More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4087 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_4087  prephenate dehydratase  100 
 
 		 290 aa  604  9.999999999999999e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0037  prephenate dehydratase  77.22 
 
 		 287 aa  460  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771092  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0037  prephenate dehydratase  77.22 
 
 		 287 aa  460  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.51728  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0018  prephenate dehydratase  75.09 
 
 		 287 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4403  prephenate dehydratase  74.1 
 
 		 284 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4083  prephenate dehydratase  74.1 
 
 		 284 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3428  prephenate dehydratase  73.38 
 
 		 284 aa  433  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0105  prephenate dehydratase  71.26 
 
 		 265 aa  397  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3732  prephenate dehydratase  65.72 
 
 		 286 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3538  prephenate dehydratase  64.31 
 
 		 284 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4217  prephenate dehydratase  65.36 
 
 		 280 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.239434  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7058  prephenate dehydratase  63.96 
 
 		 286 aa  381  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1767  prephenate dehydratase  64.66 
 
 		 284 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3356  prephenate dehydratase  65.45 
 
 		 288 aa  375  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.539085  normal  0.173573 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0285  prephenate dehydratase  64.31 
 
 		 286 aa  373  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.224737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0365  prephenate dehydratase  64.31 
 
 		 286 aa  372  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1620  prephenate dehydratase  62.37 
 
 		 284 aa  363  2e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2629  prephenate dehydratase  62.18 
 
 		 286 aa  362  3e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3606  Prephenate dehydratase  63.33 
 
 		 285 aa  357  9.999999999999999e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0511  prephenate dehydratase  62.72 
 
 		 284 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3518  prephenate dehydratase  59.3 
 
 		 310 aa  351  8.999999999999999e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3912  Prephenate dehydratase  60.14 
 
 		 288 aa  347  1e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0384  Prephenate dehydratase  63.08 
 
 		 285 aa  346  2e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.020412  normal  0.492047 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0339  prephenate dehydratase  63.08 
 
 		 285 aa  345  5e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0418  Prephenate dehydratase  62.01 
 
 		 287 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3650  prephenate dehydratase  63.77 
 
 		 285 aa  338  7e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.243627  normal  0.169343 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0252  prephenate dehydratase  58.01 
 
 		 293 aa  326  3e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0170  prephenate dehydratase  58.16 
 
 		 287 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0706  prephenate dehydratase  57.04 
 
 		 300 aa  315  5e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.146743  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0524  prephenate dehydratase  57.4 
 
 		 277 aa  315  8e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0734392  normal  0.460167 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2361  prephenate dehydratase  56.68 
 
 		 277 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.814265  normal  0.327119 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0653  prephenate dehydratase  52.52 
 
 		 280 aa  310  1e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3162  prephenate dehydratase  56.2 
 
 		 288 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309807  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1809  prephenate dehydratase  52.63 
 
 		 295 aa  300  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.115737 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1988  prephenate dehydratase  53.96 
 
 		 287 aa  298  6e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630591  normal  0.549246 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2951  prephenate dehydratase  53 
 
 		 286 aa  297  1e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.217306 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2554  prephenate dehydratase  51.66 
 
 		 276 aa  295  6e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183494 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0642  prephenate dehydratase  52.31 
 
 		 287 aa  291  7e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0930161  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3865  prephenate dehydratase  50 
 
 		 276 aa  289  4e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0369345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4580  prephenate dehydratase  57.35 
 
 		 282 aa  288  1e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0467  prephenate dehydratase  57.09 
 
 		 296 aa  284  1.0000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0622  prephenate dehydratase  53.41 
 
 		 297 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.284363  normal  0.610727 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4688  prephenate dehydratase  55.43 
 
 		 299 aa  259  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0153843  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0102  prephenate dehydratase  48.39 
 
 		 287 aa  256  3e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.29138  normal  0.214423 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3003  prephenate dehydratase  44.96 
 
 		 288 aa  236  3e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1881  prephenate dehydratase  45.15 
 
 		 298 aa  233  4.0000000000000004e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858484 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0877  Prephenate dehydratase  39.11 
 
 		 288 aa  194  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0495  Prephenate dehydratase  39.71 
 
 		 279 aa  193  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1293  Prephenate dehydratase  41.01 
 
 		 293 aa  189  2.9999999999999997e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.821795  normal  0.378721 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0537  prephenate dehydratase  37.73 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2091  Chorismate mutase  40.22 
 
 		 280 aa  183  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.746584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0541  Prephenate dehydratase  38.27 
 
 		 279 aa  176  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0474  Prephenate dehydratase  37.73 
 
 		 279 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1644  prephenate dehydratase  37.32 
 
 		 280 aa  172  5e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0633  Prephenate dehydratase  42.49 
 
 		 285 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  34.29 
 
 		 358 aa  172  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1567  prephenate dehydratase  33.83 
 
 		 271 aa  172  7.999999999999999e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0881  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  35 
 
 		 385 aa  168  9e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.304992  normal  0.0807055 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0656  Prephenate dehydratase  36.76 
 
 		 276 aa  168  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.416459  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  39.07 
 
 		 277 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2043  prephenate dehydratase  38.15 
 
 		 283 aa  165  6.9999999999999995e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.64689  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.93 
 
 		 358 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  39.84 
 
 		 356 aa  164  1.0000000000000001e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0180  prephenate dehydratase  36 
 
 		 283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  33.57 
 
 		 358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  38.99 
 
 		 277 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  38.99 
 
 		 277 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3077  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.42 
 
 		 396 aa  162  5.0000000000000005e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0866115  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  37.73 
 
 		 371 aa  162  6e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  37.13 
 
 		 371 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.86 
 
 		 371 aa  158  8e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3218  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.31 
 
 		 385 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.631051  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1133  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.67 
 
 		 386 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3355  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.31 
 
 		 385 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3482  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.31 
 
 		 385 aa  157  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.335091 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3146  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.67 
 
 		 386 aa  155  6e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.831222  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  35.77 
 
 		 355 aa  155  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1686  chorismate mutase / prephenate dehydratase  35.74 
 
 		 355 aa  154  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2883  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.04 
 
 		 386 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0920297  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_3267  predicted protein  32.24 
 
 		 304 aa  152  5.9999999999999996e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2986  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.04 
 
 		 386 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000154451  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2853  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.04 
 
 		 393 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0999  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.67 
 
 		 393 aa  152  8.999999999999999e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02488  fused chorismate mutase P/prephenate dehydratase  35.04 
 
 		 386 aa  151  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.610433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1075  chorismate mutase  35.04 
 
 		 386 aa  151  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2756  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.04 
 
 		 386 aa  151  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  8.8068e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2751  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.04 
 
 		 386 aa  151  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000608431  normal  0.0711319 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3838  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.04 
 
 		 386 aa  151  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000574807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1084  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.04 
 
 		 386 aa  151  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.165593  hitchhiker  0.00000412255 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02452  hypothetical protein  35.04 
 
 		 386 aa  151  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.699641  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1547  prephenate dehydratase  33.82 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1341  prephenate dehydratase  31.75 
 
 		 384 aa  150  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409344  normal  0.126516 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  35.51 
 
 		 365 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  36 
 
 		 355 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  36.27 
 
 		 272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1437  prephenate dehydratase  33.09 
 
 		 276 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1937  Chorismate mutase  34.31 
 
 		 274 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0071  prephenate dehydratase  34.93 
 
 		 324 aa  145  6e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1590  chorismate mutase  31.27 
 
 		 399 aa  145  6e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1303  prephenate dehydratase  33.09 
 
 		 276 aa  145  1e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>