More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4298 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4298  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 451 aa  922    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6285  coproporphyrinogen III oxidase  64.97 
 
 		 450 aa  604  1.0000000000000001e-171  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.180348  normal  0.950475 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1199  coproporphyrinogen III oxidase  60.53 
 
 		 450 aa  540  9.999999999999999e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00110576  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1101  coproporphyrinogen III oxidase  60.31 
 
 		 450 aa  537  1e-151  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00147181  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6824  coproporphyrinogen III oxidase  54.67 
 
 		 450 aa  506  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0435  coproporphyrinogen III oxidase  55.43 
 
 		 450 aa  481  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3273  coproporphyrinogen III oxidase  55.75 
 
 		 448 aa  474  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3244  coproporphyrinogen III oxidase  51.13 
 
 		 480 aa  432  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1485  coproporphyrinogen III oxidase  48.53 
 
 		 449 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0666165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3865  coproporphyrinogen III oxidase  48.42 
 
 		 449 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1862  coproporphyrinogen III oxidase  47.63 
 
 		 449 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3814  coproporphyrinogen III oxidase  47.22 
 
 		 449 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.156886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0541  coproporphyrinogen III oxidase  47.87 
 
 		 454 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1747  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  48.4 
 
 		 467 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.79617  normal  0.600328 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3872  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  47.19 
 
 		 470 aa  398  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2504  coproporphyrinogen III oxidase  46.22 
 
 		 469 aa  397  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2110  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.43 
 
 		 456 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418405  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2028  coproporphyrinogen III oxidase  43.39 
 
 		 450 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0948  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  45.92 
 
 		 490 aa  376  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2555  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.37 
 
 		 451 aa  372  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.674135 
 
 
-
 
NC_004310  BR0655  coproporphyrinogen III oxidase  43.98 
 
 		 444 aa  360  2e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.372227  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2633  coproporphyrinogen III oxidase  42.59 
 
 		 444 aa  360  2e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0648  coproporphyrinogen III oxidase  43.52 
 
 		 444 aa  355  7.999999999999999e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308464  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1986  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.91 
 
 		 454 aa  352  8.999999999999999e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1560  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  45.84 
 
 		 444 aa  351  2e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2643  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  41.89 
 
 		 441 aa  345  8e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1962  coproporphyrinogen III oxidase  40.51 
 
 		 452 aa  344  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0317  coproporphyrinogen III oxidase  39.86 
 
 		 452 aa  341  2e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4264  coproporphyrinogen III oxidase  42.17 
 
 		 460 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4236  coproporphyrinogen III oxidase  41.47 
 
 		 485 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.139524  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4215  coproporphyrinogen III oxidase  41.47 
 
 		 457 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.419471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1604  coproporphyrinogen III oxidase  41.71 
 
 		 460 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0967735  normal  0.0165321 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4332  coproporphyrinogen III oxidase  41.24 
 
 		 457 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.0040942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4393  coproporphyrinogen III oxidase  41.24 
 
 		 457 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3829  coproporphyrinogen III oxidase  42.17 
 
 		 460 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.919193 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4286  coproporphyrinogen III oxidase  41.24 
 
 		 457 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00813614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1813  coproporphyrinogen III oxidase  41.24 
 
 		 460 aa  335  9e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0635  coproporphyrinogen III oxidase  42.79 
 
 		 456 aa  335  1e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0802  coproporphyrinogen III oxidase  43.57 
 
 		 463 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.519619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4018  coproporphyrinogen III oxidase  42.31 
 
 		 463 aa  333  4e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809241  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0977  coproporphyrinogen III oxidase  39.86 
 
 		 452 aa  333  5e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.606099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3061  coproporphyrinogen III oxidase  42.95 
 
 		 464 aa  332  9e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3122  coproporphyrinogen III oxidase  42.86 
 
 		 461 aa  332  9e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2171  coproporphyrinogen III oxidase  42.73 
 
 		 464 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.467483  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0884  coproporphyrinogen III oxidase  43.18 
 
 		 463 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.599698 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2042  coproporphyrinogen III oxidase  42.73 
 
 		 464 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.241644  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0855  coproporphyrinogen III oxidase  42.86 
 
 		 461 aa  331  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2571  coproporphyrinogen III oxidase  42.73 
 
 		 464 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0791  coproporphyrinogen III oxidase  43.12 
 
 		 463 aa  332  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.680878  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1362  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.09 
 
 		 458 aa  332  1e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.82538  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0738  coproporphyrinogen III oxidase  42.73 
 
 		 464 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.507081  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3096  coproporphyrinogen III oxidase  42.73 
 
 		 464 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3122  coproporphyrinogen III oxidase  42.73 
 
 		 464 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3156  coproporphyrinogen III oxidase  40.55 
 
 		 494 aa  329  7e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.574693 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3483  coproporphyrinogen III oxidase  40.55 
 
 		 494 aa  328  9e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1851  coproporphyrinogen III oxidase  41.2 
 
 		 451 aa  328  9e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.532026  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0501  coproporphyrinogen III oxidase  40.37 
 
 		 460 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0435  coproporphyrinogen III oxidase  43.4 
 
 		 463 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0914  coproporphyrinogen III oxidase  43.4 
 
 		 463 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652481  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19920  coproporphyrinogen III oxidase  40.54 
 
 		 458 aa  328  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1509  coproporphyrinogen III oxidase  42.06 
 
 		 464 aa  327  3e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0230115  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1269  coproporphyrinogen III oxidase  41.53 
 
 		 463 aa  327  3e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3582  coproporphyrinogen III oxidase  40.09 
 
 		 460 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308056  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3284  coproporphyrinogen III oxidase  40.84 
 
 		 510 aa  326  6e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2477  coproporphyrinogen III oxidase  42.05 
 
 		 482 aa  323  4e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.99297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0887  coproporphyrinogen III oxidase  40.51 
 
 		 453 aa  323  4e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00571678  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2824  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.46 
 
 		 470 aa  323  5e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0116483  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2548  coproporphyrinogen III oxidase  37.86 
 
 		 451 aa  322  6e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.963821  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2402  coproporphyrinogen III oxidase  40.96 
 
 		 480 aa  322  9.999999999999999e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3626  coproporphyrinogen III oxidase  40 
 
 		 446 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0019  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.68 
 
 		 464 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2470  coproporphyrinogen III oxidase  41.12 
 
 		 476 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.097815 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0531  coproporphyrinogen III oxidase  39.15 
 
 		 450 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3474  coproporphyrinogen III oxidase  40.51 
 
 		 500 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1048  coproporphyrinogen III oxidase  39.35 
 
 		 471 aa  320  5e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4393  coproporphyrinogen III oxidase  40.49 
 
 		 472 aa  319  5e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149984 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00581  coproporphyrinogen III oxidase  40.28 
 
 		 463 aa  318  1e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03752  coproporphyrinogen III oxidase  39.4 
 
 		 457 aa  317  2e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4120  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.4 
 
 		 457 aa  317  2e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4342  coproporphyrinogen III oxidase  39.4 
 
 		 457 aa  317  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.343307  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5313  coproporphyrinogen III oxidase  39.4 
 
 		 457 aa  317  2e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00391733  normal  0.998982 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4092  coproporphyrinogen III oxidase  39.4 
 
 		 457 aa  317  2e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0515702  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2613  coproporphyrinogen III oxidase  40.09 
 
 		 460 aa  318  2e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0494061  normal  0.675142 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4149  coproporphyrinogen III oxidase  39.4 
 
 		 457 aa  317  2e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20297  normal  0.0195614 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03701  hypothetical protein  39.4 
 
 		 457 aa  317  2e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0677852  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4386  coproporphyrinogen III oxidase  39.4 
 
 		 457 aa  317  2e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0245884  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0024  coproporphyrinogen III oxidase  39.44 
 
 		 457 aa  317  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0201476  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0026  coproporphyrinogen III oxidase  39.44 
 
 		 457 aa  317  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0394693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2354  coproporphyrinogen III oxidase  38.32 
 
 		 450 aa  317  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.148404 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4192  coproporphyrinogen III oxidase  39.44 
 
 		 457 aa  317  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.799407  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4099  coproporphyrinogen III oxidase  39.17 
 
 		 457 aa  316  5e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.740793  normal  0.772417 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0606  coproporphyrinogen III oxidase  38.14 
 
 		 455 aa  316  7e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.219505  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0602  coproporphyrinogen III oxidase  41.04 
 
 		 470 aa  315  8e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4251  coproporphyrinogen III oxidase  39.17 
 
 		 457 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.172293  normal  0.0658119 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3786  coproporphyrinogen III oxidase  40.32 
 
 		 460 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1208  coproporphyrinogen III oxidase  41.4 
 
 		 462 aa  315  9.999999999999999e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001911  coproporphyrinogen III oxidase oxygen-independent  39.44 
 
 		 463 aa  315  9.999999999999999e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0086  coproporphyrinogen III oxidase  38.8 
 
 		 446 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.652683  normal  0.197179 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3323  coproporphyrinogen III oxidase  41.12 
 
 		 489 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0659  coproporphyrinogen III oxidase  39.09 
 
 		 453 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>