More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3766 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3766  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
483 aa  972    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3961  succinate-semialdehyde dehydrogenase  44.4 
 
 
475 aa  412  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0708949  normal  0.0170918 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3971  Aldehyde Dehydrogenase  43.76 
 
 
477 aa  410  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4703  Aldehyde Dehydrogenase  44.4 
 
 
475 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.100697 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1053  succinate semialdehyde dehydrogenase  44.86 
 
 
478 aa  409  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2680  succinate-semialdehyde dehydrogenase  44.61 
 
 
476 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3638  succinate semialdehyde dehydrogenase  43.76 
 
 
475 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.344095  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2805  succinate semialdehyde dehydrogenase  44.19 
 
 
478 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3197  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  45.24 
 
 
476 aa  399  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.13725  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2714  aldehyde dehydrogenase  45.03 
 
 
482 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.767285  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2831  aldehyde dehydrogenase  44.03 
 
 
478 aa  397  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4520  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  43.67 
 
 
477 aa  395  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0406915  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4390  aldehyde dehydrogenase  45.05 
 
 
478 aa  395  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0086  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  43.76 
 
 
505 aa  394  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.688678  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1844  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  44.51 
 
 
478 aa  394  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1076  aldehyde dehydrogenase family protein  41.98 
 
 
480 aa  390  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1451  aldehyde dehydrogenase  44.61 
 
 
478 aa  391  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1965  aldehyde dehydrogenase  43.34 
 
 
476 aa  389  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3846  aldehyde dehydrogenase  43.34 
 
 
477 aa  387  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2413  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  44.19 
 
 
476 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.338088  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4206  aldehyde dehydrogenase  44.26 
 
 
477 aa  387  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.124463 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0856  aldehyde dehydrogenase  43.38 
 
 
479 aa  383  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6819  aldehyde dehydrogenase  42.62 
 
 
493 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.190703  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4576  Aldehyde Dehydrogenase  44.26 
 
 
477 aa  384  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0345994 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3920  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  44.19 
 
 
480 aa  385  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.179943  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3956  Aldehyde Dehydrogenase  42.86 
 
 
477 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0746  Aldehyde Dehydrogenase  44.3 
 
 
477 aa  380  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.28 
 
 
483 aa  379  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1597  succinate semialdehyde dehydrogenase  42.86 
 
 
496 aa  381  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.263811  normal  0.212402 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0727  Aldehyde Dehydrogenase  41.35 
 
 
481 aa  379  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5440  aldehyde dehydrogenase  41.63 
 
 
482 aa  378  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0711889 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3067  succinate semialdehyde dehydrogenase  44.4 
 
 
485 aa  375  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4298  aldehyde dehydrogenase  42.68 
 
 
481 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3958  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  42.26 
 
 
481 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4723  Aldehyde Dehydrogenase  43.83 
 
 
477 aa  377  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0425775 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4409  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  42.26 
 
 
481 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.745854  normal  0.407196 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0399  aldehyde dehydrogenase family protein  42.31 
 
 
476 aa  374  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0307  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.3 
 
 
483 aa  372  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1176  aldehyde dehydrogenase  43.88 
 
 
477 aa  374  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0771902  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2541  aldehyde dehydrogenase  40.38 
 
 
477 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.870804  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2203  Aldehyde Dehydrogenase  42.89 
 
 
481 aa  375  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6485  aldehyde dehydrogenase  42.44 
 
 
485 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6720  aldehyde dehydrogenase  42.44 
 
 
495 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25373  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0359  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  39.87 
 
 
483 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  39.87 
 
 
483 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0312  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  39.87 
 
 
483 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0295  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  39.87 
 
 
483 aa  369  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  39.87 
 
 
483 aa  369  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0327  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  39.87 
 
 
483 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2060  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  42.68 
 
 
481 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.166188 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1365  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  43.25 
 
 
479 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0205154 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4215  aldehyde dehydrogenase  42.68 
 
 
481 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3830  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  43.1 
 
 
481 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576477  normal  0.202881 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  39.87 
 
 
483 aa  367  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0356  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  39.87 
 
 
483 aa  368  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2828  Aldehyde Dehydrogenase  40.08 
 
 
483 aa  368  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  39.87 
 
 
483 aa  367  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1600  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  42.68 
 
 
481 aa  368  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397581  normal  0.596345 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5948  aldehyde dehydrogenase  42.47 
 
 
481 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0375443  normal  0.16852 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5717  aldehyde dehydrogenase  43.58 
 
 
480 aa  367  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.124179 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2116  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  42.86 
 
 
477 aa  368  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0796029  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5533  aldehyde dehydrogenase  43.13 
 
 
477 aa  365  1e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35176  normal  0.0235365 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0797  succinate semialdehyde dehydrogenase  41.77 
 
 
476 aa  365  1e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1323  succinate semialdehyde dehydrogenase  40.04 
 
 
485 aa  363  3e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.73252  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0380  Aldehyde Dehydrogenase  40.8 
 
 
485 aa  362  6e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  40.34 
 
 
480 aa  360  2e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0641  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  42.49 
 
 
478 aa  360  3e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0395  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.81 
 
 
475 aa  360  3e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0265  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.87 
 
 
484 aa  359  5e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0223  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  40.93 
 
 
476 aa  359  7e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  40 
 
 
500 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3739  aldehyde dehydrogenase  41.98 
 
 
487 aa  358  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.21 
 
 
500 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5660  succinate semialdehyde dehydrogenase  40.25 
 
 
484 aa  353  4e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  40.13 
 
 
479 aa  352  8e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3676  succinate semialdehyde dehydrogenase  39.42 
 
 
484 aa  351  1e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5743  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  45.84 
 
 
477 aa  351  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.18413 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2905  succinate semialdehyde dehydrogenase  44.47 
 
 
494 aa  351  2e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0263  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.21 
 
 
490 aa  350  3e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4451  succinate semialdehyde dehydrogenase  40.72 
 
 
493 aa  350  4e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0289  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.29 
 
 
490 aa  348  1e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6851  aldehyde dehydrogenase  41.21 
 
 
485 aa  348  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.635745  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0944  Aldehyde Dehydrogenase  42.49 
 
 
478 aa  347  3e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.566077  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03829  succinate-semialdehyde dehydrogenase (Eurofung)  39.57 
 
 
531 aa  346  5e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0486  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.38 
 
 
489 aa  346  5e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0422  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  39.38 
 
 
489 aa  346  5e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.4 
 
 
479 aa  346  6e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4416  aldehyde dehydrogenase  41.56 
 
 
477 aa  346  6e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2634  Aldehyde Dehydrogenase  38.95 
 
 
479 aa  345  8e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3193  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.13 
 
 
480 aa  345  1e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30180  succinate semialdehyde dehydrogenase  41.23 
 
 
487 aa  344  2e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.559382  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0028  succinate-semialdehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  41.36 
 
 
497 aa  344  2e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.19 
 
 
479 aa  344  2e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.28 
 
 
483 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2402  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.47 
 
 
490 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.341651 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.87 
 
 
482 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1755  succinate semialdehyde dehydrogenase  40.21 
 
 
497 aa  343  2.9999999999999997e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3748  succinate semialdehyde dehydrogenase  40.66 
 
 
484 aa  342  7e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2936  succinate semialdehyde dehydrogenase  41.09 
 
 
485 aa  342  7e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3067  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.63 
 
 
508 aa  341  1e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0865866  hitchhiker  0.00972731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>