More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3922 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3922  transporter-associated region  100 
 
 
353 aa  696    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0755  CBS domain-containing protein  58.24 
 
 
373 aa  366  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2069  CBS domain-containing protein  57.73 
 
 
374 aa  355  8.999999999999999e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00161693  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2157  CBS domain-containing protein  61.61 
 
 
342 aa  352  7e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.151926  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0043  CBS domain-containing protein  57.73 
 
 
391 aa  332  4e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0313302  hitchhiker  0.00000000114145 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0028  CBS domain containing protein  55.59 
 
 
377 aa  323  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490023  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0016  transporter-associated region  54.15 
 
 
383 aa  317  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.305218 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0441  hemolysin  53.59 
 
 
345 aa  311  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1246  magnesium and cobalt efflux protein CorC  49.51 
 
 
340 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.96607  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0232  CBS domain containing protein  50.59 
 
 
373 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1637  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2894  CBS domain containing protein  48.45 
 
 
357 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594512 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0049  transporter  50 
 
 
386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3179  CBS domain-containing protein  47.08 
 
 
389 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0353609  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0017  ctransporter-associated region  51.63 
 
 
375 aa  272  6e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0674373 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3531  CBS domain containing protein  48.62 
 
 
382 aa  271  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.307837  normal  0.3242 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3207  CBS domain-containing protein  48.62 
 
 
382 aa  271  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.403327  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0024  CBS:transporter-associated  50 
 
 
374 aa  270  2e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0239  HlyC/CorC family transporters  50.84 
 
 
375 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0449  CBS domain containing protein  50.84 
 
 
381 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0636  CBS domain-containing protein  46.92 
 
 
377 aa  268  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.693928 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3402  CBS domain containing protein  48.46 
 
 
384 aa  267  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.224461  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0593  HlyC/CorC family transporter  47.46 
 
 
376 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1058  CBS domain-containing protein  49.01 
 
 
344 aa  264  2e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279471  normal  0.884616 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0471  CBS  44.74 
 
 
420 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.603908 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3620  CBS domain-containing protein  47.68 
 
 
319 aa  245  6.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1813  CBS domain-containing protein  45.19 
 
 
324 aa  237  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.345805  normal  0.271676 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3036  CBS domain-containing protein  48.19 
 
 
296 aa  211  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3773  CBS domain-containing protein  40.58 
 
 
318 aa  206  6e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.163853  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0704  CBS  41.97 
 
 
312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.345067 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0024  CBS domain-containing protein  38.96 
 
 
304 aa  193  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307011  normal  0.720082 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3875  hypothetical protein  39.26 
 
 
314 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.266058  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0067  CBS domain containing protein  37.43 
 
 
324 aa  187  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0388003 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0191  CBS domain-containing protein  43.48 
 
 
300 aa  186  5e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1014  CBS domain containing protein  43.4 
 
 
302 aa  186  6e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0266413  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1356  CBS domain-containing protein  42.51 
 
 
289 aa  181  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0204179  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3282  CBS domain-containing protein  37.89 
 
 
315 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.847272 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3597  CorC/Hlyc family protein  37.89 
 
 
315 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0738043  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2158  CBS domain-containing protein  39.84 
 
 
314 aa  167  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.583239  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2391  CBS domain-containing protein  39.15 
 
 
322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  35.14 
 
 
426 aa  160  4e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  36.4 
 
 
421 aa  155  7e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0979  CBS  36.93 
 
 
313 aa  155  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.980181  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1807  CBS  33 
 
 
298 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223069  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3694  CBS domain-containing protein  42.56 
 
 
310 aa  154  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.548204  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3839  hypothetical protein  34.78 
 
 
425 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1330  CBS domain-containing protein  31.23 
 
 
275 aa  151  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.964649  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0011  CBS/transport-associated domain-containing protein  32.16 
 
 
295 aa  149  5e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0553  CBS domain containing protein  32.33 
 
 
273 aa  149  6e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116003 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  33.21 
 
 
420 aa  149  7e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1243  hemolysin C  31.8 
 
 
258 aa  149  1.0000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.419025  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004214  magnesium and cobalt efflux protein CorC  32.31 
 
 
299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.990364  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1394  hypothetical protein  30.72 
 
 
292 aa  146  5e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0031  hemolysin  28.9 
 
 
295 aa  146  6e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.551744  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  35.04 
 
 
434 aa  145  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0247  protein of unknown function DUF21  32.58 
 
 
446 aa  145  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1027  CBS domain-containing protein  27.91 
 
 
272 aa  144  2e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.847231  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1867  CBS domain containing protein  31.08 
 
 
285 aa  144  3e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545793 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1602  hypothetical protein  30.77 
 
 
292 aa  143  3e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2926  CBS domain-containing protein  30.39 
 
 
291 aa  144  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00659921 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  32.27 
 
 
284 aa  144  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000339521  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  35.04 
 
 
435 aa  143  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0710  CBS domain-containing protein  29.22 
 
 
292 aa  142  7e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.592544  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  33.59 
 
 
430 aa  142  8e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0890  CBS domain-containing protein  33.59 
 
 
291 aa  142  9e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.192583  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3140  CBS domain-containing protein  30.19 
 
 
293 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328358  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2578  magnesium and cobalt efflux protein CorC  30.29 
 
 
292 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0655  CBS domain containing protein  30.14 
 
 
273 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1468  CBS domain containing protein  33.46 
 
 
447 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0356908  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0240  Mg2+/Co2+ transporter  36 
 
 
291 aa  140  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  32.16 
 
 
284 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0433  transport protein ysiA  24.68 
 
 
445 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0060  CBS domain pair protein  30.2 
 
 
259 aa  140  3e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2036  CBS domain-containing protein  28.81 
 
 
296 aa  140  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1181  CBS domain containing protein  34 
 
 
299 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1178  magnesium and cobalt efflux protein CorC  29.74 
 
 
291 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12300  hypothetical protein  34.98 
 
 
279 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1936  CBS domain containing protein  31.07 
 
 
371 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1125  hypothetical protein  34.98 
 
 
279 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2741  transporter-associated region  31.82 
 
 
281 aa  140  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.835583  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0439  CBS/transporter associated domain-containing protein  24.68 
 
 
445 aa  139  6e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1126  protein of unknown function DUF21  29.77 
 
 
428 aa  138  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.93664  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2858  CBS domain-containing protein  29.08 
 
 
291 aa  138  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  29.08 
 
 
291 aa  138  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0791  CBS domain-containing protein  36.9 
 
 
483 aa  138  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.847387  normal  0.143113 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3980  CBS domain containing protein  33.33 
 
 
425 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3699  CBS domain-containing protein  29.64 
 
 
291 aa  138  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  34.41 
 
 
446 aa  138  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1001  CBS domain-containing protein  29.41 
 
 
291 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  0.0641056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1066  CBS domain-containing protein  29.41 
 
 
291 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  30.18 
 
 
287 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4066  protein of unknown function DUF21  30.8 
 
 
438 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.659836  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3474  CBS domain-containing protein  31.91 
 
 
291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.42  hitchhiker  0.00607831 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3902  CBS domain containing protein  33.33 
 
 
425 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0812  CBS:transporter associated  28.48 
 
 
292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1158  CBS domain-containing protein  37.39 
 
 
452 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1262  hypothetical protein  35.13 
 
 
533 aa  136  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  34.15 
 
 
439 aa  136  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3782  CBS domain-containing protein  31.99 
 
 
279 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.964712  normal  0.253 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  32.6 
 
 
425 aa  135  8e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2703  hypothetical protein  30.67 
 
 
285 aa  135  8e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.313937  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>