More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4124 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008242  Meso_4124  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
485 aa  979    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5287  histidine kinase  40.85 
 
 
425 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1083  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 
453 aa  234  3e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.205423  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6322  histidine kinase  43.63 
 
 
276 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2424  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 
493 aa  233  8.000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.444371 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2417  signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 
480 aa  230  4e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2702  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 
443 aa  230  5e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.48 
 
 
472 aa  228  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 
441 aa  227  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441725  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2346  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.45 
 
 
717 aa  226  7e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.596828  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3381  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.26 
 
 
473 aa  224  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.52 
 
 
454 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1972  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
451 aa  220  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0298113 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2388  sensor histidine kinase  30.15 
 
 
469 aa  218  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
454 aa  218  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2472  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.26 
 
 
469 aa  217  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2085  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 
434 aa  217  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3645  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.69 
 
 
443 aa  216  7e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5254  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
440 aa  216  8e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3113  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
440 aa  216  8e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1373  histidine kinase  32.99 
 
 
454 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182248  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.4 
 
 
330 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2106  sensor protein  38.06 
 
 
425 aa  216  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0080  sensor histidine kinase  38.06 
 
 
425 aa  216  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0579685  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5019  histidine kinase  33.48 
 
 
440 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.554141  normal  0.501174 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 
488 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.996229 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 
488 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6217  putative two component sensor histidine kinase  39.61 
 
 
467 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2910  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 
488 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.988017  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3232  histidine kinase  44.12 
 
 
270 aa  214  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0771  sensor histidine kinase  40.82 
 
 
391 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 
493 aa  213  7e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181871  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 
440 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160949  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 
440 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4653  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.93 
 
 
446 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.724731 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 
464 aa  211  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 
453 aa  210  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 
469 aa  210  4e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0433366  normal  0.502899 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0399  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 
440 aa  209  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5703  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 
435 aa  209  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.123247  normal  0.334136 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.72 
 
 
494 aa  204  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.864341 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 
535 aa  204  3e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3910  sensor histidine kinase  31.82 
 
 
435 aa  203  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4602  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  44.72 
 
 
396 aa  203  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4427  histidine kinase  32.33 
 
 
458 aa  203  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 
444 aa  203  7e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2274  histidine kinase  40.62 
 
 
440 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0463006  normal  0.363393 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3476  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.85 
 
 
437 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0816  histidine kinase  32.62 
 
 
443 aa  201  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2271  histidine kinase  37.06 
 
 
479 aa  200  5e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0473  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  30 
 
 
474 aa  198  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3460  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
442 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.025343  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2050  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.87 
 
 
439 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125558  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0517  ATPase domain-containing protein  32.4 
 
 
432 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.907108  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3325  sensor histidine kinase  42.28 
 
 
358 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.205515  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6198  putative two component sensor histidine kinase  38.8 
 
 
458 aa  197  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2093  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.58 
 
 
463 aa  196  6e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.186061  normal  0.978183 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2373  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 
456 aa  196  7e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.351814  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4605  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 
441 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4090  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.58 
 
 
444 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280279  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 
451 aa  195  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288659  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1244  histidine kinase  42.64 
 
 
438 aa  192  8e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0432448  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1067  histidine kinase  42.86 
 
 
444 aa  192  8e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1960  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.97 
 
 
442 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463219  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2146  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.93 
 
 
476 aa  192  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4198  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.5 
 
 
349 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04422  two-component system sensor protein  39.79 
 
 
499 aa  191  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 
453 aa  191  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0759  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.09 
 
 
430 aa  191  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.269455  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3287  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 
479 aa  192  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.133  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.45 
 
 
443 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.269613 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7107  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.41 
 
 
469 aa  187  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338438  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2268  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 
468 aa  186  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.371039  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1373  sensor histidine kinase  32.25 
 
 
359 aa  183  6e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2031  sensor histidine kinase  35.74 
 
 
344 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2007  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.44 
 
 
428 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 
428 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414185  normal  0.194942 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5209  two component sensor kinase  32.49 
 
 
440 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0785  sensor histidine kinase  39.04 
 
 
448 aa  179  7e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2222  sensor histidine kinase  35.46 
 
 
344 aa  179  7e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2226  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 
468 aa  179  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2517  Signal transduction histidine kinase  38.29 
 
 
466 aa  177  3e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.212799 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.61 
 
 
455 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239183 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 
428 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0993  two-component sensor  41.54 
 
 
434 aa  177  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 
428 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.931435 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.27 
 
 
462 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3773  ATPase domain-containing protein  38.1 
 
 
486 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0284842  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 
455 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4028  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 
497 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.612622 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
473 aa  173  5.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4067  histidine kinase  38.39 
 
 
491 aa  173  7.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.933577 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3883  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 
462 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2234  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 
442 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2738  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.94 
 
 
425 aa  171  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0327693 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0765  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.81 
 
 
438 aa  171  3e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.776621  normal  0.225366 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4172  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 
462 aa  170  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.583754 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0286  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 
455 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502891  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 
488 aa  170  6e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00134459  hitchhiker  0.00520721 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2618  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 
436 aa  169  8e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.252609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>