More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3782 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
258 aa  530  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.143319  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.83 
 
 
257 aa  346  3e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0919  putative oxidoreductase  64.73 
 
 
257 aa  342  4e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal  0.888241 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.18 
 
 
257 aa  318  7e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.242227  normal  0.57964 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.85 
 
 
257 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.91 
 
 
257 aa  305  5.0000000000000004e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00108701 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.54 
 
 
257 aa  285  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0293  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.54 
 
 
257 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.673149  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.43 
 
 
255 aa  280  2e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.649375  normal  0.270956 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.65 
 
 
256 aa  278  6e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.33 
 
 
257 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.563434  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2476  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.68 
 
 
239 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.47 
 
 
255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.58 
 
 
251 aa  261  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00162277  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1513  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  58.82 
 
 
277 aa  259  4e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.729699 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2695  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  58.43 
 
 
277 aa  256  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.43 
 
 
271 aa  256  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.83 
 
 
264 aa  238  9e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4175  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.36 
 
 
258 aa  231  8.000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49 
 
 
255 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.199732  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49 
 
 
255 aa  228  7e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49 
 
 
255 aa  228  7e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.150517  normal  0.215397 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.83 
 
 
254 aa  224  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496264  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2411  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.75 
 
 
255 aa  221  9e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.44 
 
 
254 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251484  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2363  Short-chain dehydrogenase/reductase  49.42 
 
 
254 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1024  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.81 
 
 
254 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.824888  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.41 
 
 
256 aa  218  6e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.872247 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29820  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  50 
 
 
261 aa  214  9.999999999999999e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3588  hypothetical protein  47.29 
 
 
254 aa  204  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00208776  normal  0.410255 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6105  short-chain dehydrogenase/reductase  45.35 
 
 
265 aa  203  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.69 
 
 
257 aa  202  5e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.34144  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1454  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.51 
 
 
256 aa  201  8e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.108685 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.7 
 
 
254 aa  201  8e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0615  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.08 
 
 
257 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000368197  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2397  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  42.41 
 
 
254 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0465114  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 
257 aa  190  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.35 
 
 
269 aa  186  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65696  D-arabinitol 2-dehydrogenase [ribulose forming] (ARDH)  40.59 
 
 
278 aa  185  5e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.28 
 
 
247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100219 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2037  short chain dehydrogenase  41.57 
 
 
262 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00988022  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05340  d-arabinitol 2-dehydrogenase, putative  39.1 
 
 
355 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.656485  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.7 
 
 
253 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.044107  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.91 
 
 
255 aa  181  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 
255 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3124  short chain dehydrogenase  41.96 
 
 
262 aa  178  7e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 
246 aa  174  9e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1662  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.91 
 
 
245 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  39.29 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6036  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 
254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0528417  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.63 
 
 
249 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4345  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.108758  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.564431  normal  0.112699 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
254 aa  172  5e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  38.49 
 
 
247 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22070  short chain dehydrogenase  42.02 
 
 
252 aa  171  7.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 
252 aa  171  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 
257 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 
257 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  39.84 
 
 
255 aa  170  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 
253 aa  170  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000282185  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11468  acetoin(diacetyl)reductase  39.76 
 
 
254 aa  170  2e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0328388  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.02 
 
 
257 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.600374  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2921  dehydrogenase  42.52 
 
 
261 aa  171  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.24 
 
 
247 aa  169  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12873  short chain dehydrogenase  40.64 
 
 
258 aa  169  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.85 
 
 
269 aa  169  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.24 
 
 
270 aa  169  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2060  short chain dehydrogenase  38.25 
 
 
257 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2106  short chain dehydrogenase  38.25 
 
 
257 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.077628 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2043  short chain dehydrogenase  38.25 
 
 
257 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3725  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.02 
 
 
269 aa  169  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725023  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 
246 aa  169  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2492  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  40.5 
 
 
245 aa  169  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2259  short chain dehydrogenase  40.47 
 
 
262 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0792422  normal  0.0451006 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0349  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.02 
 
 
257 aa  168  9e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.202503  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.52 
 
 
251 aa  167  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.062755  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86346  peroxisomal 2,4- dienoyl-CoA reductase and sorbitol utilization protein  40.23 
 
 
285 aa  167  1e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46750  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 
257 aa  167  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.658343  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.04 
 
 
263 aa  168  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.8 
 
 
246 aa  167  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.34 
 
 
263 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  39.84 
 
 
259 aa  167  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 
254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2394  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.23 
 
 
270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.883346  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.8 
 
 
246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
246 aa  166  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
255 aa  166  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0167  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.91 
 
 
245 aa  166  5e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.619009  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1785  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.67 
 
 
250 aa  165  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1283  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  37.65 
 
 
258 aa  165  5.9999999999999996e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000166105  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4062  short chain dehydrogenase  37.85 
 
 
257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171649  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
247 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1549  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.76 
 
 
256 aa  165  8e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.755021  normal  0.0732126 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3524  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
272 aa  165  8e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.382394  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  36.22 
 
 
259 aa  165  8e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  39.84 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>