More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4439 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4439  signal peptidase II  100 
 
 		 165 aa  335  1.9999999999999998e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  44.22 
 
 		 160 aa  136  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4211  lipoprotein signal peptidase  46.27 
 
 		 174 aa  134  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  41.22 
 
 		 154 aa  124  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4414  signal peptidase II  46.02 
 
 		 123 aa  107  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849735  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  40.91 
 
 		 166 aa  104  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  42.21 
 
 		 166 aa  103  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  42.21 
 
 		 166 aa  103  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  42.21 
 
 		 166 aa  103  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  41.46 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  40.91 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  43.36 
 
 		 154 aa  100  9e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  38.22 
 
 		 166 aa  100  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  38.22 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  38.22 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  38.22 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  38.22 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  38.22 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  38.22 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  38.22 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  37.91 
 
 		 166 aa  98.2  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  39.51 
 
 		 176 aa  98.2  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  39.61 
 
 		 172 aa  98.2  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  38.69 
 
 		 163 aa  97.8  6e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  38.96 
 
 		 172 aa  97.1  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  37.91 
 
 		 166 aa  96.3  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  37.25 
 
 		 166 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  40.15 
 
 		 160 aa  95.1  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  39.74 
 
 		 169 aa  94.7  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4860  lipoprotein signal peptidase  35.58 
 
 		 164 aa  94.4  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.777227  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  40.71 
 
 		 173 aa  93.6  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  38.78 
 
 		 159 aa  93.6  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  41.22 
 
 		 178 aa  93.6  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  35.53 
 
 		 171 aa  93.6  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4181  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.797741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1007  lipoprotein signal peptidase  37.97 
 
 		 167 aa  92.8  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  39.02 
 
 		 174 aa  92.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  39.73 
 
 		 163 aa  92.4  3e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  40.82 
 
 		 169 aa  92.4  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1404  lipoprotein signal peptidase  36.69 
 
 		 176 aa  92  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2356  lipoprotein signal peptidase  37.23 
 
 		 173 aa  92  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0383384 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  39.73 
 
 		 165 aa  91.7  4e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  38.06 
 
 		 178 aa  92  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  39.07 
 
 		 174 aa  91.3  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1060  signal peptidase II  39.26 
 
 		 146 aa  91.7  5e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  38.1 
 
 		 171 aa  91.3  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  37.8 
 
 		 169 aa  89.7  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  38.78 
 
 		 165 aa  89.7  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  38.78 
 
 		 165 aa  89.7  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 162 aa  90.1  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  38.1 
 
 		 168 aa  90.5  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  38.19 
 
 		 164 aa  90.1  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  38 
 
 		 170 aa  89.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4037  lipoprotein signal peptidase  38.16 
 
 		 165 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 		 182 aa  89.4  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3783  lipoprotein signal peptidase  36.54 
 
 		 172 aa  89.4  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.800649  normal  0.222823 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 		 169 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2861  lipoprotein signal peptidase  37.76 
 
 		 171 aa  89  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0978018 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2219  lipoprotein signal peptidase  34.44 
 
 		 165 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  38.89 
 
 		 169 aa  88.2  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  38.85 
 
 		 163 aa  88.2  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  37.82 
 
 		 169 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2326  lipoprotein signal peptidase  38.89 
 
 		 171 aa  88.2  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  0.6435 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  38.24 
 
 		 179 aa  87.8  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2603  lipoprotein signal peptidase  38.19 
 
 		 171 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.172447 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1257  lipoprotein signal peptidase  35.86 
 
 		 160 aa  85.9  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 153 aa  86.3  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2543  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 		 165 aa  85.5  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0392  lipoprotein signal peptidase  35.81 
 
 		 165 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.034269  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1239  lipoprotein signal peptidase  36.2 
 
 		 165 aa  85.1  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261124  normal  0.0513456 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0915  signal peptidase II  37.42 
 
 		 184 aa  85.1  4e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.00000000140419  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3163  lipoprotein signal peptidase  36.99 
 
 		 164 aa  84.7  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0632  lipoprotein signal peptidase  38.22 
 
 		 177 aa  84.7  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.263263  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0288  lipoprotein signal peptidase  32.87 
 
 		 184 aa  84.3  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  36.48 
 
 		 154 aa  84  8e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  37.14 
 
 		 150 aa  84  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  36.48 
 
 		 154 aa  84  9e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  34.34 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0487  lipoprotein signal peptidase  37.16 
 
 		 178 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  35.9 
 
 		 161 aa  83.6  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  35.19 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  34.34 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3952  lipoprotein signal peptidase  34.48 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.386002  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2207  lipoprotein signal peptidase  36.42 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0303481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  40.4 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3614  lipoprotein signal peptidase  34.48 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.463393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  35.53 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2146  lipoprotein signal peptidase  40.98 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.669133  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  36.17 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3391  lipoprotein signal peptidase  41.18 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137503 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  36.88 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  36.69 
 
 		 358 aa  81.6  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2304  signal peptidase II  41.18 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000504038  hitchhiker  0.000155189 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2281  lipoprotein signal peptidase  35.06 
 
 		 171 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  35.29 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  37.5 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  33.13 
 
 		 169 aa  81.3  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  36.99 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  32.67 
 
 		 178 aa  81.3  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>