262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3984 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3984  3'-5' exonuclease  100 
 
 
205 aa  423  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0117  3'-5' exonuclease family protein  77.56 
 
 
205 aa  344  5e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0135  3'-5' exonuclease  77.07 
 
 
205 aa  343  1e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0120  3'-5' exonuclease family protein  77.07 
 
 
205 aa  341  5e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1219  3'-5' exonuclease domain-containing protein  72.2 
 
 
206 aa  303  8.000000000000001e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485799  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4028  3'-5' exonuclease  71.84 
 
 
208 aa  301  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0120  ribonuclease D  71.84 
 
 
208 aa  298  3e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.818192  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4358  3'-5' exonuclease  71.36 
 
 
208 aa  297  7e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00583903 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0419  3'-5' exonuclease  71.22 
 
 
204 aa  294  5e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0125  putative 3'-5' exonuclease family protein  69.76 
 
 
204 aa  292  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00602859  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3464  3'-5' exonuclease  70.39 
 
 
208 aa  292  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0171  3'-5' exonuclease  66.67 
 
 
206 aa  285  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0179  3'-5' exonuclease  67.63 
 
 
206 aa  285  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00803697  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0174  3'-5' exonuclease  68.29 
 
 
204 aa  284  5e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0659  3'-5' exonuclease  68.29 
 
 
204 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.265112 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0047  3'-5' exonuclease  67.8 
 
 
204 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0027  3'-5' exonuclease  64.56 
 
 
204 aa  268  5e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.189554  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0155  3'-5' exonuclease  63.73 
 
 
204 aa  262  3e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.299764 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2425  3'-5' exonuclease  64.04 
 
 
209 aa  261  4e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0228  3'-5' exonuclease  61.35 
 
 
203 aa  258  3e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5275  3'-5' exonuclease  61.95 
 
 
204 aa  258  4e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28449  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0572  3'-5' exonuclease  63.9 
 
 
204 aa  258  4e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5125  3'-5' exonuclease  64.39 
 
 
207 aa  257  8e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0268839  normal  0.933758 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3589  3'-5' exonuclease  62.93 
 
 
203 aa  257  9e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2497  3'-5' exonuclease  62.75 
 
 
209 aa  256  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325432  normal  0.308179 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5922  3'-5' exonuclease  63.41 
 
 
204 aa  254  7e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0068  3'-5' exonuclease  63.46 
 
 
206 aa  254  7e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2609  3'-5' exonuclease  61.54 
 
 
204 aa  253  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2720  3'-5' exonuclease  62.25 
 
 
209 aa  252  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.149721  normal  0.0609935 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2775  3'-5' exonuclease  62.02 
 
 
204 aa  251  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1152  ribonuclease D  61.95 
 
 
204 aa  249  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2813  3'-5' exonuclease  62.62 
 
 
204 aa  249  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0196  3'-5' exonuclease  57.35 
 
 
203 aa  242  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.950897 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0015  3'-5' exonuclease  57.64 
 
 
206 aa  238  5e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0333  3'-5' exonuclease  58.13 
 
 
210 aa  237  6.999999999999999e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.273167  normal  0.287022 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1669  3'-5' exonuclease  56.94 
 
 
218 aa  235  3e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.335885  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1011  3'-5' exonuclease family protein  55.12 
 
 
204 aa  235  3e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0881939  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0109  3'-5' exonuclease  57.21 
 
 
204 aa  233  1.0000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.378562  normal  0.35649 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0816  3'-5' exonuclease  57 
 
 
216 aa  232  2.0000000000000002e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00362431  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4954  3'-5' exonuclease  57.56 
 
 
205 aa  231  5e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.332898  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2343  3'-5' exonuclease  56.94 
 
 
205 aa  229  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0529  3'-5' exonuclease family protein  56.99 
 
 
206 aa  224  7e-58  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3251  3'-5' exonuclease  56.1 
 
 
205 aa  223  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2903  3'-5' exonuclease  56.1 
 
 
205 aa  218  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.865613  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0878  3'-5' exonuclease  52.68 
 
 
206 aa  215  4e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0327  3'-5' exonuclease  54.05 
 
 
213 aa  200  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3799  3'-5' exonuclease  50.99 
 
 
209 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2509  3'-5' exonuclease  52.02 
 
 
209 aa  195  4.0000000000000005e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1914  3'-5' exonuclease  49.76 
 
 
209 aa  190  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1621  3'-5' exonuclease  50.52 
 
 
207 aa  189  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.169628  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0678  3'-5' exonuclease  50.49 
 
 
211 aa  183  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2246  3'-5' exonuclease  50.8 
 
 
217 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.520239  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1118  3'-5' exonuclease  48 
 
 
210 aa  175  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1147  3'-5' exonuclease  48 
 
 
210 aa  175  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1676  putative ribonuclease D  48.11 
 
 
211 aa  171  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17921  putative ribonuclease D  45.45 
 
 
211 aa  167  9e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0407  3'-5' exonuclease  47.57 
 
 
214 aa  164  9e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.23143  normal  0.475558 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17761  putative ribonuclease D  44.44 
 
 
211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17711  putative ribonuclease D  41.27 
 
 
213 aa  161  7e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.606229  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1922  3'-5' exonuclease  47.49 
 
 
214 aa  160  1e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0431536  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17051  putative ribonuclease D  44.09 
 
 
214 aa  160  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20321  putative ribonuclease D  44.25 
 
 
214 aa  151  5e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1157  putative ribonuclease D  43.68 
 
 
214 aa  150  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22631  putative ribonuclease D  46.71 
 
 
212 aa  144  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.528712 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1164  3'-5' exonuclease  38.01 
 
 
550 aa  96.7  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0638405  normal  0.521406 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2365  ribonuclease D  36.36 
 
 
392 aa  90.9  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1734  ribonuclease D  35.71 
 
 
381 aa  89.4  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.312389  decreased coverage  0.00186691 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0208  ribonuclease D  33.12 
 
 
405 aa  89  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.790947 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1310  ribonuclease D  35.06 
 
 
393 aa  87  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0761558  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1337  ribonuclease D  30.57 
 
 
405 aa  86.7  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118451  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0703  3'-5' exonuclease  31.41 
 
 
386 aa  86.3  3e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.807909  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2378  ribonuclease D  32.47 
 
 
388 aa  85.9  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0306951  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0750  ribonuclease D  30.86 
 
 
385 aa  84.7  9e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0744  ribonuclease D  30.86 
 
 
385 aa  84.7  9e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0506  ribonuclease D  31.41 
 
 
395 aa  84.7  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1589  ribonuclease D  34.52 
 
 
382 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2546  ribonuclease D  30.52 
 
 
389 aa  83.6  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3324  ribonuclease D  32.9 
 
 
427 aa  82.4  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.342463  normal  0.392849 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2112  ribonuclease D  35.12 
 
 
396 aa  82  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1588  ribonuclease D  29.48 
 
 
384 aa  82  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1887  putative ribonuclease D  31.25 
 
 
385 aa  81.6  0.000000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0137487  normal  0.150443 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12160  ribonuclease D  33.12 
 
 
392 aa  81.3  0.000000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0326  ribonuclease D  35.06 
 
 
392 aa  81.3  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0491656  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2542  ribonuclease D  29.14 
 
 
385 aa  80.9  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1389  ribonuclease D  31.17 
 
 
388 aa  80.1  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.465016 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2073  ribonuclease D  31.82 
 
 
386 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1838  ribonuclease D  32.91 
 
 
386 aa  80.1  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.529278  normal  0.0732716 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2334  ribonuclease D  32.69 
 
 
384 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2494  ribonuclease D  32.26 
 
 
382 aa  79  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121397  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4526  ribonuclease D  29.49 
 
 
394 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780043  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0799  ribonuclease D  30.06 
 
 
383 aa  79  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.42118  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1752  ribonuclease D  27.67 
 
 
395 aa  78.6  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00607213  normal  0.281233 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5131  ribonuclease D  27.74 
 
 
389 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06230  ribonuclease D  32.28 
 
 
399 aa  78.2  0.00000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000184069  hitchhiker  0.0058155 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0323  RNase D  31.95 
 
 
375 aa  77.8  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.85777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1582  3'-5' exonuclease  34.19 
 
 
385 aa  77.8  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1102  ribonuclease D  28.57 
 
 
381 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.447104 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0300  putative ribonuclease D  29.49 
 
 
387 aa  77  0.0000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2949  ribonuclease D  31.61 
 
 
392 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1474  ribonuclease D  29.11 
 
 
385 aa  76.6  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.366853  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>