 aa  255  1.0000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  43.58 
 
 		 355 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1260  ABC transporter, ATP-binding protein  47.24 
 
 		 356 aa  255  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3664  ABC transporter related  39.83 
 
 		 355 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.530384  normal  0.484682 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  44.14 
 
 		 386 aa  255  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1377  ABC transporter related  47.24 
 
 		 356 aa  255  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.745904  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4362  ABC transporter related  47.37 
 
 		 355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  43.73 
 
 		 354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1769  ABC transporter, ATPase subunit  44.29 
 
 		 355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744171  normal  0.0143689 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1365  ABC transporter related  44.48 
 
 		 337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1117  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.72 
 
 		 367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.417968  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  45.42 
 
 		 358 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  45.12 
 
 		 347 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1061  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.48 
 
 		 366 aa  253  3e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.63 
 
 		 353 aa  253  3e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  44.15 
 
 		 354 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1759  ABC transporter related  45.08 
 
 		 353 aa  252  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.483638  normal  0.015539 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3161  hypothetical protein  41.29 
 
 		 358 aa  252  7e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.260707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3947  ABC transporter-related protein  42.23 
 
 		 356 aa  251  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.615077 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.74 
 
 		 355 aa  251  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.841303  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1467  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.19 
 
 		 362 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765075  hitchhiker  0.0000000331128 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  40.59 
 
 		 343 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1896  ABC transporter related  42.69 
 
 		 359 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892333  normal  0.42443 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  44.41 
 
 		 356 aa  250  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4944  ABC transporter related  42.02 
 
 		 364 aa  250  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2235  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.42 
 
 		 364 aa  249  4e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1685  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  43.79 
 
 		 357 aa  249  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409231 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  43.24 
 
 		 353 aa  249  5e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3104  ABC transporter ATP-binding protein  41.8 
 
 		 361 aa  249  6e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2096  ABC transporter related  42.57 
 
 		 354 aa  249  7e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542123 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  42.72 
 
 		 342 aa  249  7e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  42.38 
 
 		 362 aa  249  7e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1257  ABC transporter related  43.96 
 
 		 357 aa  249  8e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2547  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.42 
 
 		 364 aa  248  8e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.370363  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  44.11 
 
 		 355 aa  248  9e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0327  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.41 
 
 		 355 aa  248  1e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100504  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  45.7 
 
 		 353 aa  248  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2933  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  42.11 
 
 		 365 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.927824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1216  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding subunit  42.76 
 
 		 361 aa  248  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4965  ABC transporter related  43.46 
 
 		 357 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950419  normal  0.125498 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  40.95 
 
 		 348 aa  248  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1782  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.09 
 
 		 364 aa  248  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.132629  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6888  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.43 
 
 		 365 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0550256  normal  0.122938 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0718  ABC transporter, ATP-binding protein  43.24 
 
 		 353 aa  248  2e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  44.44 
 
 		 353 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1333  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.76 
 
 		 361 aa  247  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.938281  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4322  ABC transporter related protein  42.23 
 
 		 378 aa  247  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4321  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.76 
 
 		 363 aa  247  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.692532  normal  0.412011 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  42.69 
 
 		 356 aa  247  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  40.06 
 
 		 353 aa  247  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  44.44 
 
 		 353 aa  247  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.41 
 
 		 356 aa  246  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4791  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.1 
 
 		 374 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  40.52 
 
 		 364 aa  246  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1734  ABC transporter ATP-binding protein  42.62 
 
 		 363 aa  246  4e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.281801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  42.42 
 
 		 357 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  41.99 
 
 		 357 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6542  ABC transporter related  40.52 
 
 		 362 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1865  ABC transporter, ATP-binding protein  43.06 
 
 		 330 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5470  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.87 
 
 		 364 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.867721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4219  ABC transporter related  42.64 
 
 		 399 aa  246  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.116014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  40.85 
 
 		 356 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  43.96 
 
 		 353 aa  246  4.9999999999999997e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0201  ABC transporter related  50.41 
 
 		 350 aa  246  4.9999999999999997e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.490731 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.71 
 
 		 353 aa  246  6.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4651  ABC transporter related  44.52 
 
 		 367 aa  246  6.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  43.1 
 
 		 355 aa  245  8e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8306  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.71 
 
 		 347 aa  245  9e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.646948  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5284  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (putrescine)  40.28 
 
 		 368 aa  245  9e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0967501  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0442  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.42 
 
 		 374 aa  245  9e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.826065  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0411  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  42.42 
 
 		 374 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5125  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  39.71 
 
 		 374 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0754257  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  39.71 
 
 		 356 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  42.51 
 
 		 361 aa  244  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0445  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.42 
 
 		 374 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.467134 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>