More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3920 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3920  PhoH-like protein  100 
 
 
348 aa  698    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0757  PhoH family protein  78.59 
 
 
353 aa  533  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.899998  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2155  PhoH family protein  78.88 
 
 
327 aa  525  1e-148  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0868609  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2067  PhoH family protein  77.95 
 
 
327 aa  517  1.0000000000000001e-145  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0286047  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0041  PhoH family protein  70.43 
 
 
351 aa  483  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000833124 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0438  phosphate starvation inducible protein  69.51 
 
 
357 aa  469  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.695996  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0030  PhoH family protein  69.66 
 
 
349 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.04719 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0018  PhoH family protein  67.87 
 
 
350 aa  464  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.28473 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1244  PhoH family protein  61.61 
 
 
370 aa  418  1e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0591  PhoH-like protein, phosphate starvation inducible  59.39 
 
 
344 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0047  putative phosphate starvation-inducible protein, PhoH-like protein  62.34 
 
 
345 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0241  PhoH-like protein  58.75 
 
 
351 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0469  PhoH-like protein  59.38 
 
 
352 aa  371  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.803585 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0451  PhoH family protein  60.31 
 
 
351 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3618  PhoH family protein  56.68 
 
 
342 aa  370  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0022  PhoH-like protein  59.34 
 
 
349 aa  369  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.232507  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0638  PhoH family protein  59.2 
 
 
338 aa  365  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.622943 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3400  PhoH family protein  58.64 
 
 
368 aa  366  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161796  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3181  PhoH family protein  60.79 
 
 
365 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0246823  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0015  PhoH-like protein  56.85 
 
 
349 aa  363  3e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.945712  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3529  PhoH family protein  58.02 
 
 
368 aa  361  8e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556211  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1811  PhoH family protein  58.36 
 
 
379 aa  361  1e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147763  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3205  PhoH family protein  58.02 
 
 
368 aa  360  2e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0234  PhoH family protein  57.61 
 
 
369 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.253584  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1354  PhoH family protein  58.77 
 
 
333 aa  355  3.9999999999999996e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0963523  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2896  PhoH family protein  54.98 
 
 
355 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.434704 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2388  PhoH family protein  55.59 
 
 
360 aa  352  7e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.156507  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1056  PhoH family protein  54.33 
 
 
341 aa  348  1e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.563658  normal  0.821458 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0069  PhoH family protein  51.38 
 
 
363 aa  342  5.999999999999999e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0287585 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3599  hypothetical protein  53.35 
 
 
346 aa  327  3e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3873  hypothetical protein  53.35 
 
 
339 aa  326  3e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3284  PhoH family protein  53.35 
 
 
346 aa  327  3e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3771  PhoH-like protein  54.63 
 
 
322 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1016  PhoH family protein  53.16 
 
 
337 aa  323  2e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0442383  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0981  PhoH-like protein  52.48 
 
 
348 aa  320  1.9999999999999998e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2063  PhoH-like protein  51.18 
 
 
335 aa  318  7.999999999999999e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.590057 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0700  PhoH-like protein  50.6 
 
 
373 aa  316  5e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.233967 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0188  PhoH-like protein  51.09 
 
 
338 aa  314  9.999999999999999e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1231  putative ATP-binding protein in pho regulon  51.07 
 
 
339 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000466652  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3692  PhoH family protein  52.9 
 
 
375 aa  311  1e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.316664  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0779  PhoH family protein  50.32 
 
 
331 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1225  PhoH family protein  53.33 
 
 
323 aa  306  5.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0422  PhoH family protein  53.04 
 
 
330 aa  305  6e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4067  PhoH family protein  53.54 
 
 
316 aa  305  7e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.579724 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0530  PHOH-like protein  53.4 
 
 
325 aa  305  8.000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159561  normal  0.089115 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3701  PhoH family protein  51.99 
 
 
335 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.933672  normal  0.818626 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1127  hypothetical protein  49.55 
 
 
340 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0452  PhoH-like protein  51.4 
 
 
331 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010717  normal  0.615683 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0492  PhoH family protein  51.99 
 
 
335 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.307318  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1353  PhoH family protein  52.23 
 
 
328 aa  303  4.0000000000000003e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000248045  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2705  PhoH-like protein  49.25 
 
 
319 aa  301  7.000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1071  PhoH-like protein  49.38 
 
 
333 aa  302  7.000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12330  hypothetical protein  48.93 
 
 
340 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4666  PhoH family protein  52.68 
 
 
316 aa  301  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3528  PhoH-like protein  50.79 
 
 
340 aa  299  4e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.959961  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1733  PhoH family protein  50.31 
 
 
326 aa  298  8e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0513  PhoH-like protein  49.69 
 
 
341 aa  298  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0633  PhoH family protein  50.16 
 
 
332 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4841  PhoH family protein  50.79 
 
 
332 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4095  PhoH-like protein  51.91 
 
 
337 aa  298  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3950  PhoH family protein  50.89 
 
 
374 aa  297  1e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.493956 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4787  PhoH family protein  50.48 
 
 
332 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0880837 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4241  PhoH family protein  52.5 
 
 
316 aa  297  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.220372 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0749  PhoH family protein  48.16 
 
 
327 aa  297  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00019197 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3780  PhoH family protein  51.59 
 
 
350 aa  297  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.150452 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2426  PhoH family protein  50.96 
 
 
320 aa  297  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000154292  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0597  PhoH-like protein  48.16 
 
 
340 aa  297  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4663  PhoH family protein  50.48 
 
 
332 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.337379  normal  0.248973 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0407  PhoH family protein  52.72 
 
 
330 aa  296  3e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0842646 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09060  PhoH-like protein  49.54 
 
 
336 aa  296  4e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.706372  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1663  PhoH family protein  49.68 
 
 
315 aa  296  4e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1629  PhoH family protein  49.68 
 
 
315 aa  296  4e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0242  PhoH family protein  47.83 
 
 
344 aa  296  5e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0509  PhoH family protein  50 
 
 
345 aa  295  6e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1558  PhoH family protein  51.27 
 
 
332 aa  295  7e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.400448  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0814  PhoH-like protein  52.4 
 
 
365 aa  295  1e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1436  PhoH family protein  51.6 
 
 
326 aa  294  2e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.384314 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1340  PhoH family protein  43.77 
 
 
328 aa  293  3e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0134835  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1138  PhoH family protein  50 
 
 
315 aa  293  4e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4805  PhoH-like protein  50.32 
 
 
340 aa  293  4e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0738  PhoH-like protein  50.16 
 
 
338 aa  292  5e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184449  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2163  PhoH family protein  50.8 
 
 
344 aa  292  5e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0763863  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4951  PhoH-like protein  50.16 
 
 
334 aa  292  6e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2230  PhoH family protein  50.66 
 
 
329 aa  291  8e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.148579  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3538  PhoH-like protein  50.48 
 
 
359 aa  291  9e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0411  PhoH family protein  48.69 
 
 
362 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.234067 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3330  PhoH family protein  48.53 
 
 
357 aa  290  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.128023 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1458  PhoH family protein  47.15 
 
 
341 aa  290  4e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1507  PhoH family protein  50 
 
 
345 aa  289  4e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.048361  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4346  PhoH-like protein  49.68 
 
 
340 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2910  PhoH family protein  49.5 
 
 
348 aa  289  5.0000000000000004e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0712  PhoH family protein  50.47 
 
 
347 aa  289  6e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242379  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3239  putative phoH-like protein  50.93 
 
 
338 aa  288  9e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3573  phoH family protein  47.72 
 
 
368 aa  288  1e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189544  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0629  putative PhoH-family protein  47.97 
 
 
359 aa  287  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0892  PhoH family protein  49.26 
 
 
359 aa  288  1e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.427486  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2295  PhoH family protein  49.07 
 
 
354 aa  288  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2739  PhoH family protein  50.96 
 
 
328 aa  288  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1024  PhoH family protein  50 
 
 
320 aa  287  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1183  PhoH family protein  51.12 
 
 
337 aa  287  2e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>