More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4129 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3411  hypothetical protein  53.6 
 
 		 803 aa  665    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4117  heavy metal translocating P-type ATPase  53.02 
 
 		 731 aa  660    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.194383  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2018  cadmium-translocating P-type ATPase  61.99 
 
 		 814 aa  843    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4071  heavy metal translocating P-type ATPase  61.61 
 
 		 712 aa  817    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.515155 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3679  heavy metal translocating P-type ATPase  52.49 
 
 		 709 aa  675    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170843  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3501  heavy metal translocating P-type ATPase  63.07 
 
 		 758 aa  869    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.968413 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3796  heavy metal translocating P-type ATPase  63.33 
 
 		 756 aa  873    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.304079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1096  heavy metal translocating P-type ATPase  53.78 
 
 		 731 aa  678    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3134  heavy metal translocating P-type ATPase  52.95 
 
 		 712 aa  701    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1791  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  52.92 
 
 		 740 aa  694    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1627  heavy metal translocating P-type ATPase  53.19 
 
 		 718 aa  691    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1027  (Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  56.45 
 
 		 777 aa  693    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1505  heavy metal translocating P-type ATPase  62.94 
 
 		 716 aa  873    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.724781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3643  heavy metal translocating P-type ATPase  62.72 
 
 		 726 aa  867    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4535  heavy metal translocating P-type ATPase  62.35 
 
 		 734 aa  861    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  52.99 
 
 		 711 aa  682    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  52.38 
 
 		 738 aa  731    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.174649 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5561  P type cation (metal) transporter ATPase component  61.55 
 
 		 757 aa  833    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.85793  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3467  heavy metal translocating P-type ATPase  57.89 
 
 		 634 aa  636    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2581  heavy metal translocating P-type ATPase  50.82 
 
 		 793 aa  694    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2752  heavy metal translocating P-type ATPase  52.66 
 
 		 722 aa  654    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3336  heavy metal translocating P-type ATPase  61.97 
 
 		 744 aa  853    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.812406 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4129  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 		 955 aa  1902    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594841  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2849  heavy metal translocating P-type ATPase  59.86 
 
 		 734 aa  817    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3978  heavy metal translocating P-type ATPase  64.1 
 
 		 759 aa  811    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.39503  normal  0.602002 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3338  heavy metal translocating P-type ATPase  64.14 
 
 		 759 aa  806    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.837764  normal  0.51996 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0921  heavy metal translocating P-type ATPase  62.92 
 
 		 844 aa  861    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0438  heavy metal translocating P-type ATPase  53.05 
 
 		 740 aa  696    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1942  cadmium-translocating P-type ATPase  61.58 
 
 		 704 aa  834    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0212  heavy metal translocating P-type ATPase  50.99 
 
 		 758 aa  680    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2344  heavy metal translocating P-type ATPase  52.36 
 
 		 732 aa  649    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.442895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7421  lead, cadmium, zinc and mercury-transporting ATPase  63.49 
 
 		 764 aa  887    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.396456 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7259  lead, cadmium, zinc and mercury-transporting ATPase  66.29 
 
 		 678 aa  801    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.482594 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0269  heavy metal translocating P-type ATPase  49.26 
 
 		 713 aa  640    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1151  heavy metal translocating P-type ATPase  52.64 
 
 		 904 aa  713    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0071597  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3208  heavy metal translocating P-type ATPase  53.89 
 
 		 720 aa  735    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2067  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  46.47 
 
 		 773 aa  612  1e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0551  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  45.39 
 
 		 768 aa  576  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0209  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  43.32 
 
 		 771 aa  572  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0277781 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1611  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  42.72 
 
 		 803 aa  570  1e-161  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.730441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004007  copper-translocating P-type ATPase  43.9 
 
 		 768 aa  567  1e-160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01515  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  44.25 
 
 		 689 aa  554  1e-156  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0088  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  40.45 
 
 		 784 aa  543  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.473574  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3873  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  45.11 
 
 		 728 aa  533  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0472181  normal  0.24383 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3985  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  41.44 
 
 		 782 aa  533  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0571  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  41.32 
 
 		 782 aa  531  1e-149  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0093  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  50.08 
 
 		 787 aa  531  1e-149  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3768  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  43.54 
 
 		 732 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0233  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  41.02 
 
 		 788 aa  526  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3888  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  43.18 
 
 		 732 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3948  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  43.18 
 
 		 732 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3778  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  43.18 
 
 		 732 aa  525  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3845  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  42.98 
 
 		 732 aa  522  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03318  zinc, cobalt and lead efflux system  45.59 
 
 		 732 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03271  hypothetical protein  45.59 
 
 		 732 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3951  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  45.39 
 
 		 732 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0246  heavy metal translocating P-type ATPase  44.86 
 
 		 732 aa  514  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4789  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  45.26 
 
 		 732 aa  514  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3752  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  45.35 
 
 		 732 aa  516  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3668  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  45.26 
 
 		 732 aa  513  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0247  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  45.13 
 
 		 732 aa  513  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3853  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  45.13 
 
 		 732 aa  511  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  40.84 
 
 		 712 aa  509  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  41.13 
 
 		 712 aa  510  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  40.4 
 
 		 712 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  41.11 
 
 		 783 aa  500  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  40.31 
 
 		 767 aa  499  1e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2147  cadmium-translocating P-type ATPase  41.17 
 
 		 713 aa  486  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0026  heavy metal translocating P-type ATPase  41.11 
 
 		 701 aa  483  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260901  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1257  cation transporter E1-E2 family ATPase  39.12 
 
 		 709 aa  478  1e-133  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  48.3 
 
 		 707 aa  474  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5192  heavy metal translocating P-type ATPase  39.58 
 
 		 750 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1448  cadmium-translocating P-type ATPase  40.46 
 
 		 748 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5012  heavy metal translocating P-type ATPase  39.55 
 
 		 750 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.530784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4451  heavy metal translocating P-type ATPase  47.8 
 
 		 673 aa  468  9.999999999999999e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5371  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  37.61 
 
 		 769 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3462  heavy metal translocating P-type ATPase  40.21 
 
 		 801 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5139  heavy metal translocating P-type ATPase  39.28 
 
 		 750 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.921896  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5279  cadmium-translocating P-type ATPase  38.22 
 
 		 752 aa  463  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3683  heavy metal translocating P-type ATPase  39.03 
 
 		 791 aa  465  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00270096  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2390  heavy metal translocating P-type ATPase  40.3 
 
 		 800 aa  464  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0451824  normal  0.128679 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2103  heavy metal translocating P-type ATPase  40.3 
 
 		 800 aa  464  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5352  heavy metal translocating P-type ATPase  40.67 
 
 		 799 aa  464  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18520  heavy metal translocating P-type ATPase  40.43 
 
 		 712 aa  461  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1677  heavy metal translocating P-type ATPase  38.49 
 
 		 726 aa  461  9.999999999999999e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2086  cadmium-transporting ATPase  38.58 
 
 		 735 aa  461  9.999999999999999e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16660  putative metal-transporting P-type ATPase  40.6 
 
 		 742 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5284  heavy metal translocating P-type ATPase  39.22 
 
 		 800 aa  462  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1643  heavy metal translocating P-type ATPase  39.22 
 
 		 800 aa  462  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0854  heavy metal translocating P-type ATPase  46.04 
 
 		 812 aa  457  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4439  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  45.79 
 
 		 709 aa  459  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1815  heavy metal translocating P-type ATPase  38.44 
 
 		 800 aa  457  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0326  heavy metal translocating P-type ATPase  38.7 
 
 		 750 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.451186  normal  0.576346 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  38.93 
 
 		 984 aa  456  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0773629 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2242  heavy metal translocating P-type ATPase  38.43 
 
 		 750 aa  455  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00781921 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3290  cadmium-translocating P-type ATPase  45.09 
 
 		 830 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2303  heavy metal translocating P-type ATPase  38.93 
 
 		 984 aa  456  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230591  hitchhiker  0.00032078 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2257  ATPase, E1-E2 type:heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  37.56 
 
 		 743 aa  450  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  37.8 
 
 		 833 aa  452  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2450  heavy metal translocating P-type ATPase  39.84 
 
 		 738 aa  448  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0805426  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>