More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4021 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_4021  PfkB  100 
 
 		 330 aa  677    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  72.12 
 
 		 330 aa  504  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  72.12 
 
 		 330 aa  504  9.999999999999999e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  71 
 
 		 331 aa  490  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  69.39 
 
 		 330 aa  475  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  66.67 
 
 		 330 aa  462  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  66.06 
 
 		 330 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  66.06 
 
 		 330 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  56.53 
 
 		 333 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  56.84 
 
 		 333 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  58.48 
 
 		 333 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  56.4 
 
 		 333 aa  365  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  56.84 
 
 		 333 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  55.83 
 
 		 331 aa  363  3e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  53.82 
 
 		 335 aa  361  9e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  54.71 
 
 		 333 aa  360  2e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  55.21 
 
 		 331 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  56.17 
 
 		 333 aa  355  5e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  56.97 
 
 		 333 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  53.12 
 
 		 337 aa  352  4e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  53.12 
 
 		 337 aa  352  4e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  53.41 
 
 		 337 aa  351  1e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  53.89 
 
 		 337 aa  348  6e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  51.81 
 
 		 337 aa  342  4e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  53.99 
 
 		 329 aa  340  2e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  51.52 
 
 		 407 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  51.25 
 
 		 328 aa  324  2e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  49.69 
 
 		 342 aa  319  5e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  49.22 
 
 		 338 aa  317  2e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  50.15 
 
 		 333 aa  313  2.9999999999999996e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  48.93 
 
 		 338 aa  312  4.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  46.88 
 
 		 332 aa  309  5e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  45.28 
 
 		 348 aa  305  5.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1668  carbohydrate kinase PfkB family  50 
 
 		 337 aa  303  2.0000000000000002e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2989  ribokinase-like domain-containing protein  47.88 
 
 		 338 aa  302  5.000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  45.45 
 
 		 335 aa  286  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  45.82 
 
 		 331 aa  284  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  45.14 
 
 		 335 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  49.04 
 
 		 330 aa  278  1e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  45.02 
 
 		 330 aa  273  3e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1030  pfkB family carbohydrate kinase  44.88 
 
 		 330 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.577037  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  40.68 
 
 		 338 aa  270  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2691  ribokinase-like domain-containing protein  44.28 
 
 		 330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272607  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  40.94 
 
 		 333 aa  265  5.999999999999999e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  39.94 
 
 		 334 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  40.94 
 
 		 333 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0198  ribokinase-like domain-containing protein  44.58 
 
 		 330 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1671  PfkB  42.04 
 
 		 331 aa  255  7e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  43.73 
 
 		 333 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2872  ribokinase-like domain-containing protein  42.11 
 
 		 335 aa  231  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  39.24 
 
 		 333 aa  207  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  39.12 
 
 		 328 aa  205  7e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  35.42 
 
 		 327 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  35.42 
 
 		 327 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  35.22 
 
 		 331 aa  188  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  32.42 
 
 		 336 aa  178  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  32.4 
 
 		 328 aa  177  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  31.45 
 
 		 330 aa  175  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  36.68 
 
 		 370 aa  171  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  30.84 
 
 		 341 aa  166  4e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  31.79 
 
 		 339 aa  160  3e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  30.56 
 
 		 339 aa  157  2e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  33.75 
 
 		 334 aa  156  6e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  33.76 
 
 		 328 aa  147  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  30.22 
 
 		 360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  28.08 
 
 		 303 aa  93.6  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  28.77 
 
 		 317 aa  87.8  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  30.22 
 
 		 329 aa  85.9  9e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  27.93 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18364  predicted protein  27.08 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.132458 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  24.32 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02272  adenosine kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06390)  26.84 
 
 		 352 aa  82  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0154807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  26.14 
 
 		 339 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  24.62 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  24.62 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  24.62 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  25.61 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0252  PfkB domain protein  25.86 
 
 		 283 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  23.48 
 
 		 310 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  24.71 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  26.34 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  27.37 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  24.32 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  24.32 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  24.01 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  24.01 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  24.01 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  29.06 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  26.82 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  26.1 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50659  predicted protein  25.82 
 
 		 347 aa  76.3  0.0000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2014  PfkB domain protein  27.03 
 
 		 324 aa  75.5  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0949  PfkB  30.57 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  26.05 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  24.81 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  27.84 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  26.21 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  27.24 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN02130  adenosine kinase, putative  25.28 
 
 		 357 aa  73.6  0.000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.339104  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  25.81 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>