36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4022 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_4022  CysZ-like protein  100 
 
 
243 aa  464  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3442  CysZ-like protein  61.54 
 
 
237 aa  284  8e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0167  CysZ-like protein  65.37 
 
 
237 aa  271  7e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0160  CysZ-like protein  65.37 
 
 
237 aa  271  7e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0177  CysZ-like protein  62.66 
 
 
242 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.7767  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3744  CysZ-like protein  60.5 
 
 
237 aa  255  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3841  CysZ-like protein  61.14 
 
 
235 aa  246  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3414  CysZ-like protein  63.79 
 
 
250 aa  236  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585186  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1350  CysZ-like protein  48.25 
 
 
239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0583  protein of unknown function DUF540  47.41 
 
 
241 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0573  hypothetical protein  46.98 
 
 
241 aa  186  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.60621  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0368  protein of unknown function DUF540  47.81 
 
 
238 aa  180  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141311  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0547  protein of unknown function DUF540  47.84 
 
 
239 aa  180  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0474  CysZ-like protein  43.16 
 
 
248 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0205  CysZ-like protein  44.16 
 
 
250 aa  171  6.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.611011  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0378  CysZ-like protein  42.74 
 
 
249 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.953327  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0349  CysZ-like protein  42.31 
 
 
247 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.317609  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0060  CysZ-like protein  44.16 
 
 
246 aa  169  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.29129  normal  0.117031 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0441  CysZ-like protein  41.03 
 
 
251 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0068  CysZ-like protein  42.36 
 
 
246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2241  hypothetical protein  46.54 
 
 
238 aa  162  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00757602  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2691  hypothetical protein  45.26 
 
 
233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0238338  normal  0.25801 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1152  hypothetical protein  44.3 
 
 
237 aa  160  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3566  hypothetical protein  42.17 
 
 
226 aa  153  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1307  hypothetical protein  43.42 
 
 
231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0151  protein of unknown function DUF540  48.17 
 
 
240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.236012 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2467  hypothetical protein  36.29 
 
 
230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.29772 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0150  hypothetical protein  40.61 
 
 
227 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.660436  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0810  hypothetical protein  36.29 
 
 
230 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0370  hypothetical protein  38.43 
 
 
231 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775974  normal  0.439004 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0694  hypothetical protein  33.78 
 
 
230 aa  113  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.444998  normal  0.0165633 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2628  hypothetical protein  33.74 
 
 
236 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.0429489 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3162  hypothetical protein  33.47 
 
 
237 aa  102  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2176  hypothetical protein  36.24 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4648  hypothetical protein  27.61 
 
 
249 aa  54.7  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3425  hypothetical protein  24.69 
 
 
244 aa  44.3  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00373328  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>