More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3924 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0015  S-adenosylmethionine synthetase  83.57 
 
 
412 aa  689    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000616083 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0013  S-adenosylmethionine synthetase  84.12 
 
 
412 aa  694    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303357  normal  0.0988559 
 
 
-
 
NC_004310  BR2160  S-adenosylmethionine synthetase  81.6 
 
 
421 aa  703    Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00603906  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2072  S-adenosylmethionine synthetase  81.84 
 
 
421 aa  704    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0645702  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0046  S-adenosylmethionine synthetase  82.86 
 
 
426 aa  687    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0624552  hitchhiker  0.00000000150767 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3924  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 
426 aa  869    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1249  S-adenosylmethionine synthetase  75.89 
 
 
426 aa  646    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0444  S-adenosylmethionine synthetase  80.24 
 
 
412 aa  651    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00664731  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0752  S-adenosylmethionine synthetase  82.27 
 
 
420 aa  702    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1062  methionine adenosyltransferase  69.74 
 
 
398 aa  568  1e-161  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.323236  normal  0.678652 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1816  methionine adenosyltransferase  69.03 
 
 
397 aa  546  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0159943  normal  0.205319 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4546  S-adenosylmethionine synthetase  65.56 
 
 
398 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5699  S-adenosylmethionine synthetase  66.43 
 
 
399 aa  532  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.464938 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4154  S-adenosylmethionine synthetase  65.8 
 
 
398 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.509299  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1588  S-adenosylmethionine synthetase  65.56 
 
 
398 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2753  S-adenosylmethionine synthetase  65.8 
 
 
398 aa  531  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293666  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2378  S-adenosylmethionine synthetase  65.08 
 
 
398 aa  526  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.989714  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1596  S-adenosylmethionine synthetase  64.61 
 
 
398 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4493  methionine adenosyltransferase  66.43 
 
 
392 aa  514  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5288  methionine adenosyltransferase  65.48 
 
 
392 aa  513  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.344896 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5908  S-adenosylmethionine synthetase  65.48 
 
 
392 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.545702  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3506  Methionine adenosyltransferase  66.35 
 
 
391 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.996413  normal  0.604274 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3306  methionine adenosyltransferase  66.11 
 
 
391 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.636766 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3629  Methionine adenosyltransferase  66.11 
 
 
391 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0654869  normal  0.253839 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1012  S-adenosylmethionine synthetase  66.03 
 
 
394 aa  493  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3623  S-adenosylmethionine synthetase  61.1 
 
 
389 aa  485  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0706  S-adenosylmethionine synthetase  63.98 
 
 
393 aa  484  1e-136  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.479174 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0193  S-adenosylmethionine synthetase  63.98 
 
 
393 aa  480  1e-134  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.390697  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3776  S-adenosylmethionine synthetase  60.61 
 
 
389 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2439  S-adenosylmethionine synthetase  61.37 
 
 
388 aa  455  1e-127  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3877  S-adenosylmethionine synthetase  60.19 
 
 
388 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3595  S-adenosylmethionine synthetase  60.19 
 
 
388 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0230155  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3280  S-adenosylmethionine synthetase  60.19 
 
 
388 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.861099 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1873  S-adenosylmethionine synthetase  59.72 
 
 
388 aa  449  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.176283  normal  0.7494 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1054  S-adenosylmethionine synthetase  59.81 
 
 
395 aa  451  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1970  S-adenosylmethionine synthetase  59.33 
 
 
395 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3139  S-adenosylmethionine synthetase  56.98 
 
 
406 aa  442  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3373  S-adenosylmethionine synthetase  57.38 
 
 
402 aa  428  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.304144 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0027  S-adenosylmethionine synthetase  58.04 
 
 
407 aa  421  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0284  S-adenosylmethionine synthetase  55.76 
 
 
401 aa  404  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2521  S-adenosylmethionine synthetase  50 
 
 
388 aa  394  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_002978  WD0136  S-adenosylmethionine synthetase  49.29 
 
 
390 aa  390  1e-107  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0201  S-adenosylmethionine synthetase  50.84 
 
 
387 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4844  S-adenosylmethionine synthetase  53.12 
 
 
403 aa  388  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.277601 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0018  S-adenosylmethionine synthetase  49.4 
 
 
392 aa  390  1e-107  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5604  S-adenosylmethionine synthetase  50.71 
 
 
393 aa  388  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.617182 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0156  S-adenosylmethionine synthetase  50.84 
 
 
387 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3252  S-adenosylmethionine synthetase  51.42 
 
 
393 aa  389  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0660  S-adenosylmethionine synthetase  50.47 
 
 
395 aa  387  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00877697  decreased coverage  0.0019474 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0945  S-adenosylmethionine synthetase  48.44 
 
 
393 aa  387  1e-106  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0126  S-adenosylmethionine synthetase  50.35 
 
 
393 aa  386  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3880  S-adenosylmethionine synthetase  48.71 
 
 
393 aa  385  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.356419  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0705  S-adenosylmethionine synthetase  51.68 
 
 
393 aa  387  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.102884 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0979  S-adenosylmethionine synthetase  51.8 
 
 
393 aa  388  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0683  S-adenosylmethionine synthetase  51.68 
 
 
393 aa  387  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.842341  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0767  S-adenosylmethionine synthetase  51.2 
 
 
393 aa  382  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1126  S-adenosylmethionine synthetase  50.36 
 
 
393 aa  384  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2262  S-adenosylmethionine synthetase  51.07 
 
 
385 aa  381  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3840  S-adenosylmethionine synthetase  52.16 
 
 
387 aa  379  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.50059  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1256  S-adenosylmethionine synthetase  51.52 
 
 
395 aa  378  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.247936  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09870  methionine adenosyltransferase  48.41 
 
 
420 aa  377  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00866848 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0351  S-adenosylmethionine synthetase  52.27 
 
 
396 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.756862 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  50.35 
 
 
395 aa  372  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0501  S-adenosylmethionine synthetase  50.22 
 
 
420 aa  374  1e-102  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0139  S-adenosylmethionine synthetase  50.83 
 
 
389 aa  374  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4320  methionine adenosyltransferase  50.48 
 
 
387 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0850  S-adenosylmethionine synthetase  49.88 
 
 
388 aa  372  1e-102  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.876069  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  48.63 
 
 
403 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0044  S-adenosylmethionine synthetase  48.95 
 
 
388 aa  375  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000084119  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  49.07 
 
 
399 aa  369  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3874  methionine adenosyltransferase  47.6 
 
 
396 aa  370  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000696498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4660  S-adenosylmethionine synthetase  49.07 
 
 
399 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2924  S-adenosylmethionine synthetase  52.86 
 
 
395 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4517  S-adenosylmethionine synthetase  49.07 
 
 
399 aa  369  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536795  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3262  S-adenosylmethionine synthetase  52.86 
 
 
395 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1999  S-adenosylmethionine synthetase  49.4 
 
 
382 aa  370  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2989  Methionine adenosyltransferase  50.46 
 
 
399 aa  369  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0828  S-adenosylmethionine synthetase  49.16 
 
 
388 aa  371  1e-101  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.296122  normal  0.0311874 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0395  S-adenosylmethionine synthetase  52.86 
 
 
395 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6431  S-adenosylmethionine synthetase  52.86 
 
 
395 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.335957 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1821  S-adenosylmethionine synthetase  50.72 
 
 
385 aa  370  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0267535  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  49.07 
 
 
399 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1777  S-adenosylmethionine synthetase  48.22 
 
 
392 aa  369  1e-101  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0211  S-adenosylmethionine synthetase  52.86 
 
 
395 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357003  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4877  S-adenosylmethionine synthetase  49.08 
 
 
399 aa  369  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000842328  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0174  S-adenosylmethionine synthetase  52.86 
 
 
395 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0085  methionine adenosyltransferase  48.33 
 
 
388 aa  369  1e-101  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.486268 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0470  S-adenosylmethionine synthetase  50.71 
 
 
382 aa  370  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4371  S-adenosylmethionine synthetase  52.38 
 
 
396 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2165  S-adenosylmethionine synthetase  52.86 
 
 
395 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2467  S-adenosylmethionine synthetase  52.51 
 
 
395 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3424  S-adenosylmethionine synthetase  52.86 
 
 
395 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1840  S-adenosylmethionine synthetase  49.53 
 
 
403 aa  370  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0363  S-adenosylmethionine synthetase  49.31 
 
 
399 aa  371  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000052915  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4886  S-adenosylmethionine synthetase  49.07 
 
 
399 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3078  S-adenosylmethionine synthetase  52.62 
 
 
407 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.138759 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2894  S-adenosylmethionine synthetase  50.97 
 
 
391 aa  371  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3081  S-adenosylmethionine synthetase  52.51 
 
 
395 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.735784  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0199  S-adenosylmethionine synthetase  52.86 
 
 
395 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3099  S-adenosylmethionine synthetase  52.51 
 
 
395 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>