More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4019 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  100 
 
 
222 aa  446  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  72.44 
 
 
204 aa  244  5e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  71.26 
 
 
208 aa  242  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  71.86 
 
 
230 aa  239  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  71.26 
 
 
230 aa  238  4e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  67.47 
 
 
222 aa  237  1e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  65.91 
 
 
210 aa  234  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  70.37 
 
 
228 aa  233  2e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  69.18 
 
 
210 aa  231  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0188  heat shock protein GrpE  66.26 
 
 
206 aa  223  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.88 
 
 
204 aa  222  4e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  64.2 
 
 
202 aa  218  4e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0415  GrpE protein  60.43 
 
 
202 aa  218  6e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.45 
 
 
202 aa  218  8e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  64.2 
 
 
207 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  58.38 
 
 
226 aa  215  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0427  heat shock protein GrpE  63.35 
 
 
206 aa  213  2e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.43 
 
 
217 aa  211  6e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0327  heat shock protein GrpE  66.01 
 
 
205 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.22 
 
 
207 aa  209  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2800  GrpE protein  54.7 
 
 
187 aa  203  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  64.71 
 
 
203 aa  200  1e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0393  heat shock protein GrpE  62.16 
 
 
206 aa  198  4e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0195  heat shock protein GrpE  62.75 
 
 
197 aa  196  3e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.721857  normal  0.870484 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0337  GrpE protein  53.89 
 
 
201 aa  191  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.387309  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  55.33 
 
 
213 aa  169  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3004  GrpE protein  49.68 
 
 
210 aa  155  4e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3643  GrpE protein  47.02 
 
 
221 aa  140  2e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58693  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0252  GrpE protein  48 
 
 
181 aa  138  5e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  44.83 
 
 
210 aa  139  5e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2059  GrpE protein  46.5 
 
 
186 aa  138  6e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  44.67 
 
 
201 aa  137  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  9.57049e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  41.9 
 
 
181 aa  134  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0165  heat shock protein GrpE  46.9 
 
 
205 aa  133  2e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.261628  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  43.05 
 
 
206 aa  134  2e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  1.25429e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7788  putative heat shock protein (HSP-70 cofactor), grpE  42.13 
 
 
181 aa  132  4e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0272135  normal  0.30698 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  43.75 
 
 
194 aa  132  5e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  5.6941e-08  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0111  GrpE protein  40.12 
 
 
199 aa  131  6e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  42.31 
 
 
206 aa  131  7e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  43.33 
 
 
209 aa  131  7e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  46.38 
 
 
193 aa  130  1e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  44.06 
 
 
201 aa  130  1e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  1.03997e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  35.75 
 
 
206 aa  130  1e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  7.75754e-08  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  42.96 
 
 
200 aa  129  4e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  1.63848e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  35.82 
 
 
203 aa  129  4e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  3.69534e-09  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3465  protein GrpE  44.97 
 
 
197 aa  129  4e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  40.4 
 
 
206 aa  128  6e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  8.27789e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  46.1 
 
 
187 aa  128  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  40.4 
 
 
206 aa  128  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  7.98826e-07  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  40.4 
 
 
206 aa  128  6e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.63417e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  35.82 
 
 
203 aa  128  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  4.98857e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  40.4 
 
 
206 aa  128  6e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  7.67299e-10  decreased coverage  7.11999e-08 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  41.83 
 
 
205 aa  128  8e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  9.76111e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  41.18 
 
 
209 aa  127  9e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  4.35816e-05  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1974  GrpE protein  42.36 
 
 
210 aa  126  2e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.26677  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1219  putative chaperone protein GrpE (heat shock protein)  44.38 
 
 
189 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  44.87 
 
 
186 aa  125  4e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14947  mitochondrial GrpE-like protein  43.24 
 
 
240 aa  125  7e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0088904  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2874  GrpE protein  42.5 
 
 
187 aa  125  7e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.423884 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0168  co-chaperone GrpE  40 
 
 
203 aa  124  1e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3823  co-chaperone GrpE  42.86 
 
 
209 aa  124  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131676  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  46.67 
 
 
181 aa  124  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0008  GrpE protein  44.97 
 
 
179 aa  124  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  44.1 
 
 
200 aa  123  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15032  predicted protein  43.54 
 
 
157 aa  123  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.189878  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2656  GrpE protein  44.87 
 
 
186 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23931  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1901  GrpE protein  39.9 
 
 
218 aa  123  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.489852  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  41.55 
 
 
204 aa  121  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  46.84 
 
 
198 aa  121  8e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64096  predicted protein  41.22 
 
 
188 aa  120  1e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20813  normal  0.0799005 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3965  GrpE protein  44.23 
 
 
192 aa  120  2e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  41.5 
 
 
186 aa  120  2e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2499  heat shock protein GrpE  42.54 
 
 
202 aa  120  2e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0710839  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  41.45 
 
 
212 aa  119  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1004  heat shock protein GrpE  44.83 
 
 
180 aa  119  4e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.324391 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1227  heat shock protein GrpE  44.51 
 
 
189 aa  119  5e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.830838  hitchhiker  0.00575896 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0208  GrpE protein  42.07 
 
 
188 aa  118  6e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  43.07 
 
 
198 aa  117  1e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0736  heat shock protein GrpE  47.18 
 
 
194 aa  117  1e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273487  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1306  heat shock protein GrpE  47.55 
 
 
178 aa  117  1e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  37.3 
 
 
189 aa  117  1e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2328  heat shock protein GrpE  47.55 
 
 
185 aa  116  2e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0498  heat shock protein GrpE  47.55 
 
 
185 aa  116  2e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.755488  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  41.38 
 
 
193 aa  116  2e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1101  heat shock protein GrpE  47.55 
 
 
185 aa  116  2e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322152  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  41.78 
 
 
200 aa  117  2e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  4.5112e-09  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3324  heat shock protein GrpE  47.55 
 
 
185 aa  116  2e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2208  heat shock protein GrpE  47.55 
 
 
185 aa  116  2e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3313  heat shock protein GrpE  47.55 
 
 
185 aa  116  2e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3280  heat shock protein GrpE  47.55 
 
 
185 aa  116  2e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135957  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2635  heat shock protein GrpE  46.85 
 
 
181 aa  116  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1040  heat shock protein GrpE  46.26 
 
 
184 aa  116  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  40.69 
 
 
210 aa  116  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  40.48 
 
 
245 aa  115  4e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2468  heat shock protein GrpE  48.92 
 
 
215 aa  115  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.338096  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  41.33 
 
 
185 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  42.11 
 
 
189 aa  115  7e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2570  heat shock protein GrpE  45.86 
 
 
178 aa  114  1e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  40.67 
 
 
185 aa  114  1e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0719  heat shock protein GrpE  45.45 
 
 
181 aa  114  1e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76077  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>