297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4198 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008242  Meso_4198  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
124 aa  251  3e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0326  ArsR family transcriptional regulator  77.69 
 
 
123 aa  171  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2140  ArsR family transcriptional regulator  68.97 
 
 
117 aa  169  7.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0619  ArsR family transcriptional regulator  67.27 
 
 
113 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2244  ArsR family transcriptional regulator  66.36 
 
 
110 aa  156  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.908668  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  64.91 
 
 
291 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3420  regulatory protein, ArsR  68.1 
 
 
131 aa  149  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1466  ArsR family transcriptional regulator  56.3 
 
 
129 aa  149  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0101  regulatory protein ArsR  66.36 
 
 
114 aa  148  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5057  regulatory protein ArsR  66.96 
 
 
116 aa  146  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5578  ArsR family transcriptional regulator  61.9 
 
 
111 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.151543 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4074  transcriptional regulator, ArsR family  60 
 
 
118 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00570943  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1970  ArsR family transcriptional regulator ArsR1  67.86 
 
 
127 aa  143  9e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.180963  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0952  ArsR family transcriptional regulator  56.64 
 
 
124 aa  137  4.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2533  transcriptional regulator, ArsR family  62.04 
 
 
120 aa  135  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2246  ArsR family transcriptional regulator  65.35 
 
 
115 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.362013  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4425  ArsR family transcriptional regulator  48.03 
 
 
155 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2403  ArsR family transcriptional regulator  48.62 
 
 
109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0656384  normal  0.0239718 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3123  ArsR family transcriptional regulator  49.57 
 
 
120 aa  111  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.550975  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2414  transcriptional regulator, ArsR family  48.67 
 
 
118 aa  110  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.203968 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3855  regulatory protein, ArsR  50.49 
 
 
110 aa  107  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1046  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.72 
 
 
119 aa  107  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5721  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.27 
 
 
119 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6064  transcriptional regulator ArsR family  48.21 
 
 
123 aa  106  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3125  ArsR family transcriptional regulator  47.27 
 
 
110 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1641  protein tyrosine phosphatase  55.32 
 
 
309 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2541  ArsR family transcriptional regulator  50.98 
 
 
117 aa  105  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101096  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3201  regulatory protein ArsR  48.7 
 
 
119 aa  105  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5705  ArsR family transcriptional regulator  46.49 
 
 
113 aa  104  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0927566  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0697  transcriptional regulator, ArsR family  44.92 
 
 
120 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.729608 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1908  regulatory protein ArsR  47.41 
 
 
120 aa  102  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0166  regulatory protein, ArsR  49.07 
 
 
113 aa  100  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.698937  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4893  regulatory protein ArsR  50 
 
 
121 aa  99  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0217  regulatory protein, ArsR  46.09 
 
 
120 aa  99.4  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1424  ArsR family transcriptional regulator  45.05 
 
 
158 aa  98.2  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.414948  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3342  regulatory protein, ArsR  44.92 
 
 
120 aa  98.2  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2339  ArsR family transcriptional regulator  51.49 
 
 
114 aa  97.4  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.479129  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2099  ArsR family transcriptional regulator  48.54 
 
 
110 aa  97.4  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.321507  normal  0.577048 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1378  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
118 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0219707 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5675  ArsR family transcriptional regulator  44.12 
 
 
113 aa  95.5  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.69545  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1788  ArsR family transcriptional regulator  48.04 
 
 
123 aa  94.7  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0212653 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2392  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 
117 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3136  regulatory protein, ArsR  44.63 
 
 
119 aa  94.7  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.651925  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  43.09 
 
 
287 aa  92.8  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1580  regulatory protein, ArsR  44.12 
 
 
109 aa  92.8  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1079  ArsR family transcriptional regulator  42.73 
 
 
110 aa  92  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0278523  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4055  putative transcriptional regulator, ArsR family  49.48 
 
 
119 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.77885 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1388  ArsR family transcriptional regulator  41.74 
 
 
113 aa  91.7  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5681  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.27 
 
 
119 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.825179  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1406  regulatory protein, ArsR  44.55 
 
 
110 aa  91.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1545  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2730  ArsR family transcriptional regulator  44.12 
 
 
108 aa  91.3  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.636967  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2159  transcriptional regulator, ArsR family  47.96 
 
 
131 aa  90.9  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.679753  normal  0.522465 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1388  regulatory protein, ArsR  44.12 
 
 
108 aa  91.3  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.434154  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0522  ArsR family transcriptional regulator  42.57 
 
 
119 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226567 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4216  ArsR family transcriptional regulator  41.9 
 
 
115 aa  90.5  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  43.43 
 
 
298 aa  88.6  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3958  protein tyrosine phosphatase  46.6 
 
 
295 aa  88.6  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.387678 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6330  ArsR family transcriptional regulator  42.34 
 
 
111 aa  88.2  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0761907 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2859  transcriptional regulator, ArsR  47.78 
 
 
118 aa  88.6  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.156895  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4966  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
111 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2480  transcriptional regulator, ArsR family  47.78 
 
 
118 aa  88.6  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3194  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
111 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1979  transcriptional regulator, ArsR family  47.92 
 
 
104 aa  87.8  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.40138  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2124  arsenic resistance transcriptional regulator  40.4 
 
 
124 aa  87  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00138716  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5601  ArsR family transcriptional regulator  41.07 
 
 
111 aa  87  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19891  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3667  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
109 aa  86.7  9e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2190  arsenic resistance transcriptional regulator  40.4 
 
 
137 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0333  ArsR family transcriptional regulator  48.04 
 
 
109 aa  86.3  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.43 
 
 
118 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05830  transcriptional regulator, ArsR family  44.19 
 
 
92 aa  86.7  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.16233  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6167  ArsR family transcriptional regulator  41.23 
 
 
111 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.235116 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0874  regulatory protein ArsR  46.02 
 
 
119 aa  85.5  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3055  ArsR family transcriptional regulator  44.21 
 
 
106 aa  85.1  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.572382  normal  0.538726 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6561  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
111 aa  84.3  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2035  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
123 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0205  transcriptional regulator, ArsR family  43.62 
 
 
110 aa  84  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.397651 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0961  arsenical resistance transcriptional regulator  39.47 
 
 
111 aa  84  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5676  ArsR family transcriptional regulator  38.6 
 
 
142 aa  84  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.225709  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3468  ArsR family transcriptional regulator  38.84 
 
 
114 aa  84  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0560  arsenical resistance transcriptional regulator  42.31 
 
 
111 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0253311  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0911  arsenical resistance transcriptional regulator  42.31 
 
 
123 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3254  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.37 
 
 
106 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1138  ArsR family transcriptional regulator  44.79 
 
 
107 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4173  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.54 
 
 
119 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00372298  normal  0.543364 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1129  putative arsenical resistance operon repressor transcription regulator protein  47 
 
 
107 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.997144 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1940  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
227 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.714922  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0454  arsenical resistance transcriptional regulator  42.31 
 
 
244 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17354  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5376  ArsR family transcriptional regulator  38.39 
 
 
113 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.563741 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3577  transcriptional regulator, ArsR family  47.87 
 
 
107 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.919618 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3864  regulatory protein ArsR  44.64 
 
 
119 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.325648 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1441  regulatory protein ArsR  46.4 
 
 
145 aa  81.6  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  41.35 
 
 
284 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3639  regulatory protein, ArsR  40 
 
 
130 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2514  ArsR family transcriptional regulator  44.68 
 
 
127 aa  81.6  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0122169 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3119  transcriptional regulator, TrmB  41.41 
 
 
124 aa  81.3  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.763432  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1346  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.68 
 
 
107 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.123906  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2841  ArsR family transcriptional regulator  41.84 
 
 
110 aa  81.3  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.268381  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5343  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.95 
 
 
107 aa  80.1  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1486  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
108 aa  79.3  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.586403  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5763  transcriptional regulator, ArsR family  51.04 
 
 
107 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.834152 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>