202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4222 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 541 aa  1093    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 541 aa  1093    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 541 aa  1093    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 541 aa  1093    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  78.67 
 
 		 497 aa  480  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  44.76 
 
 		 548 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4288  integrase catalytic subunit  46.2 
 
 		 547 aa  393  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167614  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  41.46 
 
 		 551 aa  378  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  39.64 
 
 		 556 aa  360  4e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  39.64 
 
 		 556 aa  360  4e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  39.64 
 
 		 556 aa  360  4e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  39.64 
 
 		 556 aa  360  5e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  37.48 
 
 		 626 aa  336  7.999999999999999e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0202  Integrase catalytic region  36.79 
 
 		 630 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177404 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  39.91 
 
 		 547 aa  313  4.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  35.31 
 
 		 625 aa  309  6.999999999999999e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0187  urease, beta subunit  34.92 
 
 		 611 aa  299  7e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  38.97 
 
 		 560 aa  299  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  38.72 
 
 		 562 aa  298  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  36.04 
 
 		 536 aa  297  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  38.72 
 
 		 572 aa  297  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  38.27 
 
 		 552 aa  296  4e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  39.05 
 
 		 509 aa  294  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0058  transposase  35.37 
 
 		 595 aa  289  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  43.07 
 
 		 382 aa  286  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1647  transposase  34.04 
 
 		 616 aa  281  2e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3579  Integrase catalytic region  37.03 
 
 		 554 aa  281  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.318948  normal  0.0294247 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6595  transposase  36.27 
 
 		 542 aa  279  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3039  integrase catalytic subunit  33.79 
 
 		 614 aa  276  7e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.532754  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  31.01 
 
 		 618 aa  272  1e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4905  integrase catalytic subunit  37.35 
 
 		 599 aa  270  5e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3258  integrase catalytic subunit  37.35 
 
 		 599 aa  270  5e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0041  TniAdelta1  39.45 
 
 		 422 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.208656 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  29.94 
 
 		 618 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  29.94 
 
 		 618 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1580  hypothetical protein  31.04 
 
 		 640 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4980  TniA transposase  29.91 
 
 		 640 aa  236  7e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.01794 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2524  TniA transposase  29.91 
 
 		 632 aa  234  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1680  TniA transposase  31.51 
 
 		 640 aa  232  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2936  TniA transposase  31.51 
 
 		 640 aa  232  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.572632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3047  transposase  30.31 
 
 		 636 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00784211  normal  0.39515 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4394  integrase catalytic subunit  32.95 
 
 		 550 aa  210  6e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4506  integrase catalytic subunit  33.26 
 
 		 560 aa  194  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2136  transposase  40.47 
 
 		 322 aa  177  5e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0169548 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  26.48 
 
 		 617 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  25.9 
 
 		 481 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  25.71 
 
 		 481 aa  148  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  28.35 
 
 		 617 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0377  integrase catalytic subunit  26.62 
 
 		 636 aa  140  4.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.893985  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4385  integrase catalytic subunit  33.24 
 
 		 468 aa  140  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  29.13 
 
 		 677 aa  140  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2602  hypothetical protein  30.05 
 
 		 733 aa  140  7e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0193648  normal  0.873039 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  29.13 
 
 		 652 aa  140  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  29.13 
 
 		 652 aa  140  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  29.13 
 
 		 652 aa  140  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2133  hypothetical protein  33.47 
 
 		 291 aa  139  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0992239  normal  0.0302754 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  25.23 
 
 		 480 aa  134  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  25.23 
 
 		 480 aa  134  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4720  Integrase catalytic region  32.34 
 
 		 670 aa  134  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  30.33 
 
 		 560 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1342  integrase catalytic subunit  29.24 
 
 		 663 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  28.72 
 
 		 558 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  28.54 
 
 		 558 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0067  integrase catalytic subunit  26.96 
 
 		 905 aa  128  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0193  integrase catalytic subunit  26.96 
 
 		 905 aa  128  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.952164  hitchhiker  0.00648226 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1330  integrase catalytic subunit  26.96 
 
 		 905 aa  128  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1715  integrase catalytic subunit  26.96 
 
 		 905 aa  128  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4946  integrase catalytic subunit  26.96 
 
 		 905 aa  128  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  32.5 
 
 		 497 aa  127  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  32.5 
 
 		 497 aa  127  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  32.5 
 
 		 497 aa  127  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4740  integrase catalytic region  28.64 
 
 		 902 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  26.94 
 
 		 649 aa  127  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  27.82 
 
 		 555 aa  126  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  30.12 
 
 		 721 aa  125  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3184  TnsA endonuclease  29.97 
 
 		 902 aa  125  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3504  Integrase catalytic region  26.44 
 
 		 900 aa  124  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4577  Integrase catalytic region  26.44 
 
 		 900 aa  124  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0025  integrase catalytic subunit  31.77 
 
 		 810 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  27.5 
 
 		 567 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5056  integrase catalytic region  30.23 
 
 		 575 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3150  integrase catalytic subunit  30.23 
 
 		 662 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5218  integrase catalytic subunit  30.23 
 
 		 662 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.250569 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  25.33 
 
 		 581 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2267  integrase catalytic region  26.28 
 
 		 626 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102456 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0015  integrase catalytic region  27.86 
 
 		 653 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1364  integrase catalytic subunit  35.58 
 
 		 782 aa  110  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565486  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0729  transposase, putative  27.88 
 
 		 704 aa  109  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648986  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0977  Transposase-like Mu  25.86 
 
 		 561 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115724 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3659  integrase catalytic subunit  36.29 
 
 		 785 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1702  hypothetical protein  26.01 
 
 		 650 aa  107  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1983  TnsA endonuclease  24.63 
 
 		 886 aa  103  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.176363 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2453  Integrase catalytic region  28.9 
 
 		 917 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.481095  hitchhiker  0.00214195 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4752  integrase catalytic region  27.76 
 
 		 754 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3946  integrase catalytic subunit  27.47 
 
 		 696 aa  93.6  8e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0221  Tn7-like transposition protein B  24.74 
 
 		 728 aa  91.7  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.26166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5591  integrase catalytic subunit  27.4 
 
 		 715 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5417  integrase catalytic subunit  27.4 
 
 		 715 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.751819 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1519  Integrase catalytic region  26.69 
 
 		 774 aa  91.3  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3210  integrase catalytic subunit  25.42 
 
 		 782 aa  90.9  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>