More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4217 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4217  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 137 aa  278  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5562  transcriptional regulator  53.49 
 
 		 139 aa  144  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3979  MerR family transcriptional regulator  53.44 
 
 		 174 aa  144  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00581953  normal  0.426596 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  50.38 
 
 		 142 aa  143  9e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  50.38 
 
 		 142 aa  143  9e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1026  MerR family transcriptional regulator  52.34 
 
 		 140 aa  142  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120689  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  52.67 
 
 		 141 aa  140  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  52.67 
 
 		 146 aa  140  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1504  regulatory protein, MerR  50.39 
 
 		 141 aa  140  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0920  MerR family transcriptional regulator  52.76 
 
 		 141 aa  139  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320526  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3339  MerR family transcriptional regulator  52.71 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88053  normal  0.266963 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  52.31 
 
 		 142 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  51.91 
 
 		 161 aa  138  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2017  MerR family transcriptional regulator  53.97 
 
 		 140 aa  137  6e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 142 aa  137  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1941  MerR family transcriptional regulator  53.97 
 
 		 140 aa  137  6e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3502  transcriptional regulator, MerR family  47.69 
 
 		 140 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.733746 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3797  transcriptional regulator, MerR family  47.69 
 
 		 140 aa  130  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4072  transcriptional regulator, MerR family  50.77 
 
 		 140 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44146 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 137 aa  127  7.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2300  MerR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 134 aa  126  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2333  MerR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 162 aa  123  8.000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00701798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0211  MerR family transcriptional regulator  46.56 
 
 		 140 aa  121  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 137 aa  120  5e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4277  MerR family transcriptional regulator  46.92 
 
 		 140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0593  MerR family transcriptional regulator  45.04 
 
 		 137 aa  118  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4117  MerR family transcriptional regulator  46.92 
 
 		 140 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0137  MerR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 145 aa  117  4.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  44.7 
 
 		 137 aa  116  7.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2558  MerR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 139 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  45.04 
 
 		 140 aa  114  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 138 aa  114  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  44.88 
 
 		 133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 141 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 133 aa  110  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 139 aa  110  7.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  41.35 
 
 		 133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2443  MerR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4426  MerR family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4119  MerR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 137 aa  104  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4070  transcriptional regulator, MerR family  50.48 
 
 		 132 aa  104  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.336663 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  42.06 
 
 		 144 aa  103  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1199  MerR family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 138 aa  102  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00877844  normal  0.661473 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  41.35 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2322  MerR family transcriptional regulator  45.6 
 
 		 139 aa  101  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1304  zinc-responsive transcriptional regulator  38.64 
 
 		 140 aa  101  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2931  MerR family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 138 aa  100  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.68732 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 150 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 151 aa  99  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  42.75 
 
 		 156 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  42.75 
 
 		 156 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03143  zinc-responsive transcriptional regulator  39.55 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0421  transcriptional regulator, MerR family  39.55 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 157 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3486  zinc-responsive transcriptional regulator  39.55 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0751902  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  39.55 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  hitchhiker  0.0000172555 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3587  zinc-responsive transcriptional regulator  39.55 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.205456  normal  0.141164 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4614  zinc-responsive transcriptional regulator  39.55 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000341039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1373  MerR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 159 aa  96.3  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3775  zinc-responsive transcriptional regulator  39.55 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.02383  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03094  hypothetical protein  39.55 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3678  zinc-responsive transcriptional regulator  39.55 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1346  MerR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 136 aa  95.9  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  36.64 
 
 		 132 aa  95.5  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  38.17 
 
 		 133 aa  95.5  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4622  transcriptional regulator, MerR family  38.52 
 
 		 144 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5372  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 149 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2470  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 138 aa  95.1  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 152 aa  95.1  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1137  transcriptional regulator, MerR family  39.55 
 
 		 159 aa  94.7  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1851  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 162 aa  94.7  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.138506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  36.51 
 
 		 148 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5946  MerR family transcriptional regulator PbrR  38.58 
 
 		 145 aa  94.7  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4808  transcriptional regulator, MerR family  37.4 
 
 		 160 aa  94.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.820733 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3731  transcriptional regulator, MerR family  37.4 
 
 		 160 aa  94.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 140 aa  94.4  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 186 aa  94  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1339  transcriptional regulator of MerR family protein  36.22 
 
 		 130 aa  94  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0203  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.31 
 
 		 135 aa  94  7e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3680  zinc-responsive transcriptional regulator  38.81 
 
 		 141 aa  93.6  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2831  MerR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 175 aa  93.6  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3607  zinc-responsive transcriptional regulator  38.81 
 
 		 141 aa  93.6  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0303153  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5579  transcriptional regulator, MerR family  38.24 
 
 		 144 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  39.85 
 
 		 142 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3778  zinc-responsive transcriptional regulator  38.81 
 
 		 141 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3715  zinc-responsive transcriptional regulator  38.81 
 
 		 141 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.325937 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3608  zinc-responsive transcriptional regulator  38.81 
 
 		 141 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.260442 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 172 aa  93.2  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05447  transcription regulator protein  36.15 
 
 		 170 aa  92.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.015587 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  36.51 
 
 		 148 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2588  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 129 aa  92  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0158199 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2655  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 129 aa  92  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  35.88 
 
 		 132 aa  92.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  38.58 
 
 		 132 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>