More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4057 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_3432  DNA polymerase III subunits gamma and tau  61.45 
 
 
625 aa  707    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1238  DNA polymerase III subunits gamma and tau  55.3 
 
 
634 aa  676    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0034  DNA polymerase III subunits gamma and tau  63.64 
 
 
602 aa  759    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0330154  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  63.65 
 
 
605 aa  764    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00653224  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4397  DNA polymerase III subunits gamma and tau  61.08 
 
 
625 aa  692    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4077  DNA polymerase III subunits gamma and tau  60.54 
 
 
626 aa  692    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0034  DNA polymerase III subunits gamma and tau  63.64 
 
 
602 aa  759    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.330023  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4057  DNA polymerase III subunits gamma and tau  100 
 
 
600 aa  1217    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.495634  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0110  DNA polymerase III subunits gamma and tau  59.74 
 
 
631 aa  688    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.801093  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1861  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  57.64 
 
 
628 aa  626  1e-178  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.33363  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2196  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  57.47 
 
 
626 aa  624  1e-177  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2168  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  55.82 
 
 
622 aa  609  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531905  normal  0.517298 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7346  DNA polymerase III subunits gamma and tau  54.37 
 
 
613 aa  607  9.999999999999999e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1812  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  55.85 
 
 
623 aa  605  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.181409  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4848  DNA polymerase III subunits gamma and tau  53.76 
 
 
618 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.4336  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0369  DNA polymerase III subunits gamma and tau  53.49 
 
 
611 aa  595  1e-169  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.797615 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0462  DNA polymerase III subunits gamma and tau  52.26 
 
 
615 aa  592  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0619  DNA polymerase III subunits gamma and tau  52.17 
 
 
623 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0668  DNA polymerase III subunits gamma and tau  52.88 
 
 
627 aa  588  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.365881 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0087  DNA polymerase III subunits gamma and tau  51.32 
 
 
624 aa  588  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.818033  normal  0.0455941 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  55.29 
 
 
605 aa  570  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557596 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0274  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  52.93 
 
 
628 aa  561  1e-158  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.077817 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0255  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  53.51 
 
 
623 aa  553  1e-156  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0256  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  50.65 
 
 
651 aa  549  1e-155  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0966021  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4752  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  67.11 
 
 
605 aa  523  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169989  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0650  DNA polymerase III subunits gamma and tau  48.49 
 
 
587 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0107119  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0521  DNA polymerase III subunits gamma and tau  50.61 
 
 
582 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.067552  normal  0.421793 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3142  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  66.14 
 
 
637 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0166  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.32 
 
 
608 aa  505  9.999999999999999e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2365  DNA polymerase III subunits gamma and tau  50.44 
 
 
580 aa  504  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.153654 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0710  DNA polymerase III subunits gamma and tau  50.44 
 
 
582 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3876  DNA polymerase III subunits gamma and tau  48.9 
 
 
584 aa  498  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.151315 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0435  DNA polymerase III subunits gamma and tau  48.23 
 
 
606 aa  484  1e-135  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.853663  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3649  DNA polymerase III subunits gamma and tau  48.13 
 
 
592 aa  483  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.89772  normal  0.739746 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2000  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.49 
 
 
614 aa  464  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4575  DNA polymerase III subunits gamma and tau  59.84 
 
 
632 aa  444  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3473  DNA polymerase III subunits gamma and tau  59.16 
 
 
659 aa  444  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0055  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  58.82 
 
 
582 aa  433  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0628794  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0796  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.72 
 
 
565 aa  412  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0481374 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2909  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.81 
 
 
687 aa  411  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0213338 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1357  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.56 
 
 
573 aa  379  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0803491  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1060  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  34.97 
 
 
533 aa  331  3e-89  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.077321  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1738  DNA polymerase III, gamma subunit / DNA polymerase III, tau subunit  44.85 
 
 
605 aa  316  8e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0751015  normal  0.0509359 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0942  DNA-directed DNA polymerase  41.64 
 
 
491 aa  310  4e-83  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0014  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.53 
 
 
505 aa  310  5e-83  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.547641  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3801  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.15 
 
 
681 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44630  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.15 
 
 
701 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522569  normal  0.208913 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19830  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.32 
 
 
694 aa  307  4.0000000000000004e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2647  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.04 
 
 
692 aa  303  9e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.377545  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4269  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.6 
 
 
691 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3646  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.04 
 
 
743 aa  302  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.923315  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1825  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.04 
 
 
736 aa  302  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1805  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.32 
 
 
696 aa  302  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3834  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.6 
 
 
687 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.471872 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1599  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.6 
 
 
692 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0852408 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3587  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.32 
 
 
689 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0094  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  41.23 
 
 
579 aa  301  3e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1826  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.28 
 
 
893 aa  301  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.297137 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2361  DNA-directed DNA polymerase  45.28 
 
 
957 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.832917  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1858  DNA-directed DNA polymerase  45.68 
 
 
580 aa  299  8e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1335  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.98 
 
 
690 aa  298  2e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0235479  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4327  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.51 
 
 
579 aa  298  3e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.923822  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0857  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.94 
 
 
681 aa  296  6e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0806  AAA ATPase, central region  44.23 
 
 
537 aa  296  8e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343257  unclonable  0.000000100554 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1454  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.66 
 
 
751 aa  295  2e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000325473  normal  0.0490605 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1458  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.6 
 
 
723 aa  294  3e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0951  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.44 
 
 
793 aa  294  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.127107  normal  0.667155 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2381  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.44 
 
 
921 aa  293  4e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000191992  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02443  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.01 
 
 
698 aa  293  5e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2593  DNA-directed DNA polymerase  43.21 
 
 
529 aa  293  6e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11541  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1508  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.06 
 
 
948 aa  292  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000466847  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2852  DNA-directed DNA polymerase  42.78 
 
 
955 aa  291  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00013426  hitchhiker  0.000000946714 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0374  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  42.82 
 
 
582 aa  291  3e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000945747  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3422  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.53 
 
 
582 aa  291  3e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.087707  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2235  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.78 
 
 
1113 aa  289  8e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00400296  decreased coverage  0.0000493259 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2129  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.96 
 
 
795 aa  289  9e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.25169  normal  0.3831 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2897  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.71 
 
 
914 aa  289  1e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.579528  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1793  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.78 
 
 
911 aa  289  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00315607  hitchhiker  0.000000397841 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1851  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.61 
 
 
793 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.51542  normal  0.226661 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0365  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.23 
 
 
551 aa  288  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00200762  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2407  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.22 
 
 
939 aa  288  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000837393  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3039  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.06 
 
 
678 aa  287  4e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2219  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.89 
 
 
812 aa  287  4e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.373497  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1510  DNA polymerase III, tau subunit / DNA polymerase III, gamma subunit  43.77 
 
 
648 aa  287  4e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0569414  normal  0.564841 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0195  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.49 
 
 
579 aa  287  5e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92139e-31 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1769  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.5 
 
 
1115 aa  287  5e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000438447  hitchhiker  0.00599619 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1851  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.89 
 
 
825 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0281713  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1361  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.89 
 
 
825 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.926406  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1123  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.89 
 
 
825 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.496963  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0045  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.89 
 
 
825 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.787094  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2206  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.89 
 
 
826 aa  286  7e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236828  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2373  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.89 
 
 
822 aa  286  8e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0212  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.04 
 
 
582 aa  286  8e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.783119  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2690  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.46 
 
 
1137 aa  286  8e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00745534  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2574  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.46 
 
 
1147 aa  286  9e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000534901  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2244  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.89 
 
 
825 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748475  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5128  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.61 
 
 
791 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00417503  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0529  DNA-directed DNA polymerase  39.82 
 
 
696 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000324921  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1738  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.61 
 
 
813 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206235  normal  0.0482422 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2112  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.74 
 
 
730 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.635796  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>